MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 6487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015433	TGGA	2	8	421472	421479	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_015433	T	6	6	421493	421498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_015433	CTT	2	6	425687	425692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_015433	TTA	2	6	426645	426650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_015433	TA	3	6	426656	426661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_015433	A	6	6	426672	426677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_015433	ATA	2	6	426680	426685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_015433	A	7	7	426687	426693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_015433	AAC	2	6	426745	426750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_015433	TAC	2	6	426764	426769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_015433	A	6	6	426780	426785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_015433	TTG	2	6	426792	426797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_015433	GAA	2	6	426838	426843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_015433	T	7	7	428049	428055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_015433	CCT	2	6	428074	428079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1516	NC_015433	CTG	2	6	428112	428117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_015433	T	7	7	428183	428189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_015433	CCT	2	6	428948	428953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_015433	CT	3	6	429768	429773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_015433	TAT	2	6	429785	429790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_015433	A	7	7	429834	429840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_015433	A	8	8	429845	429852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_015433	A	7	7	429855	429861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_015433	GAT	2	6	429871	429876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_015433	GTCAAG	2	12	429897	429908	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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1528	NC_015433	T	6	6	430163	430168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_015433	A	7	7	430545	430551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_015433	AGG	2	6	430602	430607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_015433	A	6	6	430899	430904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_015433	ACA	2	6	431161	431166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_015433	GAA	2	6	431182	431187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_015433	CAGA	2	8	431221	431228	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1535	NC_015433	T	6	6	431235	431240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1537	NC_015433	TGA	2	6	431270	431275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1539	NC_015433	ATTG	2	8	435120	435127	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1541	NC_015433	CTT	2	6	435152	435157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_015433	GAAA	2	8	435185	435192	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_015433	TGAT	2	8	435247	435254	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_015433	ATG	2	6	437980	437985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1546	NC_015433	A	7	7	438036	438042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_015433	A	6	6	438044	438049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_015433	GTG	2	6	438050	438055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_015433	GTTA	2	8	438105	438112	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_015433	CAT	2	6	438113	438118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_015433	TA	3	6	438120	438125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_015433	TAA	2	6	438137	438142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_015433	A	7	7	438192	438198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_015433	GAAT	2	8	438248	438255	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_015433	AGA	2	6	438975	438980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_015433	A	6	6	439016	439021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1559	NC_015433	A	6	6	439452	439457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1562	NC_015433	ATC	2	6	439995	440000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1564	NC_015433	CTCG	2	8	440413	440420	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1565	NC_015433	T	8	8	440447	440454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_015433	A	6	6	440495	440500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1568	NC_015433	GATA	2	8	443351	443358	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1572	NC_015433	A	6	6	443884	443889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_015433	TAG	2	6	444019	444024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1575	NC_015433	AAT	2	6	444060	444065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1590	NC_015433	TAG	2	6	445165	445170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1592	NC_015433	TA	3	6	445228	445233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_015433	A	8	8	445240	445247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_015433	T	7	7	445918	445924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_015433	AATA	2	8	445946	445953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1604	NC_015433	A	7	7	448651	448657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_015433	AGA	2	6	448686	448691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_015433	A	7	7	448741	448747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_015433	A	6	6	448753	448758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_015433	AGA	2	6	448840	448845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1616	NC_015433	AGA	2	6	449410	449415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1619	NC_015433	AT	3	6	449656	449661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_015433	GGA	2	6	449662	449667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_015433	CT	3	6	449687	449692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1632	NC_015433	AC	3	6	450346	450351	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1635	NC_015433	GAT	2	6	450432	450437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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