MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti AK83 chromosome 1

Total Repeats: 160

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015590	CGCAGG	2	12	37977	37988	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015590	GGACAG	2	12	82858	82869	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015590	CGGAGG	2	12	85915	85926	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015590	TGGCCC	2	12	143729	143740	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015590	CAAAAA	2	12	185780	185791	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015590	CGGGGA	2	12	256334	256345	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015590	AGGCGG	2	12	262968	262979	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015590	GTCCAA	2	12	300714	300725	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015590	CGGCTT	2	12	389453	389464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015590	AGCGAA	2	12	389772	389783	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015590	GTGAGG	2	12	410308	410319	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015590	TGGGCC	2	12	410705	410716	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015590	GACAAG	2	12	411011	411022	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015590	AACAAA	2	12	454114	454125	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015590	CTTCTG	2	12	476993	477004	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015590	GAAGCG	2	12	516433	516444	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015590	CGTCGG	2	12	535951	535962	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015590	CCGAAC	2	12	555661	555672	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015590	GGCCGC	2	12	564649	564660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015590	GGCAGG	2	12	579033	579044	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015590	CGGAGG	2	12	665867	665878	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015590	GGGCAT	2	12	673242	673253	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015590	AAATAT	2	12	677780	677791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015590	CGATAG	2	12	682126	682137	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015590	TATAGG	2	12	695626	695637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015590	TCAACG	2	12	696725	696736	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015590	GGCCAT	2	12	699553	699564	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015590	GTTAGA	2	12	704208	704219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015590	CTGGCT	2	12	731497	731508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015590	GCTTGC	2	12	772417	772428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015590	TTCGGC	2	12	775104	775115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015590	GTTTAC	2	12	778169	778180	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015590	CTTCCC	2	12	782681	782692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_015590	GAATCG	2	12	794824	794835	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015590	TGCGGC	2	12	851099	851110	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015590	GCGCGT	2	12	855943	855954	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015590	GTCCCG	2	12	887368	887379	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015590	CTCCAG	2	12	898036	898047	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015590	CAGCGC	2	12	900121	900132	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015590	TTGCAC	2	12	900134	900145	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015590	TTTCCG	2	12	932305	932316	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015590	GTGCCG	2	12	942550	942561	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015590	GCGGGG	2	12	1007250	1007261	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015590	CGGCGC	2	12	1028483	1028494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015590	GACGCG	2	12	1160388	1160399	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015590	CGTTCA	2	12	1170584	1170595	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015590	CAGGAA	2	12	1176428	1176439	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015590	AAGTAG	2	12	1190854	1190865	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015590	TGCCGG	2	12	1232553	1232564	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015590	CCGGCC	2	12	1236134	1236145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_015590	GATGCC	2	12	1256901	1256912	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015590	CGGCCG	2	12	1295030	1295041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015590	CGAATG	2	12	1302407	1302418	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015590	TTTCCT	2	12	1307166	1307177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015590	AGACGG	2	12	1358489	1358500	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015590	CAAATT	2	12	1454660	1454671	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015590	TTCGGC	2	12	1476987	1476998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015590	GCCTCG	2	12	1477381	1477392	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015590	CGTTGA	2	12	1501775	1501786	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015590	TCGAAG	2	12	1517873	1517884	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015590	CGAGCC	2	12	1518703	1518714	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015590	TCGCGA	2	12	1520158	1520169	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015590	AGGCTG	2	12	1521642	1521653	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015590	GGTGCT	2	12	1521690	1521701	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015590	ACCGAA	2	12	1552851	1552862	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015590	GCACCG	2	12	1582803	1582814	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015590	TGAGAG	2	12	1618630	1618641	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015590	GGTCAT	2	12	1695129	1695140	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015590	CTGTCG	2	12	1749309	1749320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015590	CAAGGT	2	12	1832155	1832166	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015590	GTCGCC	2	12	1832258	1832269	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015590	TTTGGG	2	12	1843493	1843504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015590	GGCGGA	2	12	1850156	1850167	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015590	AGACAG	2	12	1870344	1870355	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015590	CCCCTG	2	12	1872009	1872020	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_015590	CGGTGC	2	12	1880964	1880975	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015590	AGACCG	2	12	1881005	1881016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015590	ATGCCG	2	12	1916785	1916796	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015590	GGCGCT	2	12	1950403	1950414	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015590	ACGGCG	2	12	1950534	1950545	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015590	AGAAGG	2	12	1968415	1968426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015590	CGGGAT	2	12	2022871	2022882	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_015590	CAAGGC	2	12	2031172	2031183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015590	TTAATT	2	12	2050505	2050516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015590	CAGCGC	2	12	2050660	2050671	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015590	CCGCGT	2	12	2081600	2081611	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015590	GCCTCC	2	12	2094423	2094434	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_015590	CATTGG	2	12	2108070	2108081	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_015590	GTAACT	2	12	2127052	2127063	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015590	GGGCTG	2	12	2135973	2135984	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_015590	CCGGTT	2	12	2162179	2162190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015590	CGGCCG	2	12	2232078	2232089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015590	GAGGCC	2	12	2287583	2287594	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015590	TTTGCT	2	12	2308905	2308916	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_015590	TTTCGG	2	12	2338044	2338055	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015590	GATGAG	2	12	2342260	2342271	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015590	TGATTC	2	12	2387398	2387409	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_015590	GGACGA	2	12	2395918	2395929	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_015590	GCGATG	2	12	2424834	2424845	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_015590	ATCTCC	2	12	2437467	2437478	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015590	AAATGA	2	12	2531740	2531751	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015590	GCGCTC	2	12	2538630	2538641	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015590	ACGATC	2	12	2538915	2538926	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015590	GCGGCC	2	12	2567535	2567546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015590	TCGCCC	2	12	2580612	2580623	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_015590	CGCTTG	2	12	2587706	2587717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015590	GCCGGA	2	12	2587933	2587944	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015590	GGCTGC	2	12	2657549	2657560	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015590	ATGTGT	2	12	2664290	2664301	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015590	CCGGAT	2	12	2665545	2665556	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015590	GAGAAA	2	12	2668723	2668734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015590	TTTCTC	2	12	2670604	2670615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015590	GAATAA	2	12	2681367	2681378	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015590	ATCTTC	2	12	2683500	2683511	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015590	GACCGA	2	12	2683712	2683723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015590	ACGTAA	2	12	2709448	2709459	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_015590	AGCGGC	2	12	2754078	2754089	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015590	AGAGCG	2	12	2776087	2776098	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_015590	GTCTAG	2	12	2798032	2798043	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_015590	TCATGT	2	12	2890657	2890668	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_015590	ACATGA	2	12	2890692	2890703	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_015590	GAAGCG	2	12	2907589	2907600	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_015590	GCGTTC	2	12	2914065	2914076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015590	ATTCCC	2	12	2963603	2963614	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015590	GATTGA	2	12	2986962	2986973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015590	GAAAAG	2	12	2989009	2989020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015590	CAAGCG	2	12	3039822	3039833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015590	ATGTGT	2	12	3066661	3066672	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015590	CCGGAT	2	12	3067917	3067928	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015590	GAGAAA	2	12	3071094	3071105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015590	TTTCTC	2	12	3072974	3072985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015590	CCGAGT	2	12	3095857	3095868	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015590	ACGTAA	2	12	3175696	3175707	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_015590	CATGTT	2	12	3233097	3233108	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_015590	CAGCCC	2	12	3284575	3284586	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_015590	GGGGCC	2	12	3315218	3315229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015590	GAATCG	2	12	3316064	3316075	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_015590	GCATAT	2	12	3327494	3327505	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_015590	CCTCTC	2	12	3343064	3343075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_015590	CTCGGT	2	12	3390629	3390640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015590	AGTGTC	2	12	3428667	3428678	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_015590	TCCCGC	2	12	3475088	3475099	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_015590	ACCGAG	2	12	3480318	3480329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_015590	CGTTTC	2	12	3498845	3498856	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_015590	AGAGAA	2	12	3505607	3505618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015590	TTTCTC	2	12	3507488	3507499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_015590	ATCCGG	2	12	3510665	3510676	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_015590	GGTCGG	2	12	3512266	3512277	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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151	NC_015590	TATTTT	2	12	3553828	3553839	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015590	GCGCGA	2	12	3581110	3581121	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_015590	AGCCGC	2	12	3597641	3597652	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
154	NC_015590	CAGCGG	2	12	3629615	3629626	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_015590	CGCGCT	2	12	3671762	3671773	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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157	NC_015590	ATGGTG	2	12	3742913	3742924	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015590	TCGACT	2	12	3771036	3771047	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_015590	CGGGAA	2	12	3788303	3788314	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_015590	GGATAT	2	12	3795093	3795104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.