MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 6076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015732	AGG	2	6	493277	493282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_015732	AGC	2	6	493293	493298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_015732	AGT	2	6	493335	493340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015732	CGA	2	6	493432	493437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_015732	GGAG	2	8	493459	493466	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015732	AG	3	6	493471	493476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_015732	CCG	2	6	493519	493524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_015732	CCGG	2	8	493668	493675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_015732	TGAGG	2	10	493735	493744	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_015732	AAT	2	6	493801	493806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_015732	ACCGT	2	10	493829	493838	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1012	NC_015732	GA	3	6	493880	493885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_015732	CGG	2	6	494124	494129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_015732	TG	3	6	494373	494378	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_015732	ACC	2	6	494395	494400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_015732	GGC	2	6	494559	494564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_015732	GATG	2	8	494849	494856	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015732	GAG	2	6	494862	494867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_015732	TGT	2	6	494915	494920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_015732	CCT	2	6	495025	495030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_015732	CTT	2	6	495148	495153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_015732	CGA	2	6	495156	495161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_015732	ATAC	2	8	495195	495202	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1024	NC_015732	AGTA	2	8	495239	495246	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_015732	GAT	2	6	495319	495324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_015732	GTAG	2	8	495349	495356	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_015732	T	8	8	495366	495373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_015732	CTT	2	6	495386	495391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_015732	TCC	2	6	495692	495697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_015732	AG	3	6	495732	495737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_015732	AAGA	2	8	495745	495752	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015732	GAA	2	6	495760	495765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015732	TTC	2	6	495784	495789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_015732	ATT	2	6	497381	497386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015732	T	6	6	497385	497390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_015732	A	6	6	497393	497398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_015732	AAT	2	6	497401	497406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_015732	CAA	2	6	497428	497433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_015732	A	6	6	497432	497437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_015732	A	6	6	497493	497498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_015732	TAT	2	6	500346	500351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_015732	TGTA	2	8	500410	500417	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_015732	TGT	2	6	500437	500442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_015732	CTA	2	6	500484	500489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_015732	TA	3	6	500488	500493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_015732	GT	3	6	500546	500551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_015732	TTAA	2	8	502113	502120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_015732	TAT	2	6	502128	502133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_015732	GCT	2	6	507789	507794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_015732	T	6	6	507852	507857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_015732	TAGA	2	8	510265	510272	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_015732	AAG	2	6	510300	510305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_015732	TA	3	6	510376	510381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_015732	GGC	2	6	512057	512062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_015732	CTG	2	6	512097	512102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_015732	TAC	2	6	512179	512184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_015732	GGC	2	6	514180	514185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_015732	GGA	2	6	514879	514884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_015732	GCAA	2	8	515188	515195	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_015732	TAT	2	6	515216	515221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_015732	ATTA	2	8	515226	515233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_015732	TA	3	6	515290	515295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_015732	TAAT	2	8	515305	515312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015732	AGG	2	6	516062	516067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_015732	ATT	2	6	522427	522432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_015732	CG	3	6	522460	522465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_015732	A	6	6	524048	524053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_015732	CGTTG	2	10	524072	524081	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1069	NC_015732	CGT	2	6	525526	525531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_015732	CCT	2	6	526089	526094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_015732	AT	3	6	526877	526882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_015732	AAG	2	6	526926	526931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015732	TAA	2	6	527545	527550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015732	CTA	2	6	527899	527904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_015732	A	6	6	527920	527925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_015732	TCC	2	6	536012	536017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_015732	TTC	2	6	536023	536028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_015732	CGG	2	6	536063	536068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_015732	GCC	2	6	536196	536201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_015732	TTTA	2	8	536221	536228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_015732	GCC	2	6	536232	536237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_015732	AAT	2	6	540928	540933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_015732	CTC	2	6	542752	542757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_015732	CTG	2	6	543591	543596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_015732	AGG	2	6	543628	543633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_015732	A	6	6	544860	544865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_015732	T	7	7	544896	544902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_015732	TAA	2	6	546073	546078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_015732	GAA	2	6	546096	546101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_015732	TTG	2	6	546150	546155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_015732	AAT	2	6	546180	546185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_015732	T	7	7	548279	548285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015732	AAT	2	6	548309	548314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_015732	T	6	6	548396	548401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_015732	CGG	2	6	548463	548468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_015732	ATT	2	6	548747	548752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_015732	CAT	2	6	548820	548825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_015732	AAGAT	2	10	548843	548852	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_015732	TGA	2	6	548862	548867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_015732	ACTT	2	8	548869	548876	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_015732	GTG	2	6	548918	548923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_015732	GT	3	6	548932	548937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_015732	CAT	2	6	548970	548975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_015732	GAAGT	2	10	549004	549013	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_015732	AAAT	2	8	550346	550353	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015732	AAT	2	6	550455	550460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_015732	TGA	2	6	550475	550480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_015732	GAA	2	6	550948	550953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_015732	CGC	2	6	551015	551020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_015732	CCT	2	6	551115	551120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_015732	GAG	2	6	551146	551151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_015732	CCG	2	6	551187	551192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_015732	CGA	2	6	551642	551647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_015732	GTT	2	6	556615	556620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_015732	TTG	2	6	557708	557713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_015732	TTG	2	6	557738	557743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_015732	GGT	2	6	568269	568274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_015732	A	6	6	575037	575042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_015732	TA	3	6	575311	575316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_015732	T	6	6	575329	575334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015732	TAT	2	6	575360	575365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_015732	AGA	2	6	575377	575382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_015732	A	6	6	575428	575433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_015732	TAA	2	6	575439	575444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_015732	ATA	2	6	575607	575612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_015732	AGG	2	6	575621	575626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_015732	ATG	2	6	577387	577392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_015732	A	6	6	577413	577418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_015732	TAT	2	6	577424	577429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_015732	AT	3	6	577491	577496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_015732	CGT	2	6	577533	577538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_015732	TCC	2	6	577556	577561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_015732	TCA	2	6	579713	579718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_015732	ACT	2	6	579741	579746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_015732	AT	3	6	579880	579885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_015732	CTT	2	6	579953	579958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_015732	TATCGA	2	12	579989	580000	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1154	NC_015732	T	7	7	591952	591958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1265	NC_015732	A	6	6	655047	655052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1266	NC_015732	AATA	2	8	658215	658222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1267	NC_015732	TAT	2	6	658253	658258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1269	NC_015732	TGC	2	6	660489	660494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1271	NC_015732	TGAA	2	8	660611	660618	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1411	NC_015732	AGCG	2	8	708218	708225	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1412	NC_015732	TGC	2	6	708243	708248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1415	NC_015732	TGC	2	6	709403	709408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1432	NC_015732	TA	3	6	716513	716518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1443	NC_015732	A	8	8	721035	721042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_015732	CAG	2	6	721064	721069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1449	NC_015732	CCT	2	6	724244	724249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1462	NC_015732	A	6	6	740823	740828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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