MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus parauberis KCTC 11537 chromosome

Total Repeats: 185

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015558	ATTGCA	2	12	12470	12481	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015558	ACTAAT	2	12	22879	22890	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015558	AGCTAT	2	12	60449	60460	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015558	GAAAGT	2	12	72434	72445	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015558	ACTAAT	2	12	80548	80559	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015558	TTCGGG	2	12	81473	81484	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015558	AAACCC	2	12	95871	95882	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015558	GAAGAT	2	12	110643	110654	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015558	AAAATA	2	12	116755	116766	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015558	TAAAAA	2	12	120368	120379	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015558	ATTTGA	2	12	133973	133984	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015558	CAGAAA	2	12	201567	201578	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015558	TGGAAT	2	12	214017	214028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015558	TAGAAA	2	12	249629	249640	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015558	CTGGTG	2	12	269986	269997	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015558	TTTTTA	2	12	277069	277080	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015558	TTGCAG	2	12	281373	281384	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015558	TACTAA	2	12	323907	323918	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015558	TAGATA	2	12	330601	330612	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015558	TAAAAA	2	12	336492	336503	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015558	ATTTGA	2	12	337458	337469	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015558	ACTTTA	2	12	339284	339295	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015558	ATATTG	2	12	358836	358847	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015558	CCGTTT	2	12	366713	366724	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015558	ATATGA	2	12	376847	376858	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015558	ACATTT	2	12	393729	393740	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015558	TTTACT	2	12	411137	411148	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015558	TACTAT	2	12	435232	435243	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015558	AAACTA	2	12	451427	451438	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015558	CTTTCA	2	12	452512	452523	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015558	ACGGCA	2	12	457404	457415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015558	TGGGGC	2	12	466986	466997	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015558	TCTTTT	2	12	503208	503219	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015558	AAATGA	2	12	522199	522210	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015558	TTTTCA	2	12	522491	522502	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015558	TTGATA	2	12	548714	548725	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015558	TCGTTT	2	12	581661	581672	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015558	TTAAAA	2	12	591359	591370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015558	TTTATT	2	12	611658	611669	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015558	TAAAAT	2	12	625162	625173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015558	GGCAAC	2	12	679290	679301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015558	TAGTAT	2	12	689766	689777	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015558	GCATAG	2	12	700791	700802	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015558	AGAAAG	2	12	735854	735865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015558	TGTAAA	2	12	746237	746248	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015558	AATTAA	2	12	755146	755157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015558	GAAATC	2	12	759513	759524	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015558	TAAATT	2	12	764355	764366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015558	CTAAAA	2	12	794714	794725	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015558	TAATGA	2	12	798446	798457	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015558	GAAAAA	2	12	802536	802547	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015558	TATCTT	2	12	811064	811075	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015558	ATATTT	2	12	858032	858043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015558	TTGTTT	2	12	866010	866021	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015558	TTATTT	2	12	882026	882037	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015558	ATCAAA	2	12	885389	885400	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015558	TGTAAA	2	12	889001	889012	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015558	CTTGAT	2	12	895953	895964	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015558	TCAATT	2	12	912145	912156	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015558	AATTGT	2	12	923688	923699	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015558	CCCGAA	2	12	930599	930610	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015558	AAATAT	2	12	951506	951517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015558	GTAAAA	2	12	952887	952898	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015558	AAAAAG	2	12	952954	952965	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015558	ATCCAT	2	12	954057	954068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015558	AAATTT	2	12	954928	954939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015558	ATTATC	2	12	983090	983101	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_015558	TCTTAC	2	12	983200	983211	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015558	GCTAGC	2	12	983520	983531	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015558	TTCATT	2	12	990475	990486	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015558	ACCATA	2	12	995542	995553	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015558	ATTAAA	2	12	995774	995785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015558	TTTTTA	2	12	1020857	1020868	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015558	TTACTA	2	12	1052846	1052857	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015558	TTGAAA	2	12	1086360	1086371	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015558	TAAAAA	2	12	1094142	1094153	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015558	GATTTT	2	12	1150035	1150046	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015558	TAAAAA	2	12	1162875	1162886	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015558	AAGGTG	2	12	1190720	1190731	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015558	ATAAAT	2	12	1213906	1213917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015558	AGAAAA	2	12	1214029	1214040	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015558	TCCATT	2	12	1216950	1216961	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015558	TTCGTC	2	12	1222588	1222599	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015558	GTTCTG	2	12	1235760	1235771	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_015558	CAAAGC	2	12	1254283	1254294	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015558	ACTATG	2	12	1254914	1254925	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_015558	AATAAA	2	12	1284605	1284616	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015558	ATCAGA	2	12	1286051	1286062	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_015558	AACTAA	2	12	1313146	1313157	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015558	TATTAG	2	12	1337684	1337695	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015558	CATACT	2	12	1345406	1345417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015558	CCAGCG	2	12	1365002	1365013	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015558	AATTTC	2	12	1374625	1374636	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_015558	TCATTA	2	12	1391063	1391074	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_015558	AATAAA	2	12	1391966	1391977	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015558	TGAAAG	2	12	1396049	1396060	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015558	TTGTCT	2	12	1396807	1396818	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_015558	GATTTA	2	12	1398273	1398284	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015558	ATGATT	2	12	1399612	1399623	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015558	ACAATG	2	12	1407326	1407337	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_015558	ATGATT	2	12	1407422	1407433	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015558	AAGCGT	2	12	1409405	1409416	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015558	AATTTC	2	12	1412702	1412713	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_015558	ACTCTA	2	12	1424926	1424937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015558	TTTAAT	2	12	1429236	1429247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015558	TTGTCT	2	12	1434388	1434399	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_015558	CTTCTA	2	12	1439085	1439096	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015558	TTTACA	2	12	1439921	1439932	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_015558	TAGCAA	2	12	1440310	1440321	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_015558	AAGCGT	2	12	1447889	1447900	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_015558	TCAAAA	2	12	1479817	1479828	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_015558	CAATCA	2	12	1491554	1491565	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015558	GAAAAA	2	12	1491938	1491949	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015558	TATTTT	2	12	1498239	1498250	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015558	TTCTTT	3	18	1502115	1502132	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_015558	GATATT	2	12	1503301	1503312	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015558	TGTGGT	2	12	1506800	1506811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015558	AATCAG	2	12	1546422	1546433	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_015558	TATTAG	2	12	1553104	1553115	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015558	ATCTTT	2	12	1558294	1558305	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_015558	TTAATA	2	12	1558364	1558375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015558	GCAAAA	2	12	1580696	1580707	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_015558	AACGCT	2	12	1580897	1580908	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015558	ACTATT	2	12	1582661	1582672	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_015558	AAACAA	2	12	1603321	1603332	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_015558	TATTAG	2	12	1603825	1603836	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015558	CAAGAC	2	12	1630089	1630100	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015558	AAAATT	2	12	1652678	1652689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.