MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti AK83 plasmid pSINME01

Total Repeats: 1687

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015597	AGCG	2	8	217360	217367	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1502	NC_015597	TCA	2	6	217380	217385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_015597	GAA	2	6	218035	218040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_015597	GAT	2	6	218105	218110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_015597	GGCCAG	2	12	218128	218139	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_015597	TCTCGA	2	12	218154	218165	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_015597	GCCC	2	8	219112	219119	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1508	NC_015597	TGG	2	6	220128	220133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_015597	AGG	2	6	220207	220212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_015597	TCG	2	6	220597	220602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_015597	GCG	2	6	220652	220657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_015597	TCG	2	6	220658	220663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_015597	GC	3	6	220757	220762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_015597	CGA	2	6	220814	220819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_015597	CCG	2	6	220823	220828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1516	NC_015597	GCC	2	6	220844	220849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_015597	GAG	2	6	220871	220876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_015597	CGC	2	6	220990	220995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_015597	GCC	2	6	221002	221007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_015597	CGG	2	6	221020	221025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_015597	GCG	2	6	221034	221039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_015597	TCGG	2	8	221041	221048	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1523	NC_015597	TTC	2	6	221107	221112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_015597	GGCGA	2	10	221115	221124	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1525	NC_015597	CAC	2	6	221182	221187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_015597	GC	3	6	221211	221216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_015597	CGA	2	6	221223	221228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_015597	CGT	2	6	221246	221251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_015597	CGA	2	6	221330	221335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_015597	GCG	2	6	221347	221352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_015597	CGA	2	6	221363	221368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_015597	TGC	2	6	221410	221415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_015597	TGCC	2	8	221475	221482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_015597	CGATC	2	10	221552	221561	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1535	NC_015597	ACT	2	6	221650	221655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_015597	CTTC	2	8	221670	221677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1537	NC_015597	ACG	2	6	221680	221685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_015597	CTC	2	6	221700	221705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_015597	TCT	2	6	221845	221850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_015597	GTC	2	6	221927	221932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_015597	TC	3	6	222009	222014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1542	NC_015597	TG	3	6	222090	222095	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_015597	CCT	2	6	222130	222135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_015597	TCC	2	6	222159	222164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_015597	CGAG	2	8	222187	222194	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1546	NC_015597	CCT	2	6	222223	222228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1547	NC_015597	CCG	2	6	222239	222244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_015597	CAG	2	6	222245	222250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_015597	GTT	2	6	223048	223053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_015597	TCGCGC	2	12	223176	223187	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_015597	GTC	2	6	223274	223279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_015597	CCA	2	6	223288	223293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_015597	AAG	2	6	223352	223357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_015597	AGT	2	6	223373	223378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_015597	A	6	6	223464	223469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_015597	CGCA	2	8	224414	224421	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1557	NC_015597	GGAA	2	8	224431	224438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_015597	CGG	2	6	224531	224536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_015597	GA	3	6	224605	224610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_015597	AGG	2	6	224637	224642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_015597	CGG	2	6	224878	224883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_015597	CAC	2	6	224912	224917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_015597	TTC	2	6	225042	225047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_015597	CAA	2	6	225788	225793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_015597	TCAT	2	8	225841	225848	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1566	NC_015597	CCAAG	2	10	225849	225858	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1567	NC_015597	CGC	2	6	225907	225912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1568	NC_015597	CGG	2	6	225949	225954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_015597	CGC	2	6	225993	225998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_015597	GCGG	2	8	226017	226024	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1571	NC_015597	CGC	2	6	226319	226324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1572	NC_015597	TCG	2	6	226325	226330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_015597	CGG	2	6	226362	226367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_015597	AAGC	2	8	226390	226397	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_015597	GAC	2	6	226404	226409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_015597	CGAG	2	8	226429	226436	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1577	NC_015597	CCCG	2	8	228011	228018	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1578	NC_015597	ACC	2	6	228085	228090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1579	NC_015597	GAC	2	6	228237	228242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_015597	GCC	2	6	228307	228312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1581	NC_015597	GTT	2	6	228333	228338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_015597	GAC	2	6	228386	228391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_015597	TGGC	2	8	228399	228406	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1584	NC_015597	AT	3	6	228418	228423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_015597	GGC	2	6	236713	236718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_015597	TGA	2	6	236724	236729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_015597	CGG	2	6	236763	236768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_015597	CTGCC	2	10	236827	236836	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1589	NC_015597	GGGCA	2	10	236995	237004	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1590	NC_015597	GA	3	6	237005	237010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_015597	CAC	2	6	237041	237046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1592	NC_015597	CCA	2	6	237054	237059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1593	NC_015597	TCC	2	6	237068	237073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1594	NC_015597	CAAGAT	2	12	237075	237086	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1595	NC_015597	TG	3	6	237128	237133	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_015597	CAA	2	6	239530	239535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_015597	GGT	2	6	240638	240643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_015597	CGC	2	6	240652	240657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_015597	TAC	2	6	241437	241442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_015597	TCC	2	6	241479	241484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1601	NC_015597	GC	3	6	241542	241547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_015597	GCC	2	6	243000	243005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1603	NC_015597	CGCAC	2	10	243022	243031	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1604	NC_015597	TG	3	6	245105	245110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_015597	TCG	2	6	245124	245129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_015597	GC	3	6	246142	246147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_015597	TCG	2	6	246223	246228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_015597	ACG	2	6	246284	246289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_015597	CGCAA	2	10	246291	246300	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1610	NC_015597	CCG	2	6	246328	246333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1611	NC_015597	TCA	2	6	246389	246394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_015597	C	6	6	246425	246430	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1613	NC_015597	AT	3	6	246510	246515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_015597	CGA	2	6	246664	246669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_015597	GGCC	2	8	247355	247362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1616	NC_015597	CGT	2	6	247435	247440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_015597	CAGG	2	8	247456	247463	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1618	NC_015597	GAC	2	6	247464	247469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_015597	TCG	2	6	247871	247876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_015597	AG	3	6	249083	249088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_015597	TTC	2	6	249117	249122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_015597	CCG	3	9	249134	249142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1623	NC_015597	TGC	2	6	249168	249173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_015597	TGC	2	6	249193	249198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_015597	GGC	2	6	249247	249252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_015597	TCGCC	2	10	249291	249300	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1627	NC_015597	GCC	2	6	249314	249319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1628	NC_015597	GGCCT	2	10	249349	249358	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1629	NC_015597	CCT	2	6	249406	249411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1630	NC_015597	GAC	2	6	249534	249539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_015597	AGC	2	6	249551	249556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_015597	GGC	2	6	249558	249563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_015597	CTT	2	6	249615	249620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_015597	CGA	2	6	249630	249635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_015597	GCC	2	6	249682	249687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1636	NC_015597	CCCT	2	8	249728	249735	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1637	NC_015597	GCGG	2	8	249741	249748	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1638	NC_015597	CAG	2	6	249771	249776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1639	NC_015597	CAT	2	6	249807	249812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1640	NC_015597	CAT	2	6	249856	249861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1641	NC_015597	GA	3	6	249879	249884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1642	NC_015597	CG	3	6	249900	249905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1643	NC_015597	GA	3	6	251292	251297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1644	NC_015597	ACG	2	6	251305	251310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1645	NC_015597	G	6	6	251320	251325	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1646	NC_015597	GGT	2	6	253679	253684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1647	NC_015597	TG	3	6	253699	253704	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1649	NC_015597	GGT	2	6	253899	253904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1650	NC_015597	GCTC	2	8	253930	253937	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1651	NC_015597	TCG	2	6	254028	254033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1653	NC_015597	TCG	2	6	254210	254215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1654	NC_015597	CT	3	6	254257	254262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1655	NC_015597	CCG	2	6	254289	254294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1656	NC_015597	GGC	2	6	254358	254363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1657	NC_015597	GCG	2	6	254365	254370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1658	NC_015597	GC	3	6	254455	254460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1659	NC_015597	CCG	2	6	254466	254471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1660	NC_015597	CGG	2	6	254519	254524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1661	NC_015597	CGC	2	6	254545	254550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1662	NC_015597	GA	4	8	254562	254569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1663	NC_015597	CCGA	2	8	254642	254649	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1664	NC_015597	GCA	2	6	254717	254722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1665	NC_015597	GCA	2	6	254758	254763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1666	NC_015597	CTT	2	6	254836	254841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1667	NC_015597	CTG	2	6	254920	254925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1668	NC_015597	TGC	2	6	254930	254935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1670	NC_015597	TCA	2	6	255168	255173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1671	NC_015597	CA	4	8	255209	255216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1672	NC_015597	CGG	2	6	255346	255351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1673	NC_015597	CAG	2	6	255450	255455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1674	NC_015597	GAA	2	6	255500	255505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1675	NC_015597	GCC	3	9	255542	255550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1676	NC_015597	GCC	2	6	255568	255573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1677	NC_015597	CTGGCG	2	12	255620	255631	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1678	NC_015597	ACGC	2	8	255655	255662	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1679	NC_015597	TCA	2	6	255666	255671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1680	NC_015597	GC	3	6	255703	255708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1683	NC_015597	GCA	2	6	255805	255810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1684	NC_015597	CAT	2	6	255883	255888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1685	NC_015597	CAA	2	6	255896	255901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1686	NC_015597	GCC	2	6	255916	255921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1687	NC_015597	CTT	2	6	255926	255931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.