MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 5235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015436	ACG	2	6	1895502	1895507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_015436	TGT	2	6	1896292	1896297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_015436	GAAA	2	8	1896328	1896335	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_015436	GTC	2	6	1896339	1896344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_015436	TCA	2	6	1896347	1896352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_015436	TGCA	2	8	1896390	1896397	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4507	NC_015436	AGT	2	6	1896464	1896469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_015436	TGT	2	6	1896481	1896486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_015436	AGA	2	6	1896513	1896518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_015436	TTC	2	6	1896595	1896600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_015436	TGG	2	6	1896625	1896630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_015436	TTG	2	6	1896695	1896700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_015436	ACA	2	6	1896710	1896715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_015436	AGA	2	6	1896744	1896749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_015436	GCC	2	6	1896756	1896761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4516	NC_015436	TCA	2	6	1899506	1899511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_015436	CTT	2	6	1899532	1899537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_015436	CCA	2	6	1899551	1899556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4519	NC_015436	A	6	6	1899572	1899577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_015436	ATTC	2	8	1899613	1899620	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4521	NC_015436	TAC	2	6	1899678	1899683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_015436	AT	3	6	1899723	1899728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_015436	CTG	2	6	1899798	1899803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_015436	AAAG	2	8	1899810	1899817	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_015436	A	6	6	1899894	1899899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_015436	ATTC	2	8	1899959	1899966	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4527	NC_015436	ACAT	2	8	1899971	1899978	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4528	NC_015436	GTG	2	6	1899988	1899993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_015436	GCAC	2	8	1901412	1901419	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4530	NC_015436	GTTT	2	8	1901451	1901458	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_015436	CCT	2	6	1901459	1901464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4532	NC_015436	ATG	2	6	1901501	1901506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_015436	CAAC	2	8	1901510	1901517	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4534	NC_015436	GTCTT	2	10	1901610	1901619	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4535	NC_015436	TGAT	2	8	1901644	1901651	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_015436	CTA	2	6	1901654	1901659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_015436	TC	3	6	1902610	1902615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4538	NC_015436	AG	3	6	1902648	1902653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_015436	GTT	2	6	1902676	1902681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_015436	GAT	2	6	1902714	1902719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_015436	TCA	2	6	1902752	1902757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_015436	TTTG	2	8	1902771	1902778	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_015436	TA	3	6	1902805	1902810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_015436	AAAG	2	8	1902822	1902829	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_015436	AGG	2	6	1902874	1902879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_015436	ATTA	2	8	1903887	1903894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_015436	TAT	2	6	1903937	1903942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_015436	CAC	2	6	1903990	1903995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4549	NC_015436	TAC	2	6	1904015	1904020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_015436	TCA	2	6	1904041	1904046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_015436	TCCG	2	8	1906418	1906425	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4552	NC_015436	ACA	2	6	1906602	1906607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_015436	CTT	2	6	1906671	1906676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_015436	ATG	2	6	1906680	1906685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_015436	CGA	2	6	1909026	1909031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_015436	CCA	2	6	1909032	1909037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4557	NC_015436	CAT	2	6	1909038	1909043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_015436	T	6	6	1912340	1912345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_015436	CAA	2	6	1912372	1912377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_015436	GCTG	2	8	1912387	1912394	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4561	NC_015436	ATG	2	6	1912451	1912456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_015436	AGT	2	6	1912457	1912462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_015436	A	6	6	1912526	1912531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_015436	CAT	2	6	1912541	1912546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_015436	AGA	2	6	1912563	1912568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_015436	TCATT	2	10	1912626	1912635	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4567	NC_015436	GCA	2	6	1912656	1912661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_015436	A	6	6	1912698	1912703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_015436	ATA	2	6	1912735	1912740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_015436	AAAT	2	8	1912741	1912748	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_015436	AATA	2	8	1912756	1912763	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_015436	TA	3	6	1912762	1912767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_015436	AT	3	6	1912771	1912776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_015436	TTGG	2	8	1913961	1913968	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_015436	C	6	6	1914953	1914958	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4576	NC_015436	ATG	2	6	1914963	1914968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_015436	GTT	2	6	1914990	1914995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_015436	TGT	2	6	1915000	1915005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_015436	TGT	2	6	1915011	1915016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_015436	CGGA	2	8	1916213	1916220	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4581	NC_015436	CG	3	6	1916253	1916258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4582	NC_015436	TCA	2	6	1916274	1916279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_015436	CCTT	2	8	1916295	1916302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4584	NC_015436	AAC	2	6	1916383	1916388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_015436	TTG	2	6	1916483	1916488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_015436	CGT	2	6	1916492	1916497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_015436	CAG	2	6	1916500	1916505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_015436	GGC	2	6	1916534	1916539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_015436	GAT	2	6	1916593	1916598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_015436	GGA	2	6	1916602	1916607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_015436	GGC	2	6	1916633	1916638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_015436	GCT	2	6	1916698	1916703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_015436	ATA	2	6	1916717	1916722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_015436	T	6	6	1916793	1916798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_015436	GTCT	2	8	1916800	1916807	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4596	NC_015436	TCT	2	6	1916839	1916844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_015436	ATG	2	6	1916862	1916867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_015436	ATATC	2	10	1916882	1916891	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4599	NC_015436	CG	3	6	1916919	1916924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4600	NC_015436	TTG	2	6	1916975	1916980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_015436	TGA	2	6	1917025	1917030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_015436	ATG	2	6	1917709	1917714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_015436	TGC	2	6	1918918	1918923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_015436	CA	3	6	1918941	1918946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4605	NC_015436	CAT	2	6	1918995	1919000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_015436	TCA	2	6	1919138	1919143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_015436	T	6	6	1919154	1919159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_015436	CAT	3	9	1919167	1919175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_015436	TAGT	2	8	1919386	1919393	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_015436	ATG	2	6	1919394	1919399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_015436	AAGG	2	8	1919420	1919427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_015436	GAC	2	6	1920140	1920145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_015436	TC	3	6	1920160	1920165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4614	NC_015436	TTC	2	6	1926005	1926010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_015436	A	6	6	1926063	1926068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_015436	G	6	6	1928732	1928737	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_015436	AGG	2	6	1928751	1928756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_015436	C	7	7	1929783	1929789	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4619	NC_015436	ATG	2	6	1929797	1929802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_015436	ATG	2	6	1930616	1930621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_015436	AT	3	6	1930625	1930630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_015436	AACA	2	8	1930631	1930638	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4623	NC_015436	GAC	2	6	1932318	1932323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_015436	TGC	2	6	1932500	1932505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_015436	ATG	2	6	1932571	1932576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_015436	GCC	2	6	1932618	1932623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4627	NC_015436	ATG	2	6	1932721	1932726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_015436	ACGG	2	8	1932822	1932829	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4629	NC_015436	AG	3	6	1932839	1932844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4631	NC_015436	TTGTT	2	10	1933013	1933022	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4892	NC_015436	A	6	6	2072470	2072475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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