MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 6183

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015152	GA	3	6	493829	493834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_015152	TGG	2	6	499079	499084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_015152	ATT	2	6	499095	499100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015152	TAA	2	6	499107	499112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_015152	AG	3	6	499623	499628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015152	AGG	2	6	499631	499636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_015152	TTG	2	6	501561	501566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_015152	GTC	2	6	501704	501709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_015152	AG	3	6	503075	503080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_015152	CAA	2	6	504337	504342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_015152	A	8	8	504350	504357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_015152	GT	3	6	504415	504420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_015152	TCC	2	6	504876	504881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_015152	GTA	2	6	504892	504897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_015152	TGAG	2	8	504968	504975	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015152	TGAG	2	8	506412	506419	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_015152	AT	3	6	506455	506460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015152	TAA	2	6	506464	506469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_015152	AAAG	2	8	506490	506497	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_015152	CCT	2	6	512084	512089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_015152	ACATA	2	10	512095	512104	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1022	NC_015152	ATT	2	6	512113	512118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015152	TTA	2	6	512165	512170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_015152	CATCC	2	10	512200	512209	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1025	NC_015152	CATA	2	8	512211	512218	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_015152	TAA	2	6	517486	517491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_015152	T	6	6	522284	522289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_015152	CTTT	2	8	522302	522309	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1029	NC_015152	TCC	2	6	522334	522339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_015152	T	6	6	522346	522351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_015152	TAT	2	6	522379	522384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015152	AGG	2	6	522386	522391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015152	TTAG	2	8	523423	523430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_015152	T	9	9	525398	525406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015152	TGA	2	6	525465	525470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_015152	AGCAT	2	10	525475	525484	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1037	NC_015152	TA	4	8	525495	525502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_015152	GAA	3	9	525531	525539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_015152	T	7	7	525575	525581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_015152	AGG	2	6	525627	525632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_015152	TTG	2	6	526643	526648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_015152	CTT	3	9	526690	526698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_015152	AG	3	6	526721	526726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_015152	GAG	2	6	528572	528577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_015152	TTG	2	6	529304	529309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_015152	A	6	6	529314	529319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_015152	T	6	6	529334	529339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_015152	CTCA	2	8	533890	533897	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_015152	AGG	2	6	533920	533925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_015152	TAC	2	6	536024	536029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_015152	CAT	2	6	536040	536045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_015152	TCC	2	6	539783	539788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_015152	CAG	2	6	539824	539829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_015152	TG	4	8	540975	540982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_015152	CTA	2	6	545056	545061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_015152	ATTT	2	8	545105	545112	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_015152	ATG	2	6	545135	545140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_015152	CTT	2	6	545182	545187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_015152	TTTCT	2	10	545194	545203	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1060	NC_015152	GGT	2	6	546359	546364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_015152	AGG	3	9	546501	546509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_015152	CCT	2	6	546523	546528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_015152	AT	3	6	546556	546561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015152	TAA	2	6	546583	546588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_015152	GTT	2	6	546592	546597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_015152	TGT	2	6	547384	547389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_015152	TAA	2	6	547434	547439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_015152	A	6	6	547465	547470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_015152	GAG	2	6	551403	551408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015152	ACAT	2	8	555917	555924	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1071	NC_015152	AAT	2	6	555952	555957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_015152	TTA	2	6	555990	555995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015152	TAA	2	6	556002	556007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015152	ATT	2	6	556033	556038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_015152	GAT	2	6	556043	556048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_015152	AT	3	6	556083	556088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_015152	TGCAA	2	10	556156	556165	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1078	NC_015152	AGG	2	6	556184	556189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_015152	TC	3	6	557505	557510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_015152	TCA	2	6	557544	557549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_015152	AAG	2	6	566038	566043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_015152	CAA	2	6	567113	567118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_015152	ATA	2	6	567180	567185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_015152	TTC	2	6	567212	567217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_015152	GCA	2	6	567220	567225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_015152	TG	3	6	567295	567300	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_015152	AG	3	6	568463	568468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_015152	CA	3	6	568525	568530	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_015152	ATG	2	6	568535	568540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_015152	CCT	2	6	572896	572901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_015152	AGTAT	2	10	575227	575236	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_015152	A	7	7	575238	575244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015152	AAAT	2	8	575260	575267	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_015152	A	6	6	575292	575297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_015152	AGTGT	2	10	575336	575345	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_015152	CCGA	2	8	576646	576653	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_015152	TCGG	2	8	576659	576666	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1098	NC_015152	AGA	2	6	579365	579370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_015152	GCA	2	6	579418	579423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_015152	CTT	2	6	580700	580705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_015152	AAG	2	6	583132	583137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_015152	TGCA	2	8	583147	583154	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1103	NC_015152	GGAG	2	8	583178	583185	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_015152	AT	3	6	585026	585031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_015152	AGA	2	6	585129	585134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015152	TGT	2	6	585136	585141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_015152	A	6	6	585162	585167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_015152	TGT	2	6	585168	585173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_015152	ACA	3	9	585200	585208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_015152	CTTT	2	8	586336	586343	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1111	NC_015152	CTC	2	6	586377	586382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_015152	GAT	2	6	588049	588054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_015152	CATC	2	8	588104	588111	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_015152	GTAT	2	8	588988	588995	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_015152	TGC	2	6	589032	589037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_015152	TC	3	6	589678	589683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_015152	TCA	2	6	592367	592372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_015152	TTG	2	6	592388	592393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_015152	TGT	2	6	592408	592413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_015152	CAA	2	6	592473	592478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_015152	A	6	6	596095	596100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_015152	T	6	6	597320	597325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_015152	TTG	2	6	597356	597361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_015152	CTT	2	6	597392	597397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_015152	A	6	6	597404	597409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_015152	GAA	2	6	599752	599757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_015152	GTG	2	6	599800	599805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_015152	TTGA	2	8	600412	600419	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_015152	TCC	2	6	603475	603480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_015152	TAA	2	6	603778	603783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_015152	GGTTA	2	10	603879	603888	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_015152	ATC	2	6	603939	603944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_015152	GTT	2	6	603984	603989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_015152	TTG	2	6	604081	604086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_015152	T	6	6	606453	606458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_015152	TGT	2	6	606579	606584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_015152	T	7	7	606584	606590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_015152	T	8	8	606670	606677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1259	NC_015152	CTTT	2	8	640474	640481	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1260	NC_015152	CAA	2	6	640503	640508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1261	NC_015152	CTAT	2	8	640547	640554	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1262	NC_015152	TCT	2	6	640572	640577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1268	NC_015152	GAT	2	6	640740	640745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1270	NC_015152	CATGA	2	10	640803	640812	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1277	NC_015152	GAT	2	6	641277	641282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1280	NC_015152	GCATG	2	10	642197	642206	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1282	NC_015152	TGC	2	6	642356	642361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1289	NC_015152	TC	3	6	646261	646266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1290	NC_015152	GAAA	3	12	646269	646280	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1292	NC_015152	GTA	2	6	646455	646460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1294	NC_015152	GATT	2	8	647528	647535	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1411	NC_015152	T	9	9	669293	669301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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