MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus pseudintermedius HKU10-03 chromosome

Total Repeats: 5494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014925	TAA	2	6	78	83	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014925	TGT	2	6	254	259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014925	ATC	2	6	261	266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014925	CAA	2	6	341	346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014925	GAT	2	6	388	393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014925	GTA	2	6	405	410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014925	TAG	2	6	438	443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014925	TTA	2	6	463	468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014925	GAA	2	6	832	837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014925	TAA	2	6	1255	1260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014925	TAA	2	6	6357	6362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014925	TTA	2	6	6424	6429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014925	GAG	2	6	6518	6523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014925	TTA	2	6	6842	6847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014925	TAG	2	6	6860	6865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014925	TAT	2	6	6866	6871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014925	TCC	2	6	7298	7303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_014925	ATG	2	6	7359	7364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014925	TGG	2	6	7372	7377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014925	ATA	2	6	7462	7467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014925	GGA	2	6	7541	7546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014925	CCT	2	6	10876	10881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_014925	GAG	2	6	11019	11024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014925	TCA	2	6	11339	11344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014925	ATT	2	6	12323	12328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014925	TTC	2	6	12370	12375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014925	TAT	2	6	12405	12410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014925	AGG	2	6	12458	12463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014925	TAG	2	6	12491	12496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014925	TTA	3	9	12593	12601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014925	ATT	2	6	12654	12659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014925	AGT	2	6	12666	12671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014925	TCA	2	6	12692	12697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014925	ATA	2	6	12780	12785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014925	AAT	2	6	12904	12909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014925	CTT	2	6	15673	15678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014925	AAC	2	6	15741	15746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014925	TCG	2	6	15921	15926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014925	CAT	2	6	16135	16140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014925	ATT	2	6	16166	16171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014925	CCT	2	6	22647	22652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_014925	ACC	2	6	22728	22733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_014925	GAT	2	6	24065	24070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014925	AAC	2	6	26355	26360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014925	ACA	2	6	26451	26456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014925	ATG	2	6	26459	26464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014925	CTT	2	6	26485	26490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014925	ACT	2	6	26493	26498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014925	TTA	2	6	26500	26505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014925	GAA	2	6	26531	26536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014925	AAT	2	6	26621	26626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014925	ATG	2	6	26682	26687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014925	TAA	2	6	26689	26694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014925	ATT	2	6	26729	26734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014925	ATT	2	6	26745	26750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014925	AGG	2	6	26760	26765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014925	AGA	2	6	26799	26804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014925	TCC	2	6	26930	26935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_014925	TTA	2	6	28048	28053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014925	ATA	2	6	28101	28106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014925	ATA	3	9	28132	28140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014925	AAG	2	6	28150	28155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014925	TAT	2	6	28197	28202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014925	TAA	2	6	28207	28212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014925	TAT	2	6	28593	28598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014925	GTT	2	6	28718	28723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014925	AAT	2	6	28778	28783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014925	CAA	2	6	28809	28814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014925	TGA	2	6	28816	28821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014925	ATA	2	6	28903	28908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014925	CAA	2	6	28925	28930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014925	ATT	2	6	29033	29038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014925	TAT	2	6	29052	29057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014925	ATA	2	6	29088	29093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014925	ATT	2	6	29098	29103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014925	TAT	2	6	29125	29130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014925	AAC	2	6	29168	29173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014925	ATG	2	6	29394	29399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014925	TCT	2	6	29400	29405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014925	AAT	2	6	29504	29509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014925	ATG	2	6	29521	29526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014925	AAC	2	6	29588	29593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014925	TTC	2	6	32948	32953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014925	TGT	2	6	33149	33154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014925	ATT	2	6	33201	33206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014925	AGG	2	6	33249	33254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014925	AAT	2	6	33567	33572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014925	AAT	2	6	35358	35363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014925	CAA	2	6	35487	35492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014925	GAA	2	6	35693	35698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014925	TTA	2	6	37915	37920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014925	TAT	2	6	37957	37962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014925	TAA	2	6	37975	37980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014925	GTT	2	6	37998	38003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014925	ACA	2	6	39350	39355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014925	AAC	2	6	39372	39377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014925	TCC	2	6	40267	40272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_014925	CCT	2	6	41959	41964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_014925	AGA	2	6	42006	42011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014925	ATT	2	6	42061	42066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014925	TTA	2	6	42069	42074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014925	GCA	2	6	42085	42090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014925	TGG	2	6	42183	42188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014925	CTC	2	6	42210	42215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_014925	TTG	2	6	42649	42654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014925	TAT	2	6	42709	42714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014925	TAT	2	6	42796	42801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014925	GAG	2	6	42839	42844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014925	TTG	2	6	43900	43905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014925	AGG	2	6	43943	43948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014925	TGA	2	6	45050	45055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014925	TCC	2	6	47218	47223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_014925	ATT	3	9	47238	47246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014925	TTA	2	6	47282	47287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014925	ATA	2	6	47288	47293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014925	AGT	2	6	47306	47311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014925	TCA	2	6	47383	47388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014925	ATT	2	6	47487	47492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014925	TAA	2	6	47511	47516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014925	TGT	2	6	47632	47637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014925	TAA	2	6	47664	47669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014925	TAG	2	6	47714	47719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014925	ATA	2	6	48596	48601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014925	GTT	2	6	48675	48680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014925	CAA	2	6	48717	48722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014925	TGT	2	6	48736	48741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014925	ATA	2	6	51730	51735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014925	ATA	2	6	53241	53246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014925	CCT	2	6	54393	54398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_014925	AAT	2	6	54436	54441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014925	ACT	2	6	54445	54450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014925	TCA	2	6	54476	54481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014925	TTA	2	6	56732	56737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014925	ATC	2	6	56832	56837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014925	TAA	2	6	56841	56846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014925	GAA	2	6	56868	56873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014925	GAG	2	6	57109	57114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014925	ATA	2	6	62045	62050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014925	TCA	2	6	63275	63280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_014925	CTA	2	6	63311	63316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_014925	TGA	2	6	63338	63343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014925	ATT	2	6	63347	63352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_014925	TGA	2	6	110246	110251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_014925	CAT	2	6	110269	110274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_014925	CAT	2	6	110358	110363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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