MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 5235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015436	CTA	2	6	215430	215435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_015436	TTC	2	6	215451	215456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_015436	TCTTT	2	10	215461	215470	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
504	NC_015436	T	6	6	215498	215503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_015436	TGA	2	6	215506	215511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015436	AT	3	6	215547	215552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015436	AT	3	6	215571	215576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015436	TGG	2	6	215620	215625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_015436	A	9	9	215647	215655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015436	GAT	2	6	215812	215817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_015436	T	6	6	215941	215946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015436	CTT	2	6	215999	216004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_015436	CAA	2	6	216059	216064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_015436	CAA	2	6	216082	216087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_015436	CAA	2	6	216105	216110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_015436	CAA	2	6	216128	216133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_015436	CAA	2	6	216151	216156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_015436	CAA	2	6	216174	216179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_015436	CAA	2	6	216197	216202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_015436	CAA	2	6	216220	216225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_015436	CAA	2	6	216243	216248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_015436	CAA	2	6	216266	216271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_015436	CAA	2	6	216289	216294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_015436	CAA	2	6	216312	216317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_015436	CAA	2	6	216335	216340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_015436	A	6	6	216382	216387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015436	A	6	6	216391	216396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015436	ATTG	2	8	216456	216463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015436	TAC	2	6	216535	216540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_015436	ACTAA	2	10	216554	216563	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
531	NC_015436	A	7	7	216609	216615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015436	GAT	2	6	216647	216652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_015436	AAG	2	6	216709	216714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_015436	TA	4	8	216760	216767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015436	AGT	2	6	216777	216782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015436	ATAG	2	8	216787	216794	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015436	AAT	2	6	216800	216805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_015436	ATTTTT	2	12	216858	216869	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_015436	CTT	2	6	216891	216896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_015436	TGCT	2	8	216901	216908	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
541	NC_015436	TCA	2	6	217007	217012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_015436	A	6	6	217107	217112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_015436	GA	3	6	217142	217147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015436	AGG	2	6	217156	217161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_015436	GGAT	2	8	218271	218278	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015436	GTT	2	6	218814	218819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015436	AAAG	2	8	218843	218850	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
548	NC_015436	ATT	2	6	218912	218917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015436	TAA	2	6	218923	218928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_015436	CGG	2	6	218955	218960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_015436	TAA	2	6	219947	219952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_015436	GAA	2	6	219957	219962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_015436	AGA	2	6	220057	220062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015436	TAA	2	6	220121	220126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015436	GGC	2	6	220163	220168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_015436	A	6	6	220213	220218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015436	TAT	2	6	220235	220240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015436	AGA	2	6	220252	220257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_015436	T	6	6	220295	220300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_015436	ACA	2	6	220312	220317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_015436	GAG	2	6	220357	220362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015436	TCA	2	6	220613	220618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_015436	AGG	2	6	220646	220651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015436	TAA	2	6	220660	220665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015436	CGC	2	6	220674	220679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_015436	ATA	2	6	221957	221962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015436	AT	3	6	221967	221972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015436	GAT	2	6	221973	221978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015436	CAG	2	6	222207	222212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_015436	TCC	2	6	222273	222278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_015436	TAT	2	6	222285	222290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_015436	TGG	2	6	222291	222296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_015436	GC	3	6	223105	223110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
574	NC_015436	C	6	6	223139	223144	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
575	NC_015436	AGG	2	6	223198	223203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_015436	AAC	2	6	223217	223222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_015436	A	6	6	223271	223276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_015436	GAT	2	6	224652	224657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_015436	T	6	6	224673	224678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_015436	GAAA	2	8	224688	224695	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015436	A	6	6	224705	224710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015436	CCT	2	6	225488	225493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_015436	GACT	2	8	225499	225506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
584	NC_015436	CTT	2	6	225525	225530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_015436	GC	3	6	225538	225543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
586	NC_015436	GACG	2	8	225578	225585	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
587	NC_015436	TGG	2	6	225626	225631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_015436	AGG	2	6	225679	225684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_015436	TTGG	2	8	229341	229348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
590	NC_015436	TGG	2	6	229397	229402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_015436	TGTT	2	8	229419	229426	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
592	NC_015436	A	6	6	229444	229449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_015436	AG	3	6	229468	229473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
594	NC_015436	TCC	2	6	229830	229835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_015436	GGC	2	6	229876	229881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_015436	CAG	2	6	229949	229954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_015436	A	6	6	230040	230045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_015436	T	7	7	230061	230067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_015436	T	7	7	230071	230077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_015436	AGG	2	6	230216	230221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_015436	TTA	2	6	231794	231799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_015436	ATTT	2	8	231815	231822	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_015436	TGC	2	6	231869	231874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_015436	AAAG	2	8	231898	231905	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
605	NC_015436	GT	3	6	231927	231932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015436	T	7	7	233623	233629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_015436	CAA	2	6	236042	236047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_015436	GTT	2	6	236059	236064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_015436	TCA	2	6	236075	236080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_015436	GTTG	2	8	236103	236110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015436	CTGG	2	8	236131	236138	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
612	NC_015436	CTG	2	6	236219	236224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_015436	GCTG	2	8	236271	236278	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
614	NC_015436	TGT	2	6	236301	236306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_015436	GCTT	2	8	236319	236326	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
616	NC_015436	CTTT	2	8	236408	236415	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
617	NC_015436	TTC	2	6	236492	236497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_015436	ATC	2	6	236539	236544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_015436	TTC	2	6	236588	236593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_015436	CGG	2	6	236598	236603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_015436	CGG	2	6	236711	236716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_015436	CAG	2	6	236831	236836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_015436	ATG	2	6	236854	236859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015436	CCG	2	6	236875	236880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_015436	GGA	2	6	236912	236917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015436	GA	3	6	237840	237845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
627	NC_015436	AGACGA	2	12	239077	239088	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
628	NC_015436	AGTC	2	8	239091	239098	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
629	NC_015436	TGA	2	6	239158	239163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_015436	CGC	2	6	239209	239214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_015436	T	6	6	239367	239372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_015436	GAG	2	6	239383	239388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
633	NC_015436	G	6	6	242710	242715	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
634	NC_015436	TTGG	2	8	244171	244178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
635	NC_015436	TGCG	2	8	244179	244186	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
636	NC_015436	A	6	6	244211	244216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_015436	CAA	2	6	244285	244290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_015436	C	9	9	244345	244353	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
639	NC_015436	CAA	2	6	244418	244423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_015436	AT	4	8	244431	244438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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645	NC_015436	TTG	2	6	244646	244651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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647	NC_015436	T	6	6	244721	244726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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650	NC_015436	GA	4	8	244750	244757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
651	NC_015436	ATG	2	6	244796	244801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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662	NC_015436	G	7	7	245233	245239	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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672	NC_015436	ATT	2	6	245539	245544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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689	NC_015436	G	6	6	246429	246434	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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762	NC_015436	CCAT	2	8	251659	251666	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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769	NC_015436	AG	3	6	251917	251922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
770	NC_015436	ATG	2	6	253683	253688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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776	NC_015436	TGAGA	2	10	258527	258536	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
777	NC_015436	GCT	2	6	258554	258559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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779	NC_015436	GCG	2	6	258596	258601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
780	NC_015436	GAT	2	6	258636	258641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
781	NC_015436	TTC	2	6	258643	258648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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783	NC_015436	CAT	2	6	259943	259948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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785	NC_015436	ATA	2	6	260479	260484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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788	NC_015436	AT	3	6	260537	260542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
789	NC_015436	CAAA	2	8	260568	260575	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
790	NC_015436	G	6	6	260679	260684	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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794	NC_015436	TTC	2	6	262344	262349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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798	NC_015436	TCC	2	6	265254	265259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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801	NC_015436	GAA	2	6	270624	270629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
802	NC_015436	CCAA	2	8	270647	270654	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
803	NC_015436	ATA	2	6	270738	270743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
804	NC_015436	TAA	2	6	270782	270787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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821	NC_015436	AGAAA	2	10	277262	277271	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
822	NC_015436	TTTA	2	8	277305	277312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
823	NC_015436	TGG	2	6	277352	277357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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857	NC_015436	T	7	7	292418	292424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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863	NC_015436	CAA	2	6	292531	292536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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903	NC_015436	ATGT	2	8	302112	302119	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
904	NC_015436	ATT	2	6	302153	302158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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908	NC_015436	TATG	2	8	302385	302392	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
909	NC_015436	TAT	2	6	302439	302444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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911	NC_015436	TTA	2	6	302486	302491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
912	NC_015436	TGA	2	6	302511	302516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
913	NC_015436	A	6	6	302542	302547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
914	NC_015436	TAAA	2	8	302558	302565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
915	NC_015436	ACA	2	6	302629	302634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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917	NC_015436	GGC	2	6	302735	302740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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951	NC_015436	A	6	6	314288	314293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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982	NC_015436	TCC	2	6	327266	327271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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