MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Simkania negevensis Z chromosome gsn.131

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015713	GCCCTG	2	12	31759	31770	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015713	TAAAAT	2	12	48013	48024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015713	CTTTTT	2	12	78220	78231	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015713	TTTATC	2	12	149158	149169	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015713	CTTTTT	2	12	155845	155856	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015713	ATAGGA	2	12	178894	178905	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015713	CTTTTT	2	12	220638	220649	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015713	ATTTTT	2	12	234795	234806	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015713	ATAAAA	2	12	319206	319217	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015713	ACTTAA	2	12	332766	332777	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015713	TTAATT	2	12	339339	339350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015713	CCGGAG	2	12	372509	372520	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015713	TTTCGC	2	12	406746	406757	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015713	TTTCTC	2	12	462340	462351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015713	TAAAGT	2	12	483899	483910	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015713	AATAGA	2	12	525125	525136	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015713	TTTTTC	2	12	525331	525342	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015713	GAAAAA	2	12	745800	745811	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015713	TTATAA	2	12	754752	754763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015713	CTTTTT	2	12	768747	768758	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015713	GAAAAT	2	12	843780	843791	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015713	GGATTG	2	12	895906	895917	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015713	TTATTT	2	12	914485	914496	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015713	TTTTTA	2	12	921157	921168	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015713	TGAATA	2	12	949470	949481	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015713	AAGCAT	2	12	955391	955402	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015713	ATTTGT	2	12	1005242	1005253	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015713	GGGGCG	2	12	1008101	1008112	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015713	TTCGTT	2	12	1008385	1008396	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015713	AGCTGT	2	12	1036101	1036112	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015713	GTGTAG	2	12	1040018	1040029	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015713	AAAAAG	2	12	1042092	1042103	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015713	AAGCTA	2	12	1042105	1042116	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015713	TTTTCC	2	12	1058530	1058541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015713	AAATAG	2	12	1238978	1238989	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015713	CAGCCA	2	12	1239250	1239261	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015713	ATTAAA	2	12	1283468	1283479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015713	ATATGA	2	12	1304923	1304934	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015713	TGCTTC	2	12	1358548	1358559	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015713	GATCTC	2	12	1378295	1378306	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015713	TTTCTC	2	12	1429560	1429571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015713	TGATAT	2	12	1501522	1501533	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015713	ATATTT	2	12	1511947	1511958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015713	ATATTA	2	12	1567637	1567648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015713	TTAATA	2	12	1567651	1567662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015713	ACTGAT	2	12	1594098	1594109	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015713	GAAAAA	2	12	1697865	1697876	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015713	CAATTT	2	12	1760679	1760690	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015713	AAAATT	2	12	1875343	1875354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015713	GAAAAG	2	12	1884156	1884167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015713	TTATAA	2	12	1919115	1919126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015713	AATTTC	2	12	1920783	1920794	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015713	TGAAAT	2	12	1964184	1964195	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015713	AAAACA	2	12	2004757	2004768	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015713	TCAGGT	2	12	2013310	2013321	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015713	GAAAAA	2	12	2017431	2017442	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015713	ATGGGA	2	12	2023454	2023465	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015713	ATTTTA	2	12	2042721	2042732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015713	AAATAA	2	12	2049277	2049288	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015713	TATTAA	2	12	2056793	2056804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015713	TTTCTA	2	12	2070284	2070295	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015713	TATAAT	2	12	2071347	2071358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015713	TCATCT	2	12	2108441	2108452	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015713	CAATCA	2	12	2161201	2161212	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015713	TCTGCT	2	12	2216186	2216197	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015713	AAATTA	2	12	2274327	2274338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015713	GAGAAA	2	12	2316249	2316260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015713	TGAAAT	2	12	2373166	2373177	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015713	TAAAAA	2	12	2394396	2394407	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015713	AAAGAA	2	12	2456445	2456456	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.