MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti AK83 plasmid pSINME01

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015597	CCGCC	2	10	763	772	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
2	NC_015597	GGAAG	2	10	3308	3317	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015597	GGTCC	2	10	4590	4599	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_015597	ATGGC	2	10	4994	5003	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015597	GGATA	2	10	6946	6955	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015597	GGCAC	2	10	8229	8238	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_015597	CGCGG	2	10	22151	22160	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_015597	AATTA	2	10	26341	26350	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015597	GGTCC	2	10	28618	28627	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_015597	GCATG	2	10	33110	33119	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015597	CGTGC	2	10	36790	36799	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_015597	CCGCG	2	10	37517	37526	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13	NC_015597	ATGGC	2	10	38607	38616	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015597	CCGTT	2	10	40489	40498	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_015597	GAGGC	2	10	44750	44759	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015597	GTCAA	2	10	44871	44880	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015597	CTTTA	2	10	56886	56895	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015597	GATCG	2	10	56986	56995	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015597	CCAGA	2	10	63405	63414	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_015597	CCAAG	2	10	81624	81633	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_015597	CCGCT	2	10	81943	81952	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_015597	GGCTT	2	10	84610	84619	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015597	GCCAT	2	10	85155	85164	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_015597	CATCC	2	10	111583	111592	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
25	NC_015597	GAAAA	2	10	112467	112476	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015597	GTCAG	2	10	112574	112583	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015597	GTGAA	2	10	115297	115306	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015597	TGGCC	2	10	125862	125871	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_015597	CCGCG	2	10	126051	126060	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
30	NC_015597	CTTTG	2	10	148678	148687	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015597	CAAGT	2	10	154187	154196	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015597	ACGCG	2	10	155377	155386	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_015597	TCGGC	2	10	158219	158228	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_015597	GCGTG	2	10	160722	160731	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_015597	TTGCC	2	10	160893	160902	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_015597	CGAAA	2	10	161102	161111	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015597	CAGAC	2	10	164938	164947	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_015597	AAAAG	2	10	165220	165229	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015597	GCCGA	2	10	165319	165328	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_015597	CGGTG	2	10	169995	170004	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015597	GCGTC	2	10	176473	176482	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_015597	CGCGG	2	10	187755	187764	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
43	NC_015597	CCGGC	2	10	210429	210438	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
44	NC_015597	CTGGC	2	10	215996	216005	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_015597	GGCGA	2	10	221115	221124	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015597	CGATC	2	10	221552	221561	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_015597	CCAAG	2	10	225849	225858	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_015597	CTGCC	2	10	236827	236836	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
49	NC_015597	GGGCA	2	10	236995	237004	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_015597	CGCAC	2	10	243022	243031	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
51	NC_015597	CGCAA	2	10	246291	246300	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_015597	TCGCC	2	10	249291	249300	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
53	NC_015597	GGCCT	2	10	249349	249358	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.