MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus parasanguinis ATCC 15912 chromosome

Total Repeats: 5723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015678	ACC	2	6	2064890	2064895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5502	NC_015678	AAT	2	6	2064910	2064915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_015678	AGC	2	6	2064970	2064975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_015678	ATTC	2	8	2064977	2064984	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5505	NC_015678	TG	3	6	2065099	2065104	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_015678	GAG	2	6	2065120	2065125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_015678	GA	3	6	2065250	2065255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_015678	ACA	2	6	2065276	2065281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_015678	AGG	2	6	2065314	2065319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_015678	CTAA	2	8	2065331	2065338	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5511	NC_015678	TAG	2	6	2065433	2065438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_015678	GA	3	6	2065545	2065550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_015678	CT	3	6	2065661	2065666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5514	NC_015678	GAT	2	6	2065679	2065684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_015678	CGG	2	6	2065770	2065775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_015678	GA	3	6	2065868	2065873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_015678	TAGG	2	8	2065986	2065993	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_015678	GTT	2	6	2066030	2066035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_015678	TAC	2	6	2066040	2066045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_015678	ATC	2	6	2066080	2066085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_015678	CCT	2	6	2066128	2066133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5522	NC_015678	GGT	2	6	2066264	2066269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_015678	TCG	2	6	2066379	2066384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_015678	CGT	2	6	2066459	2066464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_015678	AGGGA	2	10	2066597	2066606	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_015678	GA	3	6	2066683	2066688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_015678	TG	3	6	2066719	2066724	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_015678	ACTAAT	2	12	2066738	2066749	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5529	NC_015678	AGA	2	6	2066775	2066780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_015678	CAG	2	6	2066895	2066900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_015678	AGT	2	6	2066921	2066926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_015678	GTA	2	6	2066988	2066993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_015678	ATG	2	6	2067011	2067016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_015678	ATT	2	6	2067061	2067066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_015678	T	6	6	2067078	2067083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_015678	T	6	6	2067219	2067224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_015678	A	8	8	2067237	2067244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_015678	GAA	2	6	2067249	2067254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_015678	T	6	6	2067270	2067275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_015678	ATTT	2	8	2068735	2068742	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_015678	CAT	2	6	2068814	2068819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_015678	AT	3	6	2068824	2068829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_015678	ATTTT	2	10	2068837	2068846	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_015678	T	6	6	2068843	2068848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_015678	T	6	6	2069716	2069721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_015678	T	6	6	2069727	2069732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_015678	A	6	6	2069734	2069739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_015678	ATT	2	6	2069749	2069754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_015678	TC	3	6	2071521	2071526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5550	NC_015678	CAAACT	2	12	2071567	2071578	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_015678	ACTT	2	8	2074288	2074295	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5552	NC_015678	ATCC	2	8	2074300	2074307	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5553	NC_015678	T	7	7	2079613	2079619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_015678	GCA	2	6	2081046	2081051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_015678	ACTT	2	8	2081080	2081087	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5556	NC_015678	TAT	2	6	2081101	2081106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_015678	TCC	2	6	2081493	2081498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5558	NC_015678	ATTC	2	8	2081508	2081515	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5559	NC_015678	TAT	2	6	2081516	2081521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_015678	ATA	2	6	2081525	2081530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_015678	AAG	2	6	2081533	2081538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_015678	CTT	2	6	2081547	2081552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_015678	GTAA	2	8	2083355	2083362	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_015678	TCC	2	6	2084366	2084371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5565	NC_015678	TTTG	2	8	2084380	2084387	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_015678	TAT	2	6	2084419	2084424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_015678	TGA	2	6	2084547	2084552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_015678	AGA	2	6	2084557	2084562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_015678	AT	3	6	2084564	2084569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_015678	CAA	2	6	2084613	2084618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_015678	A	6	6	2084640	2084645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_015678	AT	3	6	2084649	2084654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_015678	A	6	6	2084689	2084694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_015678	TCC	2	6	2085761	2085766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5575	NC_015678	CTT	2	6	2085805	2085810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_015678	TAA	2	6	2085811	2085816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_015678	TAA	2	6	2085823	2085828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_015678	A	7	7	2085855	2085861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_015678	A	6	6	2085866	2085871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_015678	GAG	2	6	2086773	2086778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_015678	AGAGA	2	10	2086823	2086832	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_015678	T	6	6	2088398	2088403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_015678	T	6	6	2088452	2088457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_015678	T	6	6	2088498	2088503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_015678	AAAG	2	8	2088505	2088512	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_015678	A	6	6	2088523	2088528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_015678	ATA	2	6	2088536	2088541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_015678	A	7	7	2090734	2090740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_015678	CCT	2	6	2091049	2091054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5590	NC_015678	TATAA	2	10	2091500	2091509	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_015678	TAA	2	6	2094822	2094827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_015678	GAG	2	6	2094880	2094885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_015678	GAAA	2	8	2095372	2095379	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_015678	AGA	2	6	2095392	2095397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_015678	GGA	2	6	2097160	2097165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_015678	A	6	6	2099900	2099905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_015678	CTA	2	6	2100385	2100390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_015678	TCA	2	6	2100399	2100404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_015678	GAC	2	6	2100439	2100444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_015678	CT	4	8	2100482	2100489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5601	NC_015678	T	7	7	2100489	2100495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_015678	TC	3	6	2100497	2100502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5603	NC_015678	A	6	6	2100540	2100545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_015678	TG	3	6	2100570	2100575	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_015678	AGGAG	2	10	2100598	2100607	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_015678	GGA	2	6	2100630	2100635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_015678	AGTA	2	8	2102288	2102295	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_015678	TCTA	2	8	2102322	2102329	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5609	NC_015678	CT	3	6	2103611	2103616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5610	NC_015678	AG	3	6	2103628	2103633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_015678	TAA	3	9	2104826	2104834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_015678	T	7	7	2104860	2104866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_015678	A	8	8	2104897	2104904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_015678	AATAAA	2	12	2104949	2104960	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_015678	TAGT	2	8	2104965	2104972	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_015678	ATGT	2	8	2104974	2104981	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_015678	TGAA	2	8	2105012	2105019	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_015678	TAAAA	2	10	2105054	2105063	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_015678	TTGT	2	8	2109400	2109407	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_015678	AAGA	2	8	2109488	2109495	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_015678	TC	3	6	2109569	2109574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5622	NC_015678	AGTAA	2	10	2109587	2109596	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_015678	TAA	2	6	2109609	2109614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_015678	A	6	6	2109732	2109737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_015678	CCT	2	6	2109767	2109772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5626	NC_015678	CGA	2	6	2109850	2109855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_015678	AG	3	6	2110817	2110822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_015678	GAT	2	6	2110840	2110845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_015678	CGC	2	6	2110868	2110873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5630	NC_015678	ACG	2	6	2110951	2110956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5631	NC_015678	TTGC	2	8	2110964	2110971	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5632	NC_015678	GAAA	2	8	2110996	2111003	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5634	NC_015678	TGA	2	6	2113067	2113072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.