MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 6076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015732	ACCC	2	8	2026859	2026866	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3502	NC_015732	AT	3	6	2026889	2026894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_015732	T	6	6	2026918	2026923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_015732	CCG	2	6	2026943	2026948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_015732	CAC	2	6	2026958	2026963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3506	NC_015732	GAA	2	6	2026979	2026984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_015732	TGAT	2	8	2027017	2027024	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_015732	GGT	2	6	2027101	2027106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_015732	TTG	2	6	2027121	2027126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_015732	GCA	4	12	2027149	2027160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_015732	T	7	7	2027176	2027182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_015732	CATTT	2	10	2027223	2027232	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3513	NC_015732	CTTCC	2	10	2027267	2027276	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3514	NC_015732	CAA	2	6	2027285	2027290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_015732	TTA	2	6	2027318	2027323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_015732	AAT	2	6	2027379	2027384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_015732	GTG	2	6	2027398	2027403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_015732	CAT	2	6	2027423	2027428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_015732	GCA	2	6	2027477	2027482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_015732	TAAAT	2	10	2027489	2027498	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_015732	TAC	2	6	2027560	2027565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_015732	AGG	2	6	2027643	2027648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_015732	AAT	2	6	2027665	2027670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_015732	AGA	2	6	2027821	2027826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_015732	GAT	2	6	2027846	2027851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_015732	ATA	2	6	2027881	2027886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_015732	AGA	2	6	2027899	2027904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_015732	GA	3	6	2027959	2027964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_015732	TCT	2	6	2027975	2027980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_015732	ACC	2	6	2028202	2028207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3531	NC_015732	AGG	2	6	2028215	2028220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_015732	GAAG	2	8	2028288	2028295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_015732	AAT	2	6	2028315	2028320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_015732	TAC	2	6	2028375	2028380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_015732	AATC	2	8	2028408	2028415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3536	NC_015732	ACA	2	6	2028438	2028443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_015732	TTG	2	6	2028561	2028566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_015732	CAT	2	6	2028600	2028605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_015732	GGT	2	6	2028619	2028624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_015732	T	6	6	2028630	2028635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_015732	GCCA	2	8	2028716	2028723	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3542	NC_015732	CTT	2	6	2028724	2028729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_015732	TCAA	2	8	2028752	2028759	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3544	NC_015732	ATA	2	6	2028769	2028774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_015732	CATAT	2	10	2028785	2028794	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3546	NC_015732	TAAAA	2	10	2028797	2028806	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_015732	GTTT	2	8	2028840	2028847	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_015732	AGTA	2	8	2028848	2028855	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_015732	G	7	7	2031498	2031504	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_015732	GGGT	2	8	2031506	2031513	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_015732	AGG	2	6	2031540	2031545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_015732	CAG	2	6	2031566	2031571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_015732	CTTG	2	8	2031611	2031618	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3554	NC_015732	AT	3	6	2031622	2031627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_015732	TCC	2	6	2033547	2033552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3556	NC_015732	T	6	6	2033612	2033617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_015732	ATA	2	6	2033635	2033640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_015732	ACA	2	6	2033648	2033653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_015732	A	6	6	2033658	2033663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_015732	AT	3	6	2033733	2033738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_015732	GCGA	2	8	2035413	2035420	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3562	NC_015732	A	6	6	2039798	2039803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_015732	ATC	2	6	2043118	2043123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_015732	T	6	6	2043133	2043138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_015732	CAA	2	6	2043148	2043153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_015732	TAA	2	6	2043160	2043165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_015732	CGCCGG	2	12	2044021	2044032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3568	NC_015732	ACC	2	6	2044082	2044087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3569	NC_015732	AGA	2	6	2044092	2044097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_015732	GGA	2	6	2044426	2044431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_015732	GTA	2	6	2044765	2044770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_015732	GGC	3	9	2045269	2045277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_015732	CCCCG	2	10	2045382	2045391	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3574	NC_015732	CGG	2	6	2045436	2045441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_015732	TCTT	2	8	2045460	2045467	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3576	NC_015732	TGA	2	6	2045530	2045535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_015732	CAT	2	6	2045605	2045610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_015732	ATT	2	6	2045627	2045632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_015732	AGG	2	6	2045975	2045980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_015732	ACC	2	6	2046306	2046311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3581	NC_015732	TAT	2	6	2046312	2046317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_015732	CGG	2	6	2046341	2046346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_015732	GAA	2	6	2046369	2046374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_015732	GTT	2	6	2046395	2046400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_015732	CTTTTA	2	12	2046413	2046424	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3586	NC_015732	CTAA	2	8	2046464	2046471	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3587	NC_015732	ATC	2	6	2052633	2052638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_015732	ATT	2	6	2052649	2052654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_015732	A	6	6	2052698	2052703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_015732	A	8	8	2052731	2052738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_015732	AGG	2	6	2052752	2052757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_015732	CTA	2	6	2052812	2052817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_015732	ACA	2	6	2052824	2052829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_015732	A	7	7	2052872	2052878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_015732	TAT	2	6	2057721	2057726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_015732	TAT	2	6	2057776	2057781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_015732	A	6	6	2057784	2057789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_015732	AGG	2	6	2057883	2057888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_015732	GGA	2	6	2058950	2058955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_015732	TCC	2	6	2061560	2061565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_015732	TAAA	2	8	2061579	2061586	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_015732	ATA	2	6	2061589	2061594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_015732	TCT	2	6	2061599	2061604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_015732	GCAG	2	8	2061703	2061710	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3605	NC_015732	T	6	6	2061766	2061771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_015732	TA	3	6	2061835	2061840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_015732	TTGC	2	8	2061890	2061897	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3608	NC_015732	ACG	2	6	2061903	2061908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3610	NC_015732	TTTA	2	8	2061971	2061978	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_015732	TTG	2	6	2062191	2062196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_015732	GAA	2	6	2062247	2062252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_015732	CAG	2	6	2062311	2062316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_015732	CA	3	6	2062364	2062369	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3615	NC_015732	CTCAT	2	10	2062387	2062396	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3616	NC_015732	A	8	8	2062436	2062443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_015732	CAAA	2	8	2062448	2062455	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3618	NC_015732	CTTT	2	8	2062498	2062505	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3619	NC_015732	AAC	2	6	2062550	2062555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3621	NC_015732	TAT	2	6	2062703	2062708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_015732	ACT	2	6	2062750	2062755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_015732	ATG	2	6	2062785	2062790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_015732	AAC	2	6	2062836	2062841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_015732	AAATAT	2	12	2062851	2062862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_015732	ATT	2	6	2062880	2062885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_015732	TATT	2	8	2062914	2062921	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_015732	T	6	6	2062932	2062937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_015732	T	7	7	2062991	2062997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_015732	A	6	6	2063029	2063034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_015732	ATG	2	6	2063070	2063075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_015732	TGCAA	2	10	2063098	2063107	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3633	NC_015732	TGG	2	6	2063152	2063157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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