MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus pseudintermedius HKU10-03 chromosome

Total Repeats: 568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014925	CTTTT	2	10	6294	6303	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014925	TTTAT	2	10	6529	6538	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014925	TAAGC	2	10	28846	28855	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014925	GACAA	2	10	28877	28886	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014925	TAAAT	2	10	33116	33125	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014925	TTTAA	2	10	42724	42733	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014925	AATTT	2	10	48686	48695	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014925	TTAAA	2	10	56189	56198	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014925	GATTG	2	10	63296	63305	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014925	CATTT	2	10	64747	64756	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014925	AAAAG	2	10	64829	64838	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014925	GCAAT	2	10	70707	70716	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014925	ATTTT	2	10	73524	73533	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014925	AAAGT	2	10	79703	79712	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014925	AAATT	2	10	89846	89855	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014925	ATTAA	2	10	89911	89920	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014925	TAAAA	2	10	95087	95096	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014925	TAAAT	2	10	115848	115857	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014925	TATAA	2	10	126171	126180	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014925	TTTAT	2	10	135510	135519	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014925	AGAAA	2	10	136700	136709	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014925	TATGT	2	10	148932	148941	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014925	GCACA	2	10	150810	150819	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_014925	ACATT	2	10	153237	153246	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014925	ATGTA	2	10	153597	153606	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014925	CTTTT	2	10	157052	157061	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014925	TCGTG	2	10	158628	158637	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014925	GAGAT	2	10	162292	162301	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014925	ATAAA	2	10	163126	163135	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014925	TGTAT	2	10	163229	163238	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014925	TAAAA	2	10	163262	163271	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014925	AGATA	2	10	170631	170640	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014925	TACTT	2	10	172895	172904	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014925	GTATG	2	10	173000	173009	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014925	CAAAA	2	10	180260	180269	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014925	ATTTA	2	10	195972	195981	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014925	TCGTG	2	10	204234	204243	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014925	GAGAT	2	10	207899	207908	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014925	GTCGA	2	10	208319	208328	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014925	TCGTG	2	10	209540	209549	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014925	GAGAT	2	10	213291	213300	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014925	GAGAG	2	10	226539	226548	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014925	TATAA	2	10	235917	235926	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014925	GAATA	2	10	237478	237487	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014925	TAGAA	2	10	246613	246622	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014925	TTGAT	2	10	260201	260210	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014925	TCTCT	2	10	260300	260309	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_014925	ATATT	2	10	267343	267352	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014925	TTTTA	2	10	270528	270537	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014925	TAAAA	2	10	270547	270556	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014925	TTTCA	2	10	271473	271482	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014925	GAAAG	2	10	285674	285683	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014925	TAAAG	2	10	285847	285856	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014925	ATTTT	2	10	289301	289310	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014925	TTGAA	2	10	289537	289546	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014925	TAAGA	2	10	290861	290870	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014925	AAAGA	2	10	301107	301116	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014925	TACTA	2	10	301207	301216	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014925	CTTAA	2	10	305132	305141	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014925	AATAA	2	10	305576	305585	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014925	TAGCG	2	10	308227	308236	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014925	TAAAG	2	10	313170	313179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014925	CATAA	2	10	315750	315759	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014925	GAATT	2	10	316447	316456	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014925	CCATC	2	10	323482	323491	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
66	NC_014925	TATAT	2	10	331019	331028	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014925	TTTAT	2	10	331059	331068	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014925	TCACA	2	10	333452	333461	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_014925	TTTAT	2	10	334260	334269	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014925	AAAGT	2	10	337375	337384	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014925	GATAA	2	10	343722	343731	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014925	TTATT	2	10	347165	347174	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014925	TTTAC	2	10	348688	348697	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014925	TTATA	2	10	349217	349226	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014925	CATAT	2	10	350362	350371	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014925	TTCGT	2	10	362586	362595	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_014925	ACGCA	2	10	379777	379786	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_014925	ATTGA	2	10	379937	379946	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014925	TGAAA	2	10	381833	381842	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014925	GTTTT	2	10	382925	382934	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014925	TTTAT	2	10	387597	387606	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014925	ATTTT	2	10	395462	395471	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014925	CATAT	2	10	396436	396445	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014925	GAAAG	2	10	403626	403635	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014925	TTAAT	2	10	405521	405530	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014925	TAAAA	2	10	408295	408304	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014925	CGTTT	2	10	411111	411120	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014925	ATCAC	2	10	411280	411289	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_014925	AAAAT	2	10	411500	411509	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014925	ATTTG	2	10	414661	414670	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014925	AAGGA	2	10	414779	414788	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014925	GATGT	2	10	419506	419515	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014925	ATAAA	2	10	424506	424515	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014925	ACCCA	2	10	424919	424928	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
95	NC_014925	AATTG	2	10	426131	426140	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014925	CTTTA	2	10	426520	426529	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_014925	CTATG	2	10	434716	434725	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_014925	ATTGA	2	10	443273	443282	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014925	GATAT	2	10	451119	451128	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014925	CAATT	2	10	457609	457618	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_014925	AAGTA	2	10	462253	462262	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014925	TAAAG	2	10	465208	465217	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014925	GACTG	2	10	477690	477699	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_014925	TATTT	2	10	500440	500449	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014925	ATAAA	2	10	501993	502002	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014925	TTTAA	2	10	502084	502093	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014925	ATGAT	2	10	508420	508429	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014925	TTTTG	2	10	518639	518648	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014925	GAGTT	2	10	524229	524238	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014925	TAAAA	2	10	527513	527522	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014925	CAAAA	2	10	528174	528183	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014925	TAGAA	2	10	528424	528433	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014925	ACATC	2	10	533059	533068	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_014925	ATTGA	2	10	534319	534328	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014925	ATAGA	2	10	541415	541424	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014925	TGATA	2	10	545116	545125	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014925	TTTTC	2	10	555813	555822	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_014925	ATATT	2	10	561576	561585	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014925	ATATT	2	10	561848	561857	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014925	ATATT	2	10	564578	564587	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014925	TACAA	2	10	564811	564820	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014925	TCGTG	2	10	567281	567290	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_014925	TATCA	2	10	567357	567366	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014925	TTATT	2	10	568066	568075	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014925	TAAAC	2	10	577923	577932	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_014925	TCATA	2	10	585818	585827	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014925	CAAAC	2	10	587283	587292	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_014925	TAACT	2	10	588868	588877	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014925	AAATA	2	10	599323	599332	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014925	CAAAA	2	10	599335	599344	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_014925	CACTT	2	10	607448	607457	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_014925	AGTGA	2	10	618776	618785	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014925	AAAAT	2	10	621727	621736	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014925	GAAAC	2	10	622897	622906	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_014925	AGTTT	2	10	623640	623649	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014925	CAATC	2	10	637845	637854	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_014925	GCATA	2	10	638741	638750	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_014925	ATTTG	2	10	643854	643863	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014925	TATGC	2	10	644121	644130	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_014925	ATGAA	2	10	644192	644201	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014925	TAACT	2	10	653971	653980	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_014925	TAAAG	2	10	653998	654007	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014925	GTATT	2	10	657664	657673	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014925	TAAAA	2	10	658923	658932	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014925	GTTAA	2	10	664467	664476	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014925	GATAA	2	10	666020	666029	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014925	CTTTA	2	10	674513	674522	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_014925	TGAAA	2	10	676817	676826	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_014925	ATTAT	2	10	743544	743553	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_014925	AATGA	2	10	747729	747738	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_014925	TTTAC	2	10	838863	838872	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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278	NC_014925	TATCC	2	10	1372114	1372123	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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280	NC_014925	ATTCA	2	10	1387619	1387628	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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282	NC_014925	TGATT	2	10	1395889	1395898	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
283	NC_014925	TTATA	2	10	1412940	1412949	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_014925	AACTT	2	10	1428048	1428057	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
286	NC_014925	AACTA	2	10	1434964	1434973	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
287	NC_014925	TAATA	2	10	1436712	1436721	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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424	NC_014925	CAAAA	2	10	2038493	2038502	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
425	NC_014925	CCACT	2	10	2038522	2038531	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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