MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 6076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015732	CCCG	2	8	308645	308652	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
502	NC_015732	TGC	2	6	308717	308722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_015732	ACC	2	6	308730	308735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_015732	CAA	2	6	308789	308794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_015732	CTTTC	2	10	308815	308824	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
506	NC_015732	TC	3	6	308823	308828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
507	NC_015732	AGA	2	6	308861	308866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015732	ACC	2	6	308929	308934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_015732	TA	4	8	308999	309006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015732	T	6	6	310111	310116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_015732	A	6	6	310130	310135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015732	CAG	2	6	310207	310212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_015732	A	6	6	310218	310223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_015732	GCC	2	6	310224	310229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_015732	GGC	2	6	310234	310239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_015732	T	6	6	310240	310245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_015732	GCC	2	6	310280	310285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_015732	CAG	2	6	310382	310387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_015732	A	7	7	310393	310399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_015732	GCC	2	6	310400	310405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_015732	GGC	2	6	310410	310415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_015732	T	6	6	310416	310421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_015732	CTG	2	6	310434	310439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_015732	GCC	2	6	310493	310498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_015732	AAG	2	6	310998	311003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_015732	AAG	2	6	311026	311031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015732	GAA	2	6	311038	311043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015732	A	6	6	312570	312575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015732	TA	3	6	314850	314855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015732	CTG	2	6	314917	314922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_015732	T	6	6	314923	314928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015732	GGC	2	6	314934	314939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_015732	GGC	2	6	314971	314976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_015732	TCC	2	6	314992	314997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_015732	AAGG	2	8	315009	315016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015732	AAT	2	6	315027	315032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015732	ATAA	2	8	315054	315061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_015732	GTC	2	6	315125	315130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_015732	GAG	2	6	315170	315175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_015732	GTT	2	6	316675	316680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015732	TAT	2	6	317557	317562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_015732	TAT	2	6	317568	317573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_015732	AATA	2	8	317590	317597	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015732	TAAT	2	8	320294	320301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_015732	GT	3	6	321101	321106	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015732	TA	4	8	322628	322635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015732	TAAT	2	8	322682	322689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_015732	TAG	2	6	322709	322714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015732	AACA	2	8	322740	322747	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
550	NC_015732	ATTA	2	8	322751	322758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015732	CA	3	6	322770	322775	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_015732	TGTT	2	8	322781	322788	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
553	NC_015732	GTT	2	6	322816	322821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015732	TTG	2	6	325349	325354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015732	TAA	2	6	327839	327844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015732	TCGA	2	8	327942	327949	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
557	NC_015732	CCT	2	6	327988	327993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_015732	AT	3	6	328037	328042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_015732	TCA	2	6	330045	330050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_015732	TA	3	6	330076	330081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_015732	A	7	7	330081	330087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015732	TAG	2	6	337840	337845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_015732	TAA	2	6	337891	337896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015732	TAT	2	6	338041	338046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015732	ATT	2	6	338054	338059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_015732	TTAA	2	8	338061	338068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015732	CCT	2	6	346611	346616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_015732	TA	3	6	346620	346625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015732	TTA	2	6	346698	346703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015732	AT	3	6	346733	346738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_015732	TGA	2	6	347243	347248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_015732	T	7	7	348181	348187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_015732	GGA	2	6	351283	351288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_015732	A	6	6	353418	353423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_015732	CAT	2	6	353462	353467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_015732	AGG	2	6	353519	353524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
577	NC_015732	A	6	6	356696	356701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_015732	TCT	2	6	356707	356712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_015732	TCC	2	6	356713	356718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_015732	CTT	2	6	356754	356759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_015732	TGA	2	6	356771	356776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015732	GGA	2	6	356828	356833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_015732	GTT	2	6	358303	358308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015732	GGAT	2	8	358375	358382	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
585	NC_015732	CTT	2	6	360418	360423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_015732	TGTAT	2	10	360449	360458	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
587	NC_015732	TA	3	6	360461	360466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_015732	AT	4	8	360485	360492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_015732	AT	4	8	360501	360508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_015732	AAC	2	6	360529	360534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_015732	GGT	2	6	360586	360591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_015732	GCA	2	6	360632	360637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_015732	ATTA	2	8	361325	361332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_015732	TGA	2	6	361356	361361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_015732	TAA	2	6	361368	361373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_015732	A	6	6	361372	361377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_015732	ATT	3	9	361400	361408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_015732	TAT	2	6	361409	361414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_015732	TAT	2	6	361458	361463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_015732	CAGGG	2	10	361493	361502	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
601	NC_015732	TCC	2	6	369913	369918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_015732	TATAA	2	10	370267	370276	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_015732	CT	3	6	370301	370306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
604	NC_015732	CTG	2	6	370338	370343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_015732	T	6	6	370359	370364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015732	CATG	2	8	370378	370385	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
607	NC_015732	ATC	2	6	371767	371772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_015732	TCT	2	6	372589	372594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_015732	TAG	2	6	372603	372608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_015732	CTG	2	6	373698	373703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_015732	GTG	2	6	373746	373751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015732	GAC	2	6	374534	374539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_015732	CGC	2	6	374540	374545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_015732	A	6	6	374552	374557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_015732	TCA	2	6	378653	378658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_015732	TTA	2	6	378661	378666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_015732	T	7	7	378684	378690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_015732	TTG	2	6	378698	378703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_015732	AT	3	6	378739	378744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_015732	CTAT	2	8	381790	381797	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
621	NC_015732	T	6	6	381864	381869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_015732	TCT	2	6	381919	381924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_015732	TGA	2	6	381965	381970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015732	CTC	2	6	381972	381977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_015732	CCT	2	6	381980	381985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_015732	CTT	2	6	381989	381994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_015732	CTT	2	6	382013	382018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_015732	TGGG	2	8	382075	382082	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015732	TAC	2	6	382110	382115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_015732	TTC	2	6	382146	382151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_015732	ATA	2	6	382225	382230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_015732	GTT	2	6	382232	382237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_015732	T	6	6	382386	382391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_015732	GTA	2	6	382414	382419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_015732	TTG	2	6	382425	382430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_015732	TTC	2	6	382446	382451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_015732	TATC	2	8	382466	382473	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
638	NC_015732	T	7	7	382522	382528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_015732	CCA	2	6	382565	382570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
640	NC_015732	AAT	2	6	382590	382595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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685	NC_015732	TG	3	6	386884	386889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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