MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015436	ATTT	2	8	4423	4430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015436	TCCC	2	8	7618	7625	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_015436	CGGA	2	8	7686	7693	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015436	TACA	2	8	7747	7754	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015436	GTAC	2	8	7822	7829	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015436	CATA	2	8	11331	11338	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015436	GAAG	2	8	11433	11440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015436	TGAT	2	8	11458	11465	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015436	TGGA	2	8	11506	11513	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015436	GCAT	2	8	11519	11526	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015436	ATTT	2	8	13516	13523	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015436	GAAA	2	8	13654	13661	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015436	ATAC	2	8	22953	22960	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015436	TTGG	2	8	30410	30417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015436	AATT	2	8	30488	30495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015436	ACAA	2	8	31875	31882	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015436	TAAA	2	8	31935	31942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015436	GGAT	2	8	35425	35432	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015436	ATGG	2	8	35444	35451	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015436	AAAT	2	8	52495	52502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015436	GATG	2	8	52718	52725	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015436	TCGG	2	8	53426	53433	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015436	TCGG	2	8	56077	56084	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015436	AGCG	2	8	58770	58777	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015436	AATC	2	8	65177	65184	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015436	GGGC	2	8	68855	68862	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015436	ATGT	2	8	70141	70148	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015436	CAGG	2	8	75685	75692	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015436	CATC	2	8	80818	80825	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015436	CATA	2	8	90637	90644	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015436	GGCA	2	8	90715	90722	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015436	CTCC	2	8	90747	90754	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_015436	ATGG	2	8	91737	91744	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015436	CTTT	2	8	91759	91766	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015436	ATTT	2	8	95510	95517	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015436	TATT	2	8	95561	95568	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015436	TGCT	2	8	104094	104101	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015436	TTAC	2	8	106895	106902	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015436	AAGG	2	8	111099	111106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015436	TGAT	2	8	115450	115457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015436	ATGA	2	8	116663	116670	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015436	CTTG	2	8	127972	127979	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015436	TTGA	2	8	128888	128895	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015436	GCCC	2	8	137198	137205	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_015436	AATC	2	8	137316	137323	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015436	TCCA	2	8	149852	149859	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015436	CCGC	2	8	149949	149956	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_015436	AAAG	2	8	155015	155022	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015436	TTGT	2	8	157998	158005	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015436	ATTG	2	8	172921	172928	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015436	CATG	2	8	176929	176936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015436	AGGC	2	8	179406	179413	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015436	ATTC	2	8	181283	181290	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015436	TCTT	2	8	183836	183843	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015436	AAAT	2	8	187301	187308	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015436	GTTA	2	8	194183	194190	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015436	GACG	2	8	199074	199081	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015436	AAGG	2	8	205781	205788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015436	GGAG	2	8	215358	215365	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015436	ATTG	2	8	216456	216463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015436	ATAG	2	8	216787	216794	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015436	TGCT	2	8	216901	216908	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015436	GGAT	2	8	218271	218278	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015436	AAAG	2	8	218843	218850	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015436	GAAA	2	8	224688	224695	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015436	GACT	2	8	225499	225506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015436	GACG	2	8	225578	225585	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015436	TTGG	2	8	229341	229348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015436	TGTT	2	8	229419	229426	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015436	ATTT	2	8	231815	231822	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015436	AAAG	2	8	231898	231905	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015436	GTTG	2	8	236103	236110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015436	CTGG	2	8	236131	236138	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015436	GCTG	2	8	236271	236278	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015436	GCTT	2	8	236319	236326	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015436	CTTT	2	8	236408	236415	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015436	AGTC	2	8	239091	239098	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015436	TTGG	2	8	244171	244178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015436	TGCG	2	8	244179	244186	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_015436	GAAC	2	8	245009	245016	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015436	CGGA	2	8	246125	246132	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015436	AGGA	2	8	246584	246591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015436	AGGA	2	8	246857	246864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015436	AAAC	2	8	247682	247689	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015436	TGGA	2	8	247762	247769	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015436	CCAA	2	8	247796	247803	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015436	ATGC	2	8	248575	248582	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015436	GCCT	2	8	249513	249520	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015436	GGAC	2	8	249542	249549	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015436	GCCT	2	8	249636	249643	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015436	GGAG	2	8	249827	249834	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015436	CCAT	2	8	251659	251666	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015436	GATG	2	8	258493	258500	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015436	TGGG	2	8	258778	258785	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015436	TATT	2	8	260494	260501	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015436	CAAA	2	8	260568	260575	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015436	AGGA	2	8	265290	265297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015436	CCAA	2	8	270647	270654	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015436	TTTA	2	8	277305	277312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015436	GACA	2	8	281988	281995	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015436	GCAA	2	8	284474	284481	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015436	TAGG	2	8	291067	291074	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015436	GCTG	2	8	292232	292239	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015436	ATTG	2	8	292627	292634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015436	ATCT	2	8	292723	292730	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015436	TGAA	2	8	293513	293520	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015436	TGAT	2	8	295193	295200	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015436	AATC	2	8	295211	295218	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015436	ATGT	2	8	302112	302119	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015436	TATG	2	8	302385	302392	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015436	TAAA	2	8	302558	302565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015436	GATG	2	8	304139	304146	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015436	ACTT	2	8	304154	304161	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015436	TTCC	2	8	307655	307662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015436	CAAA	2	8	309704	309711	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015436	ACAT	2	8	312216	312223	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015436	ATGT	2	8	312225	312232	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015436	CCTG	2	8	317524	317531	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015436	TCCG	2	8	325906	325913	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015436	GACT	2	8	327252	327259	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015436	TGAA	2	8	327316	327323	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015436	GATT	2	8	331308	331315	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015436	ATGA	2	8	337742	337749	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015436	TTGT	2	8	338087	338094	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015436	TCTT	2	8	343532	343539	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015436	TAAA	2	8	346329	346336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015436	CAGA	2	8	348407	348414	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_015436	TCGT	2	8	355745	355752	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_015436	AAAG	2	8	357134	357141	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015436	GGGA	2	8	357712	357719	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015436	TGAA	2	8	358319	358326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015436	GTAC	2	8	365618	365625	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015436	GAAG	2	8	367437	367444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015436	TGAT	2	8	370691	370698	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015436	GGGA	2	8	373016	373023	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015436	GGAA	2	8	373129	373136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015436	AGAC	2	8	373144	373151	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_015436	TCAT	2	8	376102	376109	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015436	GTTG	2	8	376346	376353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015436	TCAT	2	8	378781	378788	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015436	TCAT	2	8	380999	381006	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015436	GGAG	2	8	387930	387937	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015436	AAGA	2	8	390603	390610	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015436	AAAT	2	8	397831	397838	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015436	TAGA	2	8	402689	402696	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015436	ATTT	2	8	402745	402752	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015436	GAAA	2	8	404690	404697	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015436	TCGT	2	8	411311	411318	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_015436	GAAA	2	8	426636	426643	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015436	GACA	2	8	428598	428605	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_015436	AGAT	2	8	432726	432733	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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