MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfobacillus acidophilus TPY chromosome

Total Repeats: 320

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015757	GGTCC	2	10	10630	10639	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_015757	GCAAC	2	10	14043	14052	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_015757	AGGAG	2	10	16957	16966	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015757	CGTCC	2	10	80500	80509	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_015757	AAAAC	2	10	81205	81214	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015757	CCCAT	2	10	97723	97732	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
7	NC_015757	CTGGC	2	10	165852	165861	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_015757	TCGTG	2	10	166185	166194	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015757	AGGCG	2	10	168398	168407	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015757	CGCGT	2	10	169539	169548	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_015757	CTGGC	2	10	173432	173441	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_015757	TCGTG	2	10	173764	173773	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015757	AGGCG	2	10	175977	175986	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015757	CGCGT	2	10	177118	177127	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_015757	AGGGA	2	10	222494	222503	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015757	ACCCT	2	10	244916	244925	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_015757	GGGGA	2	10	249306	249315	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015757	CTGGC	2	10	268951	268960	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_015757	TCGTG	2	10	269283	269292	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015757	AGGCG	2	10	271582	271591	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015757	CGCGT	2	10	272723	272732	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_015757	CTGGC	2	10	276799	276808	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_015757	TCGTG	2	10	277132	277141	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015757	AGGCG	2	10	279430	279439	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015757	CGCGT	2	10	280571	280580	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_015757	GGAGG	2	10	310989	310998	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015757	CGGCA	2	10	312658	312667	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_015757	ACCCA	2	10	314640	314649	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NC_015757	GATAC	2	10	318487	318496	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015757	ATTGA	2	10	356364	356373	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015757	GACGA	2	10	375715	375724	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015757	ATACC	2	10	393984	393993	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_015757	CGGGA	2	10	401781	401790	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015757	CCGGT	2	10	403415	403424	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_015757	GCAAG	2	10	406952	406961	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_015757	GCGGG	2	10	413824	413833	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015757	GGTGT	2	10	434169	434178	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015757	AATTC	2	10	436513	436522	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015757	CGGGC	2	10	466698	466707	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_015757	GAGGC	2	10	469855	469864	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015757	GTTGT	2	10	471856	471865	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015757	TACCC	2	10	472960	472969	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
43	NC_015757	CTAGG	2	10	480149	480158	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_015757	GAAAG	2	10	483441	483450	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015757	GTGTT	2	10	486965	486974	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015757	CCGAC	2	10	487306	487315	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
47	NC_015757	GGCCT	2	10	487977	487986	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_015757	TCCGC	2	10	505835	505844	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
49	NC_015757	GGTTC	2	10	507833	507842	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_015757	CTTAT	2	10	512278	512287	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015757	CGGGC	2	10	516769	516778	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
52	NC_015757	CAACA	2	10	519484	519493	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_015757	TCCCT	2	10	529842	529851	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
54	NC_015757	GCCTA	2	10	563040	563049	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_015757	GTTCG	2	10	577020	577029	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015757	AATAA	2	10	580891	580900	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015757	GAACG	2	10	583638	583647	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015757	GGCCG	2	10	593927	593936	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
59	NC_015757	TTGAA	2	10	604218	604227	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015757	TATGG	2	10	604728	604737	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015757	TCCGT	2	10	610322	610331	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_015757	TCTCT	2	10	616410	616419	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_015757	TTGAG	2	10	617952	617961	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015757	TTCGG	2	10	631326	631335	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_015757	CCTTC	2	10	643518	643527	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
66	NC_015757	TCGTG	2	10	660713	660722	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_015757	CCCGA	2	10	660792	660801	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
68	NC_015757	GCATA	2	10	664729	664738	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_015757	AAGAC	2	10	680179	680188	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_015757	TGATA	2	10	693469	693478	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015757	GACAG	2	10	699747	699756	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_015757	GATGG	2	10	715511	715520	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015757	AGGGG	2	10	718583	718592	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015757	TACAA	2	10	719604	719613	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_015757	AAATC	2	10	733917	733926	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_015757	CTGGC	2	10	784499	784508	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_015757	TCGTG	2	10	784831	784840	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_015757	AGGCG	2	10	787045	787054	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
79	NC_015757	CGCGT	2	10	788186	788195	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_015757	GACAG	2	10	790042	790051	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_015757	GGTAC	2	10	824197	824206	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_015757	ACTCA	2	10	825794	825803	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_015757	CAGAA	2	10	830376	830385	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_015757	GATTC	2	10	834366	834375	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_015757	GACCG	2	10	888314	888323	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_015757	CGAGC	2	10	930659	930668	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_015757	GACAG	2	10	943309	943318	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_015757	GGGGC	2	10	946464	946473	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
89	NC_015757	GATTC	2	10	946634	946643	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_015757	CCAAA	2	10	996404	996413	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_015757	AGGAA	2	10	1002179	1002188	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015757	CGATT	2	10	1009831	1009840	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_015757	CGGCA	2	10	1031363	1031372	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_015757	TTGTC	2	10	1035781	1035790	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_015757	CTGTC	2	10	1076460	1076469	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_015757	GCGAA	2	10	1076613	1076622	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_015757	TGCCG	2	10	1077901	1077910	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_015757	CTGTG	2	10	1088766	1088775	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015757	TCTCC	2	10	1091596	1091605	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
100	NC_015757	ATCCG	2	10	1092916	1092925	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_015757	AAGGG	2	10	1095919	1095928	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015757	GTTCA	2	10	1109606	1109615	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_015757	ATGGT	2	10	1111224	1111233	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015757	TGGCC	2	10	1133403	1133412	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_015757	TGGTC	2	10	1160460	1160469	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_015757	CGGGC	2	10	1161560	1161569	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
107	NC_015757	AGGCC	2	10	1173105	1173114	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_015757	CAAAG	2	10	1173805	1173814	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_015757	TAGAA	2	10	1197616	1197625	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015757	ATAAA	2	10	1202483	1202492	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015757	GAATA	2	10	1225491	1225500	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015757	TACTC	2	10	1264954	1264963	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_015757	ATAAC	2	10	1265017	1265026	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_015757	GATAG	2	10	1282415	1282424	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015757	TAGAT	2	10	1317861	1317870	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015757	GCCTT	2	10	1333711	1333720	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_015757	AAATT	2	10	1344134	1344143	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015757	CGAAT	2	10	1359104	1359113	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_015757	GCCCC	2	10	1359119	1359128	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
120	NC_015757	TGTAG	2	10	1374808	1374817	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015757	CGGAG	2	10	1393115	1393124	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
122	NC_015757	ATTCC	2	10	1407932	1407941	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_015757	CATGG	2	10	1415849	1415858	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_015757	CGAGC	2	10	1445517	1445526	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
125	NC_015757	GGACG	2	10	1445794	1445803	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_015757	GGCCA	2	10	1457434	1457443	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_015757	GGATG	2	10	1459927	1459936	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015757	CTCTC	2	10	1492306	1492315	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
129	NC_015757	AAACG	2	10	1519504	1519513	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015757	CTTTT	2	10	1520023	1520032	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_015757	CATAT	2	10	1521783	1521792	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_015757	GAGGC	2	10	1538120	1538129	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_015757	TCCCC	2	10	1547589	1547598	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
134	NC_015757	AGGCA	2	10	1557997	1558006	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_015757	TTATC	2	10	1568178	1568187	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_015757	CATTT	2	10	1624010	1624019	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_015757	CGATT	2	10	1626937	1626946	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_015757	CGACC	2	10	1635667	1635676	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
139	NC_015757	ATCGT	2	10	1641816	1641825	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_015757	ACTAA	2	10	1650939	1650948	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_015757	GAAAA	2	10	1663019	1663028	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015757	TTCTA	2	10	1663136	1663145	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_015757	GCCCG	2	10	1681244	1681253	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
144	NC_015757	CCGCT	2	10	1685306	1685315	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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147	NC_015757	CTGGC	2	10	1749099	1749108	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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151	NC_015757	CGCCC	2	10	1832831	1832840	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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254	NC_015757	GCCAT	2	10	2831389	2831398	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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273	NC_015757	CAAAG	2	10	3003535	3003544	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
274	NC_015757	ATCAG	2	10	3011016	3011025	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
275	NC_015757	GCCGT	2	10	3012031	3012040	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
276	NC_015757	AGGGC	2	10	3018668	3018677	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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278	NC_015757	CGAGG	2	10	3029264	3029273	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
279	NC_015757	CTATG	2	10	3077314	3077323	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
280	NC_015757	TGATC	2	10	3121222	3121231	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
281	NC_015757	AGATG	2	10	3122875	3122884	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
282	NC_015757	AGCCG	2	10	3130228	3130237	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
283	NC_015757	CGGCT	2	10	3130621	3130630	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
284	NC_015757	TCACG	2	10	3130723	3130732	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
285	NC_015757	CGGTC	2	10	3130996	3131005	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
286	NC_015757	CATGA	2	10	3137538	3137547	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
287	NC_015757	ACCTC	2	10	3143780	3143789	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
288	NC_015757	AAATC	2	10	3160590	3160599	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
289	NC_015757	ATGCC	2	10	3162300	3162309	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
290	NC_015757	CGGAA	2	10	3235446	3235455	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
291	NC_015757	AGGCC	2	10	3235687	3235696	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
292	NC_015757	CACGT	2	10	3235817	3235826	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
293	NC_015757	CGTAC	2	10	3273128	3273137	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
294	NC_015757	CCCGC	2	10	3274146	3274155	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
295	NC_015757	AACCG	2	10	3279649	3279658	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
296	NC_015757	GATGT	2	10	3284982	3284991	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
297	NC_015757	CTTCG	2	10	3285092	3285101	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
298	NC_015757	CACCG	2	10	3285469	3285478	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
299	NC_015757	GACTC	2	10	3303661	3303670	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
300	NC_015757	AGAAA	2	10	3304287	3304296	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
301	NC_015757	CTGAC	2	10	3307614	3307623	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
302	NC_015757	GTTCC	2	10	3308014	3308023	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
303	NC_015757	TAGCC	2	10	3328221	3328230	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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305	NC_015757	CGAGC	2	10	3391616	3391625	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
306	NC_015757	GTGAT	2	10	3392913	3392922	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
307	NC_015757	CCCGT	2	10	3400173	3400182	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
308	NC_015757	CGAGT	2	10	3413188	3413197	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
309	NC_015757	CGAGT	2	10	3422738	3422747	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
310	NC_015757	CGTTC	2	10	3428362	3428371	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
311	NC_015757	TGTTT	2	10	3458314	3458323	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
312	NC_015757	AACCT	2	10	3460809	3460818	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
313	NC_015757	GTGAG	2	10	3461101	3461110	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
314	NC_015757	GGTAA	2	10	3470037	3470046	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
315	NC_015757	CCTTC	2	10	3474702	3474711	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
316	NC_015757	ACTCA	2	10	3475711	3475720	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
317	NC_015757	TGGTG	2	10	3476773	3476782	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
318	NC_015757	AATTG	2	10	3487851	3487860	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
319	NC_015757	GAAAA	2	10	3531802	3531811	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
320	NC_015757	GAATC	2	10	3551197	3551206	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.