MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 5235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015436	GTC	2	6	342451	342456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_015436	TCC	2	6	343475	343480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_015436	A	6	6	343486	343491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015436	CAT	2	6	343500	343505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_015436	TCTT	2	8	343532	343539	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_015436	TA	3	6	345211	345216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_015436	GC	4	8	345267	345274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_015436	TGA	2	6	346253	346258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_015436	TAAA	2	8	346329	346336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_015436	A	6	6	346379	346384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_015436	AAC	2	6	346402	346407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_015436	ACC	2	6	346464	346469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_015436	CCG	2	6	346515	346520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_015436	CTG	2	6	346665	346670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_015436	GAT	2	6	346677	346682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015436	CCA	2	6	347141	347146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_015436	A	6	6	347215	347220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015436	ATT	2	6	347239	347244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_015436	AGA	2	6	347325	347330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_015436	GA	3	6	347348	347353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015436	CAGA	2	8	348407	348414	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1022	NC_015436	CAT	2	6	352158	352163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_015436	AT	3	6	352162	352167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_015436	ATA	2	6	352177	352182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_015436	TAT	2	6	352197	352202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_015436	CTC	2	6	354620	354625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_015436	TCC	2	6	355496	355501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_015436	T	6	6	355607	355612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_015436	GAA	2	6	355698	355703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_015436	TCGT	2	8	355745	355752	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_015436	A	6	6	355761	355766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015436	GA	3	6	356972	356977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015436	AAAG	2	8	357134	357141	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_015436	TTTTG	2	10	357195	357204	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015436	ATT	2	6	357274	357279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_015436	TCG	2	6	357331	357336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_015436	GAG	2	6	357353	357358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_015436	CGC	2	6	357472	357477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_015436	TTCTGT	2	12	357478	357489	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1040	NC_015436	TTC	2	6	357498	357503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_015436	TTTCT	2	10	357552	357561	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1042	NC_015436	TGTAAT	2	12	357577	357588	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_015436	GGA	2	6	357626	357631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_015436	CTG	2	6	357649	357654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_015436	TCG	2	6	357655	357660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_015436	TGC	2	6	357665	357670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_015436	GCTTT	2	10	357693	357702	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1048	NC_015436	GGGA	2	8	357712	357719	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_015436	AGA	2	6	358270	358275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_015436	TGAA	2	8	358319	358326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_015436	GAA	2	6	358339	358344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_015436	GGA	2	6	358372	358377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_015436	AC	3	6	359455	359460	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_015436	AC	3	6	359467	359472	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_015436	GGA	2	6	359483	359488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_015436	GTAC	2	8	365618	365625	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_015436	AT	3	6	365628	365633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_015436	GAAG	2	8	367437	367444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_015436	TGAT	2	8	370691	370698	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_015436	GA	3	6	370718	370723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_015436	AGT	3	9	370747	370755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_015436	GAT	2	6	370818	370823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_015436	CT	3	6	370838	370843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_015436	CTT	2	6	372998	373003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_015436	GGGA	2	8	373016	373023	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_015436	GGAA	2	8	373129	373136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_015436	AGAC	2	8	373144	373151	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_015436	TCC	2	6	373198	373203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_015436	T	6	6	376067	376072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015436	TCAT	2	8	376102	376109	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1071	NC_015436	AATGA	2	10	376118	376127	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_015436	ATG	2	6	376147	376152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015436	TGA	2	6	376156	376161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015436	TGA	2	6	376182	376187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_015436	GAC	2	6	376338	376343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_015436	GTTG	2	8	376346	376353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_015436	CCT	2	6	378751	378756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_015436	TCAT	2	8	378781	378788	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1079	NC_015436	GTA	2	6	378829	378834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_015436	ATA	2	6	378875	378880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_015436	TCA	2	6	378997	379002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_015436	TTG	2	6	379174	379179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_015436	C	6	6	380969	380974	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1084	NC_015436	TCAT	2	8	380999	381006	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1085	NC_015436	AATGA	2	10	381015	381024	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_015436	ATG	2	6	381044	381049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_015436	TGA	2	6	381053	381058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_015436	ACA	2	6	381239	381244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_015436	T	7	7	381267	381273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_015436	GAT	2	6	381278	381283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_015436	ATC	2	6	381356	381361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_015436	A	6	6	381408	381413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015436	A	7	7	381434	381440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_015436	AAT	2	6	381468	381473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_015436	CGTTAA	2	12	381485	381496	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1096	NC_015436	ATC	2	6	381505	381510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_015436	AGG	2	6	381511	381516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_015436	AGG	2	6	382532	382537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_015436	TCC	2	6	382543	382548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_015436	AAG	2	6	387894	387899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_015436	GGAG	2	8	387930	387937	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_015436	ACCGT	2	10	389443	389452	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1103	NC_015436	GCC	2	6	389457	389462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_015436	TCCGGT	2	12	389470	389481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_015436	AAGA	2	8	390603	390610	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015436	AT	3	6	390651	390656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_015436	AAT	2	6	390721	390726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_015436	TTC	2	6	390730	390735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_015436	GAT	2	6	390790	390795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_015436	CGTTAA	2	12	390810	390821	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1111	NC_015436	TGG	2	6	390841	390846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_015436	GA	3	6	390854	390859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_015436	CGT	2	6	390875	390880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_015436	GA	3	6	392445	392450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_015436	CCA	2	6	393233	393238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_015436	C	6	6	393255	393260	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1117	NC_015436	G	6	6	393278	393283	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_015436	GGC	2	6	393298	393303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_015436	GTC	2	6	393320	393325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_015436	GTT	2	6	396032	396037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015436	ATG	2	6	396097	396102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_015436	TAA	2	6	396123	396128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_015436	AT	3	6	396131	396136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_015436	ATG	2	6	396138	396143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_015436	TTA	2	6	396183	396188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_015436	ATT	2	6	396199	396204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_015436	GA	3	6	396239	396244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_015436	T	6	6	396259	396264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_015436	GGT	2	6	397579	397584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_015436	GCA	2	6	397596	397601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_015436	AGC	2	6	397646	397651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_015436	TCG	2	6	397685	397690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_015436	TGG	2	6	397744	397749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_015436	AAAT	2	8	397831	397838	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1136	NC_015436	GAA	2	6	397861	397866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1413	NC_015436	AT	3	6	539451	539456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_015436	AT	4	8	539471	539478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_015436	GAG	2	6	541243	541248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1416	NC_015436	CGGA	2	8	542340	542347	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1417	NC_015436	T	7	7	542384	542390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_015436	ATGTC	2	10	542432	542441	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1422	NC_015436	GAG	2	6	544410	544415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_015436	TGA	2	6	544865	544870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1426	NC_015436	TAGAG	2	10	545014	545023	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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1430	NC_015436	GGA	2	6	556811	556816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1433	NC_015436	CT	3	6	562021	562026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1434	NC_015436	GGA	2	6	562506	562511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1442	NC_015436	ACAT	2	8	569958	569965	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1447	NC_015436	TTC	2	6	570157	570162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1448	NC_015436	ATA	2	6	570172	570177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1449	NC_015436	TTA	2	6	570186	570191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1455	NC_015436	AGG	2	6	570274	570279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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