MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 5235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015436	TGT	2	6	614674	614679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_015436	TAG	2	6	614686	614691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_015436	AAG	2	6	614712	614717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_015436	TAAG	2	8	616100	616107	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_015436	GTGA	2	8	617047	617054	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_015436	TCC	2	6	617097	617102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1507	NC_015436	GTT	2	6	617104	617109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_015436	GTA	2	6	621589	621594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_015436	GAGCA	2	10	621675	621684	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1510	NC_015436	A	7	7	621684	621690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_015436	TCC	2	6	621721	621726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_015436	GTA	2	6	621781	621786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_015436	CTTT	2	8	621826	621833	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_015436	CTT	2	6	630241	630246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_015436	AAG	2	6	630303	630308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_015436	CTT	2	6	631255	631260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_015436	ACT	2	6	631278	631283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_015436	CAA	2	6	631287	631292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_015436	TC	3	6	631302	631307	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_015436	AACA	2	8	631351	631358	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1521	NC_015436	CAG	2	6	631370	631375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_015436	AT	3	6	631377	631382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_015436	TA	3	6	632349	632354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_015436	AGCA	2	8	632399	632406	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1525	NC_015436	GTC	2	6	636490	636495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_015436	TTTTGA	2	12	636517	636528	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_015436	T	7	7	636562	636568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_015436	AC	4	8	636613	636620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_015436	AG	3	6	636654	636659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_015436	TCTT	2	8	636770	636777	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1531	NC_015436	CTT	4	12	636775	636786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_015436	T	6	6	636785	636790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_015436	TTG	2	6	636819	636824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_015436	TCC	2	6	637019	637024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1535	NC_015436	ATT	2	6	637038	637043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_015436	A	6	6	637079	637084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_015436	GAT	2	6	637115	637120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_015436	ATA	3	9	637161	637169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_015436	AGG	2	6	637180	637185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_015436	GAC	2	6	639890	639895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_015436	CTG	2	6	640061	640066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_015436	TA	3	6	640136	640141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_015436	A	6	6	640160	640165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_015436	TTCC	2	8	640539	640546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_015436	ATG	2	6	640548	640553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_015436	GTA	2	6	640577	640582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_015436	ATTA	2	8	640584	640591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_015436	GTTTCG	2	12	640616	640627	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1549	NC_015436	CGG	2	6	640630	640635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_015436	GTCAG	2	10	640639	640648	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1551	NC_015436	A	6	6	640700	640705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_015436	AAC	2	6	640809	640814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_015436	TGC	2	6	640936	640941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_015436	CCTCCA	2	12	640973	640984	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_015436	CAC	2	6	641181	641186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1556	NC_015436	CCT	2	6	642216	642221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_015436	TA	3	6	642276	642281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_015436	GAT	2	6	642325	642330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_015436	ATTG	2	8	644643	644650	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_015436	GTT	2	6	645589	645594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_015436	CA	3	6	645627	645632	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1562	NC_015436	AGT	2	6	645654	645659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_015436	GAG	2	6	645681	645686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_015436	CGGT	2	8	645722	645729	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1565	NC_015436	A	7	7	648195	648201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_015436	ACA	2	6	648275	648280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_015436	CGA	2	6	648299	648304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_015436	GATA	2	8	649875	649882	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_015436	CATGG	2	10	649901	649910	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1570	NC_015436	TGA	2	6	649915	649920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_015436	A	7	7	649925	649931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_015436	TAA	2	6	651056	651061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_015436	GAA	2	6	651142	651147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_015436	AAGG	2	8	651160	651167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_015436	GAT	2	6	651540	651545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_015436	TGT	2	6	651553	651558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_015436	TCG	2	6	652701	652706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_015436	GTAC	2	8	652707	652714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1579	NC_015436	ATG	2	6	652767	652772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_015436	TA	3	6	652812	652817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_015436	TA	3	6	652824	652829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_015436	A	6	6	652872	652877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_015436	TGA	2	6	652884	652889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_015436	TGT	2	6	652925	652930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_015436	AAGA	2	8	653647	653654	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_015436	AT	3	6	653672	653677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_015436	ATG	2	6	659786	659791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_015436	ATT	2	6	659823	659828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_015436	AAT	2	6	659830	659835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_015436	A	7	7	659843	659849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_015436	T	6	6	659854	659859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_015436	ATCA	2	8	659898	659905	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_015436	A	6	6	659909	659914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_015436	A	6	6	659927	659932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_015436	A	6	6	659940	659945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_015436	TAC	2	6	659974	659979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_015436	AGT	2	6	660884	660889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_015436	ACT	2	6	660898	660903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_015436	AAGG	2	8	660945	660952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_015436	AT	3	6	663083	663088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_015436	TAA	2	6	663108	663113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_015436	TA	4	8	663149	663156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_015436	TA	3	6	663194	663199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_015436	AAGT	2	8	663212	663219	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_015436	TAA	2	6	663220	663225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_015436	AT	3	6	663241	663246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_015436	TA	3	6	663276	663281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_015436	AAT	2	6	663282	663287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_015436	A	6	6	663336	663341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_015436	TAA	2	6	663348	663353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_015436	TA	3	6	663389	663394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_015436	ATA	2	6	663419	663424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_015436	A	6	6	663494	663499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_015436	A	6	6	663550	663555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_015436	GAA	2	6	663559	663564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_015436	GTG	2	6	663578	663583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_015436	GC	3	6	667878	667883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_015436	T	7	7	667891	667897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_015436	TA	3	6	667924	667929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_015436	GTT	2	6	669167	669172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_015436	AGGA	2	8	669234	669241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_015436	CCT	2	6	672655	672660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1623	NC_015436	CG	3	6	672704	672709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1624	NC_015436	ATT	2	6	672745	672750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_015436	AG	3	6	672769	672774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_015436	T	6	6	672776	672781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_015436	ACA	2	6	672782	672787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_015436	GAA	2	6	672796	672801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_015436	GAG	2	6	677861	677866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_015436	TCCA	2	8	680402	680409	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1631	NC_015436	A	6	6	683873	683878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_015436	GTG	2	6	683879	683884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_015436	TGA	3	9	683888	683896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_015436	T	6	6	684002	684007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_015436	ATGAA	2	10	685951	685960	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_015436	A	6	6	685974	685979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1638	NC_015436	AAG	2	6	691423	691428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1936	NC_015436	A	6	6	798905	798910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1937	NC_015436	TTTG	2	8	798916	798923	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1951	NC_015436	GAA	2	6	810955	810960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1955	NC_015436	CTC	2	6	820932	820937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1957	NC_015436	TCC	2	6	821771	821776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1971	NC_015436	TCT	2	6	829093	829098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1987	NC_015436	ACC	2	6	836354	836359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1996	NC_015436	T	6	6	840144	840149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1997	NC_015436	TA	3	6	840255	840260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1998	NC_015436	ACAT	2	8	840279	840286	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2000	NC_015436	CT	3	6	847474	847479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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