MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 888

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015433	TTGG	2	8	5798	5805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015433	TTAT	2	8	15933	15940	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015433	GTGA	2	8	19294	19301	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015433	AGCG	2	8	19465	19472	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015433	AGCC	2	8	20347	20354	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015433	GTAA	2	8	20949	20956	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015433	TCAC	2	8	21006	21013	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015433	GCGA	2	8	21105	21112	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015433	ATTC	2	8	21971	21978	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015433	CTAA	2	8	22327	22334	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015433	TAGG	2	8	22983	22990	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015433	AATC	2	8	24231	24238	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015433	CGTG	2	8	25143	25150	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015433	TTTG	2	8	28330	28337	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015433	ATTT	2	8	29397	29404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015433	ATAG	2	8	49235	49242	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015433	AATA	2	8	50603	50610	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015433	GTAA	2	8	50652	50659	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015433	AAAT	2	8	50660	50667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015433	TAAG	2	8	50877	50884	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015433	AAAT	2	8	50926	50933	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015433	GTTT	2	8	51039	51046	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015433	CATT	2	8	52663	52670	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015433	AATA	2	8	52893	52900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015433	ATCT	2	8	52920	52927	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015433	AATA	2	8	58146	58153	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015433	GAAT	2	8	58391	58398	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015433	ATAA	2	8	62324	62331	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015433	TCAG	2	8	68271	68278	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015433	GAGC	2	8	68895	68902	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015433	AGAA	2	8	73343	73350	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015433	TGAG	2	8	73360	73367	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015433	AATC	2	8	73659	73666	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015433	AGAA	2	8	73727	73734	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015433	AAGT	2	8	73913	73920	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015433	AAAC	2	8	80295	80302	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015433	CAAC	2	8	81464	81471	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015433	TAGA	2	8	81609	81616	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015433	TACA	2	8	84383	84390	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015433	AATC	2	8	90064	90071	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015433	AGAA	2	8	90164	90171	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015433	CAAT	2	8	90213	90220	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015433	TGCC	2	8	90562	90569	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015433	ACAT	2	8	90681	90688	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015433	TTAT	2	8	90787	90794	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015433	GTGA	2	8	94148	94155	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015433	AGCG	2	8	94319	94326	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015433	AGCC	2	8	95201	95208	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015433	GTAA	2	8	95803	95810	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015433	TCAC	2	8	95860	95867	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015433	GCGA	2	8	95959	95966	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015433	ATTC	2	8	96825	96832	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015433	CTAA	2	8	97181	97188	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015433	TAGG	2	8	97837	97844	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015433	GCGT	2	8	99327	99334	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015433	TAGT	2	8	101410	101417	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015433	TGCT	2	8	104289	104296	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015433	TTTA	2	8	107314	107321	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015433	ACTT	2	8	107426	107433	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015433	TTAA	2	8	107497	107504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015433	TCTT	2	8	111025	111032	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015433	ATGG	2	8	120445	120452	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015433	TTTC	2	8	124298	124305	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015433	ATAG	2	8	125827	125834	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015433	AACT	2	8	131745	131752	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015433	AATA	2	8	138326	138333	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015433	ACCT	2	8	144885	144892	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015433	AGTG	2	8	145288	145295	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015433	AAAC	2	8	145300	145307	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015433	AGAA	2	8	145526	145533	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015433	AATC	2	8	146279	146286	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015433	TCAG	2	8	146503	146510	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015433	CTCA	2	8	147234	147241	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015433	AAAT	2	8	147250	147257	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015433	TTTG	2	8	147280	147287	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015433	ATAG	2	8	147316	147323	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015433	AAAG	2	8	147461	147468	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015433	ATGA	2	8	150934	150941	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015433	TTAA	2	8	153623	153630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015433	CTTT	2	8	157241	157248	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015433	GTCT	2	8	157286	157293	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015433	TGTC	2	8	157516	157523	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015433	TCAA	2	8	168642	168649	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015433	TAGA	2	8	172030	172037	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015433	TGTA	2	8	173450	173457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015433	GAAA	2	8	173523	173530	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015433	GTAG	2	8	173531	173538	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015433	TTCA	2	8	181544	181551	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015433	TTGT	2	8	183759	183766	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015433	ATTT	2	8	193292	193299	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015433	ATAA	2	8	194160	194167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015433	AAAT	2	8	196789	196796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015433	AAAT	2	8	196850	196857	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015433	TAGT	2	8	198642	198649	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015433	TAAA	2	8	199472	199479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015433	AAAG	2	8	200213	200220	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015433	GTTG	2	8	201365	201372	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015433	ATAA	2	8	202701	202708	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015433	TATT	2	8	206032	206039	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015433	ATAA	2	8	206076	206083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015433	ATAA	2	8	209237	209244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015433	TAAT	2	8	210168	210175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015433	TCAT	2	8	212905	212912	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015433	CAAG	2	8	213916	213923	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015433	TGAC	2	8	214446	214453	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015433	ACCA	2	8	214467	214474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015433	TCAA	2	8	214830	214837	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015433	TTGT	2	8	218566	218573	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015433	GAGT	2	8	221202	221209	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015433	ATTG	2	8	221387	221394	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015433	TTTA	2	8	221433	221440	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015433	GAAT	2	8	222763	222770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015433	ATAG	2	8	227790	227797	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015433	GCAA	2	8	238715	238722	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015433	ACTG	2	8	243690	243697	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015433	GTTT	2	8	248512	248519	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015433	AAGA	2	8	248534	248541	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015433	AAAT	2	8	260871	260878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015433	ATAA	2	8	260900	260907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015433	TAAA	2	8	262859	262866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015433	ATCG	2	8	262878	262885	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015433	TAGT	2	8	265626	265633	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015433	GCTG	2	8	269277	269284	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015433	CAAA	2	8	269401	269408	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015433	GGAA	2	8	270156	270163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015433	CTGC	2	8	270530	270537	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015433	CTGC	2	8	270850	270857	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015433	AGAA	2	8	275275	275282	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015433	CAAA	2	8	275323	275330	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_015433	TAGG	2	8	278309	278316	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015433	TTGT	2	8	278414	278421	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015433	TCTA	2	8	278499	278506	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015433	ATTT	2	8	280061	280068	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015433	GTTT	2	8	280094	280101	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015433	ATTT	2	8	280421	280428	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015433	GTTT	2	8	280454	280461	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015433	GGGC	2	8	282348	282355	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
138	NC_015433	GCGG	2	8	283347	283354	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015433	GTCA	2	8	283396	283403	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015433	GCAG	2	8	283791	283798	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015433	AAAG	2	8	297953	297960	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015433	CAAC	2	8	297976	297983	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_015433	AATC	2	8	300770	300777	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015433	AAAG	2	8	302540	302547	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015433	AAAG	2	8	304674	304681	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015433	CTTT	2	8	306244	306251	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015433	GTCA	2	8	309664	309671	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015433	AGAA	2	8	310663	310670	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015433	AAAG	2	8	315843	315850	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015433	AATT	2	8	324449	324456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015433	CAAT	2	8	327529	327536	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_015433	AAAG	2	8	329953	329960	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_015433	CAAG	2	8	332318	332325	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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