MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015152	ATTGGA	2	12	20724	20735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015152	GGTTAA	2	12	117742	117753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015152	CTTTTT	2	12	194148	194159	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015152	ATATCA	2	12	194714	194725	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015152	ATCTCT	2	12	227427	227438	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015152	AAGTAA	2	12	312169	312180	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015152	GGGGGA	2	12	318079	318090	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015152	AAACCA	2	12	326930	326941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015152	TAGGGG	2	12	336623	336634	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015152	ACTTAC	2	12	339526	339537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015152	TAATAG	2	12	460129	460140	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015152	TTGCGC	2	12	607974	607985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015152	TTAACA	2	12	640669	640680	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015152	TAAAAA	2	12	651028	651039	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015152	TTTCTC	2	12	652743	652754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015152	GTATGA	2	12	669484	669495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015152	AAAAGC	2	12	782499	782510	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015152	ATTCAA	2	12	784103	784114	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015152	TATCGC	2	12	885892	885903	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015152	ACTTAT	2	12	936241	936252	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015152	ATAGTA	2	12	981107	981118	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015152	TTCCAT	2	12	1059219	1059230	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015152	GTTTTC	2	12	1145865	1145876	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015152	ACCAAA	2	12	1172310	1172321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015152	GCTCTT	2	12	1172654	1172665	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015152	CAGCCG	2	12	1240072	1240083	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015152	ACATGC	2	12	1240420	1240431	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015152	GGCGAG	2	12	1241689	1241700	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015152	CCTGCA	2	12	1276690	1276701	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015152	AAGAGA	2	12	1348824	1348835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015152	CAGCCG	2	12	1350551	1350562	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015152	ACATGC	2	12	1350933	1350944	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015152	GGCGAG	2	12	1352201	1352212	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015152	CTTCGC	2	12	1392400	1392411	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015152	CTATAG	2	12	1463481	1463492	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015152	CGAAAC	2	12	1540555	1540566	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015152	TTTCAT	2	12	1645514	1645525	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015152	TTTATA	2	12	1712141	1712152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015152	TTGTTT	2	12	1740369	1740380	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015152	CTTTTT	2	12	1802804	1802815	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015152	GATGCA	2	12	1859619	1859630	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_015152	ATTTCA	2	12	1884147	1884158	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015152	CCAAGG	2	12	1976875	1976886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015152	AGGGGG	2	12	2013325	2013336	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015152	TTTTTC	2	12	2049836	2049847	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015152	CAGGCG	2	12	2165516	2165527	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015152	CTGTCC	2	12	2219722	2219733	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015152	GCAAGA	2	12	2232350	2232361	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015152	GGTTAT	2	12	2283838	2283849	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015152	AACTAG	2	12	2352389	2352400	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015152	CGGCTC	2	12	2366486	2366497	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015152	AAATAT	2	12	2382293	2382304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015152	CAGGAG	2	12	2399232	2399243	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015152	AAACCG	2	12	2449893	2449904	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015152	AAATCT	2	12	2533806	2533817	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015152	ATTATA	2	12	2540985	2540996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015152	AAAATA	2	12	2557670	2557681	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015152	AGGGGG	2	12	2559713	2559724	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015152	TTACTA	2	12	2588432	2588443	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015152	ACATCC	2	12	2630982	2630993	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015152	GCAATG	2	12	2645600	2645611	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015152	TGCCTT	2	12	2789780	2789791	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015152	TTGTAA	2	12	2831327	2831338	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015152	AAGACT	2	12	3089360	3089371	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015152	CTCGCC	2	12	3109697	3109708	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_015152	TGCATG	2	12	3110964	3110975	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_015152	CGGCTG	2	12	3111347	3111358	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015152	TCTTTC	2	12	3113074	3113085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015152	CTCGCC	2	12	3119563	3119574	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_015152	TGCATG	2	12	3120830	3120841	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015152	CGGCTG	2	12	3121238	3121249	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015152	TTTCAA	2	12	3258159	3258170	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_015152	TGTCCT	2	12	3277869	3277880	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015152	AAGAAA	2	12	3286042	3286053	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.