MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti AK83 chromosome 1

Total Repeats: 10446

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_015590	CGA	2	6	3660080	3660085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_015590	TGT	2	6	3661089	3661094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_015590	CCG	2	6	3661118	3661123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10004	NC_015590	CT	3	6	3661158	3661163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10005	NC_015590	TGGG	2	8	3661172	3661179	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_015590	A	7	7	3661202	3661208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_015590	T	6	6	3661217	3661222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_015590	A	6	6	3661231	3661236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_015590	CGG	2	6	3661259	3661264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_015590	GGC	2	6	3661266	3661271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_015590	A	6	6	3661281	3661286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_015590	CG	3	6	3661346	3661351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10013	NC_015590	GAGC	2	8	3662045	3662052	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10014	NC_015590	GGGC	2	8	3662430	3662437	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10015	NC_015590	GCA	2	6	3662459	3662464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_015590	AAT	2	6	3662481	3662486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_015590	CG	3	6	3662508	3662513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10018	NC_015590	CAT	2	6	3662514	3662519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_015590	TA	3	6	3662523	3662528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_015590	CCG	2	6	3662597	3662602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10021	NC_015590	CT	3	6	3662692	3662697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10022	NC_015590	CCA	2	6	3662747	3662752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10023	NC_015590	GCG	2	6	3662802	3662807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_015590	TGA	2	6	3663182	3663187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_015590	T	6	6	3664312	3664317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_015590	TGC	2	6	3664349	3664354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_015590	GAA	2	6	3668808	3668813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_015590	CGCA	2	8	3668824	3668831	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10029	NC_015590	GCA	2	6	3668850	3668855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_015590	TTCC	2	8	3670356	3670363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10031	NC_015590	GCG	2	6	3671417	3671422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_015590	CGCGCT	2	12	3671762	3671773	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10033	NC_015590	TGC	2	6	3671788	3671793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_015590	CTG	2	6	3671828	3671833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_015590	CTGCCC	2	12	3672872	3672883	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
10036	NC_015590	GCC	2	6	3672895	3672900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10037	NC_015590	CGCT	3	12	3672937	3672948	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10038	NC_015590	CGGG	2	8	3672953	3672960	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10039	NC_015590	GGC	2	6	3673040	3673045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10040	NC_015590	GTC	2	6	3674167	3674172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_015590	TCGC	2	8	3674199	3674206	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10042	NC_015590	TGG	2	6	3674222	3674227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_015590	ATG	2	6	3674243	3674248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_015590	TCA	2	6	3674258	3674263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10045	NC_015590	A	6	6	3674279	3674284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_015590	CGAC	2	8	3674291	3674298	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10047	NC_015590	CAAA	2	8	3675141	3675148	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10048	NC_015590	A	6	6	3675146	3675151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_015590	CG	3	6	3675169	3675174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10050	NC_015590	CGAC	2	8	3676917	3676924	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10051	NC_015590	GGC	2	6	3676940	3676945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10052	NC_015590	ACT	2	6	3677012	3677017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_015590	AAG	2	6	3677054	3677059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_015590	CG	3	6	3677221	3677226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10055	NC_015590	CG	3	6	3677238	3677243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10056	NC_015590	TGC	2	6	3677749	3677754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_015590	AGT	2	6	3677766	3677771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_015590	GCA	2	6	3677779	3677784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10059	NC_015590	T	6	6	3679941	3679946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_015590	GGCTT	2	10	3679950	3679959	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10061	NC_015590	TGC	2	6	3679965	3679970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_015590	TGG	3	9	3680000	3680008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_015590	GGAA	2	8	3680038	3680045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_015590	ACC	2	6	3680112	3680117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10065	NC_015590	TTC	2	6	3680118	3680123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_015590	CAC	2	6	3680137	3680142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10067	NC_015590	CGT	2	6	3682073	3682078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10068	NC_015590	TCCG	2	8	3682127	3682134	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10069	NC_015590	GAC	2	6	3682171	3682176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_015590	GGA	2	6	3682562	3682567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_015590	GGC	2	6	3683206	3683211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10072	NC_015590	GCG	2	6	3685200	3685205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10073	NC_015590	CAT	2	6	3685217	3685222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_015590	GAG	2	6	3685297	3685302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_015590	ATGCG	2	10	3687022	3687031	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10076	NC_015590	CCGGC	2	10	3687066	3687075	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10077	NC_015590	T	6	6	3687171	3687176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_015590	CGA	2	6	3687188	3687193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10079	NC_015590	GGAAC	2	10	3690288	3690297	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10080	NC_015590	T	8	8	3693020	3693027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_015590	GC	3	6	3693038	3693043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10082	NC_015590	CGC	2	6	3693046	3693051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10083	NC_015590	CTG	2	6	3694488	3694493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_015590	GTGC	2	8	3694534	3694541	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10085	NC_015590	CCGC	2	8	3694548	3694555	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10086	NC_015590	ATC	2	6	3694614	3694619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10087	NC_015590	GAGCG	2	10	3694633	3694642	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10088	NC_015590	GCG	2	6	3694725	3694730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10089	NC_015590	GCA	2	6	3696528	3696533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10090	NC_015590	ACC	2	6	3696535	3696540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10091	NC_015590	CCTTT	2	10	3696620	3696629	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
10092	NC_015590	GCC	2	6	3696667	3696672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10093	NC_015590	GAC	2	6	3696697	3696702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10094	NC_015590	CGAA	2	8	3696732	3696739	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10095	NC_015590	CGG	2	6	3697031	3697036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10096	NC_015590	T	7	7	3697059	3697065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_015590	CG	3	6	3697122	3697127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10098	NC_015590	GCT	2	6	3697241	3697246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_015590	CCA	2	6	3697317	3697322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10100	NC_015590	GGC	2	6	3697323	3697328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_015590	GCGGA	2	10	3699570	3699579	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10102	NC_015590	ATTT	2	8	3700642	3700649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_015590	CCCT	2	8	3700663	3700670	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10104	NC_015590	AGGG	2	8	3700811	3700818	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_015590	CCG	2	6	3700830	3700835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10107	NC_015590	CT	3	6	3703606	3703611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10108	NC_015590	CAT	2	6	3703641	3703646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10109	NC_015590	CCG	2	6	3703648	3703653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10110	NC_015590	GGC	3	9	3703673	3703681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_015590	CGTC	2	8	3704258	3704265	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10112	NC_015590	GCT	2	6	3704924	3704929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_015590	TCA	2	6	3705809	3705814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_015590	GCCG	2	8	3705842	3705849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10115	NC_015590	TAT	2	6	3705895	3705900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_015590	CGG	2	6	3705961	3705966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10117	NC_015590	TGG	2	6	3706048	3706053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_015590	CATGC	2	10	3706085	3706094	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10119	NC_015590	GGC	2	6	3706182	3706187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10120	NC_015590	TTA	2	6	3706188	3706193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_015590	ATTT	2	8	3706240	3706247	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_015590	CCGG	2	8	3706255	3706262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10123	NC_015590	GATG	2	8	3706286	3706293	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_015590	CCGC	2	8	3706348	3706355	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10125	NC_015590	CGG	2	6	3706806	3706811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10127	NC_015590	ATC	2	6	3706854	3706859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10129	NC_015590	AGG	2	6	3706919	3706924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.