MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015436	TACTAT	2	12	1730	1741	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015436	GAAAAA	2	12	8868	8879	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015436	CAAAAG	2	12	37625	37636	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015436	GTTAAC	2	12	75515	75526	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015436	CTTTCT	2	12	104143	104154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015436	GCTGCC	2	12	159288	159299	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015436	AGTAAA	2	12	159375	159386	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015436	TTTCAT	2	12	187414	187425	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015436	GTACGT	2	12	205992	206003	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015436	ATTTTT	2	12	216858	216869	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015436	AGACGA	2	12	239077	239088	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015436	AGGCGA	2	12	245702	245713	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015436	TCTCTT	2	12	246618	246629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015436	GCTCCA	2	12	282122	282133	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015436	CGGTTC	2	12	284618	284629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015436	TACTAT	2	12	295329	295340	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015436	TTCTGT	2	12	357478	357489	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015436	TGTAAT	2	12	357577	357588	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015436	CGTTAA	2	12	381485	381496	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015436	TCCGGT	2	12	389470	389481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015436	CGTTAA	2	12	390810	390821	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015436	TGTCTT	2	12	404756	404767	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015436	GTTTTG	2	12	412108	412119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015436	GAAAAG	2	12	454968	454979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015436	CAGCAT	2	12	476826	476837	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015436	GAAGGA	2	12	494561	494572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015436	AAAGGA	2	12	543743	543754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015436	TTTCAT	2	12	569767	569778	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015436	TTTTGA	2	12	636517	636528	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015436	GTTTCG	2	12	640616	640627	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015436	CCTCCA	2	12	640973	640984	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_015436	TCGCCT	2	12	773115	773126	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015436	TCCTCA	2	12	774157	774168	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015436	TATATG	2	12	874882	874893	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015436	TGGGGC	2	12	879501	879512	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015436	TCGCCT	2	12	883865	883876	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015436	TCCTCA	2	12	884907	884918	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015436	TTTTCT	2	12	885146	885157	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_015436	AAAAAC	2	12	910730	910741	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015436	TACAAA	2	12	940244	940255	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015436	ACAAAA	2	12	1007734	1007745	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_015436	TCTTCA	2	12	1071102	1071113	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015436	CTATTA	2	12	1084001	1084012	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015436	CAAGGG	2	12	1092011	1092022	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015436	CGAAGC	2	12	1117553	1117564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015436	AAAGAC	2	12	1127907	1127918	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015436	GCAAGA	2	12	1236169	1236180	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015436	GAATAG	2	12	1282433	1282444	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015436	AGCGGA	2	12	1293611	1293622	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015436	GGTTTG	2	12	1306257	1306268	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015436	GGATAT	2	12	1309836	1309847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015436	ACGGGC	2	12	1312722	1312733	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015436	TTCTCA	2	12	1314091	1314102	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015436	GGTGAT	2	12	1320581	1320592	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015436	CCGCTT	2	12	1360468	1360479	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015436	GCCGCT	2	12	1360491	1360502	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015436	AAGGAA	2	12	1369799	1369810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015436	AGAAAA	2	12	1381338	1381349	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015436	TTTCTT	2	12	1381468	1381479	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015436	GGAAAA	2	12	1453481	1453492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015436	CAATGA	2	12	1453495	1453506	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015436	CTCTCC	2	12	1463514	1463525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_015436	GCAAAA	2	12	1514015	1514026	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015436	TCCTGA	2	12	1530523	1530534	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015436	GCGGCA	2	12	1544766	1544777	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015436	CCATAT	2	12	1546521	1546532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015436	GCTTGC	2	12	1577651	1577662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015436	TACACA	2	12	1731838	1731849	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015436	TCGGAT	2	12	1742842	1742853	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015436	AGCACC	2	12	1818416	1818427	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015436	CCGTCA	2	12	1830763	1830774	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015436	CTTTCC	2	12	1942807	1942818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015436	GTTTCT	2	12	1948353	1948364	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015436	GAAAAA	2	12	1954114	1954125	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015436	ACATAT	2	12	1979632	1979643	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015436	GAACAA	2	12	1979938	1979949	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_015436	GGGTAT	2	12	2171173	2171184	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.