MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015732	CCTT	2	8	8663	8670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015732	AAGG	2	8	9662	9669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015732	AGGC	2	8	37746	37753	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015732	TAAA	2	8	55382	55389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015732	TGAA	2	8	56883	56890	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015732	GTAC	2	8	62979	62986	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015732	ACAA	2	8	64305	64312	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015732	GTAA	2	8	64334	64341	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015732	AGCG	2	8	64500	64507	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015732	AAAG	2	8	64616	64623	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015732	TTTA	2	8	78101	78108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015732	TTGT	2	8	78138	78145	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015732	AATA	2	8	79060	79067	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015732	AAGG	2	8	89421	89428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015732	TTGC	2	8	95298	95305	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015732	ACAT	2	8	95473	95480	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015732	AATT	2	8	98420	98427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015732	GATA	2	8	98886	98893	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015732	ATAG	2	8	117685	117692	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015732	GACT	2	8	117733	117740	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015732	TTGA	2	8	117839	117846	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015732	TGAT	2	8	118524	118531	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015732	AATA	2	8	119258	119265	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015732	CAAC	2	8	119275	119282	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015732	CAGT	2	8	120748	120755	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015732	ACCA	2	8	120934	120941	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015732	AAAT	2	8	121088	121095	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015732	TTGA	2	8	121648	121655	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015732	CGAC	2	8	121673	121680	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015732	CGTC	2	8	122285	122292	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015732	TTTC	2	8	122890	122897	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015732	CCCG	2	8	123116	123123	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_015732	AATG	2	8	129106	129113	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015732	TCGT	2	8	129905	129912	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015732	TCCC	2	8	132246	132253	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_015732	CCCT	2	8	132303	132310	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_015732	AAAT	2	8	138795	138802	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015732	TATT	2	8	139979	139986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015732	GAAT	2	8	146646	146653	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015732	ACAA	2	8	161212	161219	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015732	TCAG	2	8	173632	173639	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015732	TTCT	2	8	188224	188231	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015732	TGGA	2	8	188451	188458	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015732	TAAA	2	8	195402	195409	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015732	ACAG	2	8	204593	204600	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015732	CGGT	2	8	212525	212532	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015732	CTTC	2	8	232170	232177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015732	TAAA	2	8	238554	238561	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015732	GCCC	2	8	239546	239553	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_015732	CGGG	2	8	239562	239569	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015732	GGAT	2	8	269275	269282	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015732	GTAT	2	8	283799	283806	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015732	TATT	2	8	288622	288629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015732	GGCT	2	8	293083	293090	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015732	AACT	2	8	296926	296933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015732	AATG	2	8	300478	300485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015732	CTGT	2	8	308349	308356	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015732	ACTT	2	8	308458	308465	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015732	CCCG	2	8	308645	308652	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_015732	AAGG	2	8	315009	315016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015732	ATAA	2	8	315054	315061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015732	AATA	2	8	317590	317597	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015732	TAAT	2	8	320294	320301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015732	TAAT	2	8	322682	322689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015732	AACA	2	8	322740	322747	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015732	ATTA	2	8	322751	322758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015732	TGTT	2	8	322781	322788	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015732	TCGA	2	8	327942	327949	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015732	TTAA	2	8	338061	338068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015732	GGAT	2	8	358375	358382	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015732	ATTA	2	8	361325	361332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015732	CATG	2	8	370378	370385	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015732	CTAT	2	8	381790	381797	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015732	TGGG	2	8	382075	382082	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015732	TATC	2	8	382466	382473	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015732	ATCA	2	8	383139	383146	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015732	CAAT	2	8	383257	383264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015732	GGAA	2	8	384040	384047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015732	TCCC	2	8	390366	390373	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_015732	TGGA	2	8	392437	392444	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015732	CAAC	2	8	396736	396743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015732	TGTT	2	8	404076	404083	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015732	CCTT	2	8	409126	409133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015732	TAAA	2	8	453144	453151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015732	CCTA	2	8	454431	454438	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015732	TTAT	2	8	467144	467151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015732	AGAT	2	8	467842	467849	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015732	GTTT	2	8	474933	474940	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015732	TATC	2	8	481793	481800	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015732	ATAC	2	8	484089	484096	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015732	GAAC	2	8	484466	484473	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015732	AAAG	2	8	484637	484644	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015732	GGGA	2	8	484898	484905	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015732	TGAC	2	8	485185	485192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015732	AAGG	2	8	486176	486183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015732	ATAG	2	8	486523	486530	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015732	GGCC	2	8	486736	486743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015732	AGCG	2	8	487024	487031	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015732	AAAC	2	8	487222	487229	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015732	TGGA	2	8	487301	487308	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015732	CCAA	2	8	487335	487342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015732	GGAG	2	8	487666	487673	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015732	CCGG	2	8	487875	487882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015732	GATG	2	8	489056	489063	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015732	ATAC	2	8	489402	489409	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015732	AGTA	2	8	489446	489453	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015732	GTAG	2	8	489556	489563	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015732	GAAC	2	8	490013	490020	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015732	AAAG	2	8	490184	490191	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015732	GGGA	2	8	490445	490452	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015732	TGAC	2	8	490732	490739	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015732	ATAG	2	8	492316	492323	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015732	GGCC	2	8	492529	492536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015732	AGCG	2	8	492817	492824	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015732	AAAC	2	8	493015	493022	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015732	TGGA	2	8	493094	493101	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015732	CCAA	2	8	493128	493135	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015732	GGAG	2	8	493459	493466	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015732	CCGG	2	8	493668	493675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015732	GATG	2	8	494849	494856	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015732	ATAC	2	8	495195	495202	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015732	AGTA	2	8	495239	495246	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015732	GTAG	2	8	495349	495356	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015732	AAGA	2	8	495745	495752	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015732	TGTA	2	8	500410	500417	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015732	TTAA	2	8	502113	502120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015732	TAGA	2	8	510265	510272	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015732	GCAA	2	8	515188	515195	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_015732	ATTA	2	8	515226	515233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015732	TAAT	2	8	515305	515312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015732	TTTA	2	8	536221	536228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015732	ACTT	2	8	548869	548876	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015732	AAAT	2	8	550346	550353	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015732	TGAT	2	8	580123	580130	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015732	TAAA	2	8	600423	600430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015732	AATG	2	8	606802	606809	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015732	TGTA	2	8	611616	611623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015732	TATT	2	8	631627	631634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015732	TTTC	2	8	642905	642912	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015732	TGAA	2	8	642947	642954	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015732	GATG	2	8	644788	644795	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015732	CTGA	2	8	644981	644988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_015732	GATC	2	8	645431	645438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015732	TGTC	2	8	645791	645798	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015732	AATA	2	8	658215	658222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015732	TGAA	2	8	660611	660618	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015732	TCCC	2	8	663684	663691	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
148	NC_015732	AACT	2	8	663734	663741	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_015732	TTTC	2	8	663822	663829	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015732	GATA	2	8	663909	663916	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015732	CCGG	2	8	671031	671038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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467	NC_015732	TAAG	2	8	2331105	2331112	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
468	NC_015732	TTAT	2	8	2333793	2333800	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_015732	ATTT	2	8	2335935	2335942	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_015732	GTAA	2	8	2350697	2350704	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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484	NC_015732	AATC	2	8	2363368	2363375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
485	NC_015732	ATAC	2	8	2365608	2365615	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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489	NC_015732	AGGA	2	8	2392791	2392798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
490	NC_015732	CTAT	2	8	2396205	2396212	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_015732	ACAG	2	8	2451557	2451564	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

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