MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 6487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015433	CTT	2	6	283029	283034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_015433	T	6	6	283054	283059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_015433	TGA	3	9	283097	283105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015433	CAGGG	2	10	283301	283310	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1005	NC_015433	GCT	2	6	283329	283334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_015433	GCGG	2	8	283347	283354	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_015433	GTCA	2	8	283396	283403	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_015433	AGG	2	6	283502	283507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_015433	CTTGG	2	10	283512	283521	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1010	NC_015433	GTT	2	6	283579	283584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_015433	GAC	2	6	283588	283593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_015433	TGG	2	6	283736	283741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_015433	TAT	3	9	283758	283766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_015433	GCAG	2	8	283791	283798	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_015433	CTG	2	6	283817	283822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_015433	CAA	2	6	283891	283896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_015433	GGA	2	6	283905	283910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015433	TA	3	6	289547	289552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_015433	TAT	2	6	289767	289772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_015433	CAG	2	6	289800	289805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_015433	TA	3	6	290075	290080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_015433	GT	3	6	290158	290163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015433	TAG	2	6	290190	290195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_015433	AG	3	6	294360	294365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_015433	CAA	2	6	294388	294393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_015433	A	6	6	294405	294410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_015433	AAAG	2	8	297953	297960	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_015433	CAAC	2	8	297976	297983	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_015433	ATA	2	6	297986	297991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_015433	TAGAAA	2	12	298024	298035	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_015433	TAGCCG	2	12	298063	298074	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_015433	AGA	2	6	298078	298083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015433	ATAAA	2	10	298157	298166	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_015433	AGA	2	6	298176	298181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015433	GA	3	6	298459	298464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_015433	T	6	6	299838	299843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_015433	T	7	7	300605	300611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_015433	T	6	6	300678	300683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_015433	T	6	6	300706	300711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_015433	TA	3	6	300728	300733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_015433	GCTAAA	2	12	300758	300769	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1042	NC_015433	AATC	2	8	300770	300777	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_015433	TAT	2	6	301926	301931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_015433	TAA	2	6	301941	301946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_015433	AAC	2	6	301964	301969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_015433	A	7	7	302500	302506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_015433	ACT	2	6	302531	302536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_015433	AAAG	2	8	302540	302547	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_015433	AC	3	6	302565	302570	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_015433	CTT	2	6	304474	304479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_015433	TAG	2	6	304486	304491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_015433	GAAAG	2	10	304628	304637	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_015433	AAAG	2	8	304674	304681	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_015433	CCT	2	6	304736	304741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_015433	GT	3	6	304743	304748	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_015433	AC	3	6	304752	304757	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_015433	GAAAG	2	10	304798	304807	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_015433	ACT	2	6	306099	306104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_015433	CTTT	2	8	306244	306251	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_015433	T	6	6	306272	306277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_015433	T	6	6	308635	308640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_015433	ATT	2	6	308648	308653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_015433	TGG	2	6	308690	308695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015433	A	6	6	308713	308718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_015433	GTCA	2	8	309664	309671	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1066	NC_015433	T	6	6	310418	310423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_015433	AGAA	2	8	310663	310670	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_015433	AG	3	6	310677	310682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_015433	T	6	6	310763	310768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015433	CTA	2	6	310769	310774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_015433	T	6	6	310904	310909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_015433	AGT	2	6	312335	312340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015433	ACT	2	6	312370	312375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_015433	ATT	3	9	313791	313799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_015433	ATA	2	6	313808	313813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_015433	ATT	2	6	313825	313830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_015433	AAT	2	6	313838	313843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_015433	T	7	7	313860	313866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_015433	A	7	7	313867	313873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_015433	AAT	2	6	313875	313880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_015433	ATT	2	6	315804	315809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_015433	AAAG	2	8	315843	315850	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_015433	TAA	2	6	315863	315868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_015433	A	7	7	315906	315912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_015433	TCC	2	6	316403	316408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_015433	TTA	2	6	316414	316419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_015433	AGT	2	6	319717	319722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_015433	TTC	2	6	319748	319753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_015433	GAA	2	6	319787	319792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_015433	AG	3	6	319872	319877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_015433	T	7	7	319882	319888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_015433	AAG	2	6	319912	319917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015433	TTA	2	6	320419	320424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_015433	ATG	2	6	324425	324430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_015433	AATT	2	8	324449	324456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_015433	GAG	2	6	324517	324522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_015433	CGC	2	6	324537	324542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_015433	ATT	2	6	324575	324580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_015433	AG	3	6	324591	324596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_015433	A	6	6	324611	324616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_015433	TGGTC	2	10	324659	324668	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1102	NC_015433	A	6	6	325286	325291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_015433	AAC	2	6	326464	326469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_015433	CAAT	2	8	327529	327536	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_015433	T	6	6	329023	329028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015433	ATC	2	6	329034	329039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_015433	AAAG	2	8	329953	329960	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_015433	T	7	7	329968	329974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_015433	A	7	7	329975	329981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_015433	AGG	2	6	330028	330033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_015433	A	6	6	330988	330993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_015433	GAA	2	6	330995	331000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_015433	A	6	6	330999	331004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_015433	GTT	2	6	331008	331013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_015433	A	7	7	331090	331096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_015433	GT	3	6	331099	331104	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_015433	ACT	2	6	331255	331260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_015433	CAT	2	6	331343	331348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_015433	CTATCT	2	12	331394	331405	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_015433	AGA	2	6	331442	331447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015433	TCT	2	6	331470	331475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_015433	GCA	2	6	331494	331499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_015433	ACAGA	2	10	331522	331531	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1124	NC_015433	A	6	6	331623	331628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_015433	GCT	2	6	331653	331658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_015433	ATA	2	6	331723	331728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_015433	ACA	2	6	331740	331745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_015433	GAA	2	6	331862	331867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_015433	GCA	2	6	331872	331877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_015433	AGA	2	6	331940	331945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_015433	TCT	2	6	331986	331991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_015433	CAAG	2	8	331998	332005	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_015433	TGA	2	6	332240	332245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_015433	CAAG	2	8	332318	332325	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1135	NC_015433	GCC	2	6	332363	332368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1136	NC_015433	AAG	2	6	332452	332457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_015433	GTT	2	6	332517	332522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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