MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfobacillus acidophilus TPY chromosome

Total Repeats: 1068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015757	ACGC	2	8	10064	10071	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015757	TTGC	2	8	13289	13296	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015757	CTCC	2	8	13378	13385	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_015757	TGAA	2	8	14070	14077	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015757	TGGA	2	8	25703	25710	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015757	ATGA	2	8	27342	27349	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015757	CCAC	2	8	27520	27527	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_015757	CTCA	2	8	40462	40469	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015757	TCAT	2	8	41845	41852	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015757	AATC	2	8	42189	42196	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015757	TCCT	2	8	48517	48524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015757	AAGC	2	8	50150	50157	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015757	ATTG	2	8	50206	50213	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015757	CTTA	2	8	50711	50718	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015757	CCTC	2	8	52261	52268	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_015757	GGAA	2	8	61902	61909	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015757	TCGA	2	8	77202	77209	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015757	GAGG	2	8	77400	77407	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015757	TTTA	2	8	79880	79887	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015757	CGGC	2	8	80334	80341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015757	ATCC	2	8	80629	80636	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015757	TATT	2	8	80841	80848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015757	TTGG	2	8	80934	80941	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015757	TTTG	2	8	81129	81136	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015757	AATT	2	8	81587	81594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015757	TAAA	2	8	81823	81830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015757	CGTT	2	8	96990	96997	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015757	TCAT	2	8	109844	109851	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015757	ATAA	2	8	109941	109948	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015757	GTTC	2	8	127844	127851	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015757	ACCG	2	8	133088	133095	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015757	GGGA	2	8	136457	136464	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015757	TTGG	2	8	139348	139355	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015757	CACG	2	8	140785	140792	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015757	TCGA	2	8	146705	146712	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015757	CGAG	2	8	147505	147512	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015757	TCCT	2	8	157315	157322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015757	GTTA	2	8	157342	157349	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015757	CCCG	2	8	157409	157416	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_015757	GACG	2	8	157662	157669	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015757	TTAT	2	8	162537	162544	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015757	AATC	2	8	162840	162847	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015757	CACC	2	8	162920	162927	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
44	NC_015757	GTGA	2	8	165522	165529	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015757	CTGT	2	8	165554	165561	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015757	TCGG	2	8	166251	166258	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015757	CGGT	2	8	166552	166559	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015757	GGAC	2	8	166898	166905	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015757	GAGT	2	8	166989	166996	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015757	GATC	2	8	167471	167478	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015757	GTCG	2	8	167731	167738	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015757	GGCG	2	8	168017	168024	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015757	GGGA	2	8	169474	169481	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015757	TCCG	2	8	169529	169536	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015757	TCGG	2	8	169630	169637	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015757	CCCG	2	8	169743	169750	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_015757	GTGA	2	8	173103	173110	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015757	CTGT	2	8	173135	173142	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015757	TCGG	2	8	173830	173837	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015757	CGGT	2	8	174131	174138	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015757	GGAC	2	8	174477	174484	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015757	GAGT	2	8	174568	174575	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015757	GATC	2	8	175050	175057	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015757	GTCG	2	8	175310	175317	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015757	GGCG	2	8	175596	175603	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015757	GGGA	2	8	177053	177060	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015757	TCCG	2	8	177108	177115	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015757	TCGG	2	8	177209	177216	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015757	CCCG	2	8	177322	177329	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_015757	GGAC	2	8	181370	181377	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015757	TTCG	2	8	181395	181402	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015757	TCGG	2	8	185825	185832	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015757	AGGA	2	8	192512	192519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015757	AAGA	2	8	192559	192566	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015757	GCTA	2	8	200981	200988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015757	GTTC	2	8	201965	201972	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015757	AAAG	2	8	206707	206714	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015757	TCCG	2	8	211836	211843	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015757	ATTT	2	8	219025	219032	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015757	CCTG	2	8	219076	219083	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015757	ATAA	2	8	219177	219184	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015757	GAGG	2	8	226389	226396	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015757	GGCC	2	8	256642	256649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015757	AAAG	2	8	265233	265240	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015757	GTGA	2	8	268622	268629	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015757	CTGT	2	8	268654	268661	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015757	TCGG	2	8	269349	269356	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015757	CGGT	2	8	269650	269657	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015757	GGAC	2	8	270082	270089	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015757	GAGT	2	8	270173	270180	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015757	GATC	2	8	270655	270662	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015757	GTCG	2	8	270915	270922	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015757	GGCG	2	8	271201	271208	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015757	GGGA	2	8	272658	272665	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015757	TCCG	2	8	272713	272720	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015757	TCGG	2	8	272814	272821	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015757	CCCG	2	8	272927	272934	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_015757	GACG	2	8	274643	274650	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015757	CCTT	2	8	274790	274797	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015757	TACA	2	8	275030	275037	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015757	GTCC	2	8	275151	275158	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015757	GTGA	2	8	276470	276477	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015757	CTGT	2	8	276502	276509	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015757	TCGG	2	8	277198	277205	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015757	CGGT	2	8	277498	277505	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015757	GGAC	2	8	277930	277937	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015757	GAGT	2	8	278021	278028	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015757	GATC	2	8	278503	278510	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015757	GTCG	2	8	278763	278770	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015757	GGCG	2	8	279049	279056	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015757	GGGA	2	8	280506	280513	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015757	TCCG	2	8	280561	280568	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015757	TCGG	2	8	280662	280669	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015757	CCCG	2	8	280775	280782	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
115	NC_015757	CGGT	2	8	291379	291386	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015757	TGAG	2	8	295774	295781	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015757	CAAC	2	8	303678	303685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015757	TTGA	2	8	306092	306099	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015757	GGGC	2	8	309676	309683	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015757	CCTG	2	8	314386	314393	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015757	AGGA	2	8	328142	328149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015757	CGTA	2	8	333388	333395	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015757	AAAG	2	8	334235	334242	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015757	AAGG	2	8	338002	338009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015757	GCTC	2	8	340206	340213	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015757	GAGG	2	8	340239	340246	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015757	ACGG	2	8	343621	343628	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_015757	AGGA	2	8	344508	344515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015757	GAAA	2	8	346175	346182	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015757	AGTT	2	8	348287	348294	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015757	AAAG	2	8	350213	350220	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015757	TGAT	2	8	356269	356276	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015757	GTCG	2	8	356676	356683	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015757	CGGT	2	8	373087	373094	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_015757	CTTT	2	8	379672	379679	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015757	AGAC	2	8	381348	381355	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015757	AGGA	2	8	381364	381371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015757	CGTC	2	8	395079	395086	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015757	CTGA	2	8	396086	396093	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015757	CAAT	2	8	396165	396172	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015757	AAGT	2	8	398474	398481	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015757	CCGG	2	8	398486	398493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_015757	GAAT	2	8	401661	401668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015757	AGCT	2	8	403430	403437	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015757	CGCA	2	8	409133	409140	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_015757	GGAT	2	8	414229	414236	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015757	CTGA	2	8	421301	421308	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015757	GTTT	2	8	423694	423701	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015757	CCGC	2	8	423800	423807	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
150	NC_015757	GACG	2	8	423829	423836	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_015757	ATTA	2	8	423986	423993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_015757	GCTC	2	8	1649965	1649972	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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500	NC_015757	ATTG	2	8	1651045	1651052	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

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