MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti AK83 plasmid pSINME02

Total Repeats: 347

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015592	GGA	2	6	19	24	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015592	CTT	2	6	378	383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015592	CAG	2	6	388	393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015592	CGG	2	6	1109	1114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015592	GAA	2	6	1246	1251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015592	CTT	2	6	1275	1280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015592	GCT	2	6	1308	1313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015592	GGT	2	6	1375	1380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015592	GCT	2	6	1589	1594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015592	CGT	2	6	1601	1606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015592	ATC	2	6	1761	1766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015592	CGG	2	6	1771	1776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015592	GAT	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015592	TCG	2	6	1856	1861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015592	ATG	2	6	2008	2013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015592	TGG	2	6	2037	2042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015592	CAT	2	6	2171	2176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015592	CTT	2	6	3327	3332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015592	GCC	2	6	3377	3382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_015592	CGA	2	6	3452	3457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015592	CGG	2	6	3600	3605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015592	TGT	2	6	3610	3615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015592	ACG	2	6	3682	3687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015592	CCG	2	6	3702	3707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_015592	GCC	2	6	3778	3783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_015592	TGA	2	6	3851	3856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015592	CGG	2	6	3876	3881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015592	CGT	2	6	3883	3888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015592	CTC	2	6	3951	3956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_015592	TGC	2	6	3986	3991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015592	GCT	2	6	4071	4076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015592	AGC	2	6	4207	4212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015592	CCG	2	6	4237	4242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_015592	CGG	2	6	4258	4263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015592	GTT	2	6	4419	4424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015592	TCT	2	6	4453	4458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015592	CCT	2	6	4526	4531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_015592	TGG	2	6	4578	4583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015592	GCA	2	6	4595	4600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015592	GGC	2	6	4711	4716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015592	CGT	2	6	6321	6326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015592	CGC	2	6	7079	7084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_015592	CTG	2	6	7217	7222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015592	GCT	2	6	7244	7249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015592	CGC	2	6	7352	7357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_015592	CCG	2	6	7371	7376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_015592	TGC	2	6	7389	7394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015592	TTC	2	6	7431	7436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015592	TGA	2	6	7511	7516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015592	ATC	2	6	7716	7721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015592	CGG	2	6	7780	7785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015592	TGT	2	6	7844	7849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015592	GCA	2	6	7952	7957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015592	CCT	2	6	7968	7973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_015592	CAC	2	6	9073	9078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_015592	AGC	2	6	9191	9196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015592	GAT	2	6	9205	9210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015592	AAT	2	6	9230	9235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015592	GTG	2	6	9237	9242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015592	TCG	2	6	9262	9267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015592	ACG	2	6	9345	9350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015592	CAG	2	6	9449	9454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015592	GGC	2	6	9466	9471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015592	CCG	3	9	9490	9498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_015592	CGC	2	6	9517	9522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_015592	CAG	2	6	9548	9553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015592	GTT	2	6	9564	9569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015592	ATC	2	6	9645	9650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015592	CGA	2	6	9656	9661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015592	AGG	2	6	9927	9932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015592	GCC	2	6	10057	10062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015592	CGA	2	6	10215	10220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015592	ACC	2	6	10229	10234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_015592	GCC	2	6	10259	10264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_015592	GCA	2	6	10311	10316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015592	CGG	2	6	10501	10506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015592	GCG	2	6	10544	10549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015592	ATT	2	6	10646	10651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015592	AAC	2	6	12402	12407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015592	TGC	2	6	12745	12750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015592	CGC	2	6	12779	12784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_015592	CCG	2	6	12787	12792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_015592	GCA	2	6	12798	12803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015592	AAG	2	6	12870	12875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015592	GGT	2	6	13013	13018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015592	ATG	2	6	22084	22089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015592	ATA	3	9	22231	22239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015592	GAC	2	6	22246	22251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015592	AGG	2	6	22280	22285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015592	TTG	2	6	22303	22308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015592	ACA	2	6	22384	22389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015592	TGA	2	6	22418	22423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015592	TCA	2	6	22466	22471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015592	GCG	2	6	22484	22489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015592	CAA	2	6	22640	22645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015592	GAA	3	9	24474	24482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015592	CCT	2	6	30138	30143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_015592	TAA	2	6	31219	31224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015592	CAC	2	6	31487	31492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_015592	GCC	2	6	31522	31527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_015592	CGG	2	6	31581	31586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015592	ATC	2	6	31619	31624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015592	CGG	2	6	31653	31658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015592	ACG	2	6	31740	31745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015592	GCC	2	6	31936	31941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_015592	GCC	2	6	32008	32013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_015592	ATC	2	6	32029	32034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015592	GTC	2	6	32112	32117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015592	CAG	2	6	32244	32249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015592	CGC	2	6	32275	32280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_015592	GTC	2	6	32345	32350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015592	TGT	2	6	32539	32544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015592	GCC	2	6	32553	32558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_015592	GAA	2	6	32648	32653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015592	GCG	2	6	32679	32684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015592	GAA	2	6	32791	32796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015592	ATC	2	6	32848	32853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015592	CTG	2	6	32866	32871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015592	CGC	2	6	32940	32945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_015592	CGT	2	6	32955	32960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015592	CTG	2	6	33073	33078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015592	GGA	2	6	33103	33108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015592	TCG	2	6	33116	33121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015592	GGC	2	6	33144	33149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015592	CGT	2	6	33269	33274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015592	CTG	2	6	33297	33302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015592	TCC	2	6	34086	34091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_015592	GCA	2	6	37792	37797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015592	CCT	2	6	37820	37825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_015592	CAA	2	6	37875	37880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015592	GTA	2	6	37965	37970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015592	ATG	2	6	39574	39579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015592	GCG	3	9	39583	39591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015592	TCG	2	6	39611	39616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015592	GCT	2	6	39651	39656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015592	TCA	2	6	39674	39679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015592	CGG	2	6	39702	39707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015592	GCA	2	6	39743	39748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015592	GCT	2	6	39777	39782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015592	GCC	2	6	39790	39795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_015592	TCA	2	6	39809	39814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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278	NC_015592	CAA	2	6	60670	60675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_015592	ATA	2	6	60785	60790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_015592	TTG	2	6	62210	62215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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309	NC_015592	CGG	2	6	65068	65073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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320	NC_015592	GAA	2	6	65980	65985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
321	NC_015592	GTT	2	6	66041	66046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
322	NC_015592	TGC	2	6	66051	66056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.