MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Serratia sp. AS12 chromosome

Total Repeats: 181

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015566	TCGCTA	2	12	75910	75921	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015566	CACCAT	2	12	84401	84412	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015566	AAACCT	2	12	95153	95164	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015566	AGGTTT	2	12	95203	95214	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015566	CTGTGC	2	12	103857	103868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015566	CGCTTG	2	12	139454	139465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015566	GAAATG	2	12	144638	144649	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015566	CCTTGT	14	84	160256	160339	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015566	CAGTGA	2	12	224687	224698	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015566	TAAGAC	2	12	257559	257570	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015566	GGAAGG	2	12	262700	262711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015566	TAAGAC	2	12	300242	300253	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015566	TTTGTT	2	12	322532	322543	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015566	AACAGC	2	12	360455	360466	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015566	GGTATC	2	12	360549	360560	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015566	AATTAA	2	12	374188	374199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015566	TGAAAA	2	12	391526	391537	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015566	ATTTTT	2	12	411321	411332	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015566	GGCAGT	2	12	455377	455388	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015566	TTAACC	2	12	708320	708331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015566	CCCACG	2	12	746272	746283	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_015566	GTAACG	2	12	800984	800995	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015566	ATCGGC	2	12	812609	812620	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015566	CGGCAG	2	12	815891	815902	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015566	GTGCGG	2	12	816270	816281	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015566	TAAGAC	2	12	912438	912449	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015566	CTTTCT	2	12	970992	971003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015566	AAAAAG	2	12	971129	971140	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015566	TCATTT	2	12	998182	998193	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015566	TTTGAT	2	12	1012710	1012721	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015566	TCGTTA	2	12	1016139	1016150	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015566	GCCGTC	2	12	1058930	1058941	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015566	TTTTAC	2	12	1125819	1125830	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015566	CTATTA	2	12	1140655	1140666	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015566	GCGCTG	2	12	1212357	1212368	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015566	TTCAAT	2	12	1212531	1212542	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015566	GTCAAT	2	12	1215796	1215807	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015566	ATAAAA	2	12	1231171	1231182	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015566	TGTTGA	2	12	1259833	1259844	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015566	TTGTGC	2	12	1261876	1261887	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015566	GTTAAT	2	12	1277782	1277793	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015566	CTGTCA	2	12	1283413	1283424	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015566	AGTAAA	2	12	1295635	1295646	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015566	TGCTGT	2	12	1347982	1347993	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015566	CCCATC	2	12	1392152	1392163	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_015566	CTGCGT	2	12	1449942	1449953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015566	ATAAAT	2	12	1459096	1459107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015566	AATAAG	2	12	1602882	1602893	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015566	AAGGAG	2	12	1701306	1701317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015566	TTTTGT	2	12	1725723	1725734	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015566	CAAAGG	2	12	1774725	1774736	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015566	CGTTGC	2	12	1801850	1801861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015566	CAATAA	2	12	1801934	1801945	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015566	GTGCCG	2	12	1828333	1828344	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015566	CAAAAA	2	12	1845034	1845045	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015566	TCCTTT	2	12	1858125	1858136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015566	AAAGGG	2	12	1874343	1874354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015566	ACTAAC	2	12	1876383	1876394	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015566	CAAGTG	2	12	1884169	1884180	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015566	TTGGTG	2	12	1921664	1921675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015566	ATAAGG	2	12	1925735	1925746	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015566	CTTTTT	2	12	1940202	1940213	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015566	AGGCTA	2	12	1940416	1940427	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015566	ACGTTA	2	12	1965618	1965629	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015566	GCGGCA	2	12	1990240	1990251	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015566	AACGGC	2	12	2045282	2045293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015566	TGACAA	2	12	2050224	2050235	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_015566	AATTAA	2	12	2052250	2052261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015566	AGCATG	2	12	2066520	2066531	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015566	GCTTTT	2	12	2097175	2097186	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015566	ATAAAA	2	12	2139333	2139344	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015566	CAGAAA	2	12	2161695	2161706	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_015566	CACCCG	2	12	2170525	2170536	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_015566	GTTAAC	2	12	2179725	2179736	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015566	GTTAAC	2	12	2179789	2179800	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015566	TATTTT	2	12	2193802	2193813	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015566	TTTGTT	2	12	2193892	2193903	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015566	ATGAGA	2	12	2216516	2216527	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015566	AAATGA	2	12	2228140	2228151	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015566	TAGCGG	2	12	2237438	2237449	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015566	AGAGGA	2	12	2242670	2242681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015566	CTTTTT	2	12	2246406	2246417	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_015566	GCAAAT	2	12	2290121	2290132	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_015566	CAATAA	2	12	2304812	2304823	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_015566	GGAGCG	2	12	2355728	2355739	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_015566	GCAACG	2	12	2444079	2444090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015566	CGGCTT	2	12	2450070	2450081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015566	CATTTT	2	12	2456240	2456251	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_015566	CTTTTT	2	12	2463110	2463121	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015566	ATTATC	2	12	2467463	2467474	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_015566	TGGCGC	2	12	2468645	2468656	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015566	GTTTCC	2	12	2533518	2533529	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015566	AATAAA	2	12	2586211	2586222	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015566	AATATC	2	12	2587004	2587015	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_015566	TAATTT	2	12	2598349	2598360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015566	CAATTG	2	12	2606550	2606561	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_015566	ACCTTC	2	12	2630659	2630670	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015566	CCGCGC	2	12	2669544	2669555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_015566	AACGTT	2	12	2678686	2678697	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_015566	CTATTA	2	12	2686841	2686852	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_015566	GCTTGC	2	12	2728526	2728537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015566	GTTTGA	2	12	2829402	2829413	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015566	TTTACC	2	12	2856327	2856338	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015566	ACAAAA	2	12	2877687	2877698	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_015566	TAATTT	2	12	2931465	2931476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015566	TGAAGA	2	12	2943608	2943619	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015566	AGTAAT	2	12	3028300	3028311	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015566	AAAAGG	2	12	3039814	3039825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015566	TAAAAA	2	12	3044969	3044980	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015566	CTAAAA	2	12	3082590	3082601	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_015566	AACAAA	2	12	3166869	3166880	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_015566	ATAAAA	2	12	3188036	3188047	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015566	CTACTC	2	12	3198723	3198734	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015566	ATTTTT	2	12	3198757	3198768	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015566	TAAATA	2	12	3200359	3200370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015566	TGCCAA	2	12	3228236	3228247	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015566	AAAGGT	2	12	3252959	3252970	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015566	TTTTAA	2	12	3272110	3272121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015566	GAAAGA	2	12	3361467	3361478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015566	AAAATA	2	12	3373909	3373920	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015566	GAGCCT	2	12	3385823	3385834	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015566	AATGGC	2	12	3434503	3434514	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_015566	CATTTC	2	12	3474347	3474358	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015566	TTATCC	2	12	3475051	3475062	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015566	GGAAAT	2	12	3476330	3476341	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015566	GATCAC	2	12	3523911	3523922	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015566	ATCAGG	2	12	3531184	3531195	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_015566	TTCATT	2	12	3544156	3544167	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_015566	CAGCCG	2	12	3621350	3621361	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015566	AGCGCC	2	12	3744292	3744303	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015566	AGAAAA	2	12	3763642	3763653	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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134	NC_015566	CTCAAC	2	12	3873549	3873560	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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139	NC_015566	TGATAT	2	12	3935047	3935058	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.