MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus pseudintermedius HKU10-03 chromosome

Total Repeats: 10505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014925	C	6	6	207891	207896	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1002	NC_014925	GAGAT	2	10	207899	207908	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_014925	GAT	2	6	207939	207944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_014925	ATCG	2	8	208000	208007	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1005	NC_014925	TACT	2	8	208056	208063	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_014925	TTTG	2	8	208098	208105	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_014925	T	6	6	208244	208249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_014925	A	6	6	208264	208269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_014925	TAA	2	6	208270	208275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_014925	GTT	2	6	208278	208283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_014925	TAAT	2	8	208307	208314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_014925	GTCGA	2	10	208319	208328	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1013	NC_014925	AAT	2	6	208384	208389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_014925	CTT	2	6	208456	208461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_014925	GGC	2	6	208498	208503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_014925	GCG	2	6	208560	208565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_014925	ACCT	2	8	208589	208596	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_014925	TGG	2	6	208720	208725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_014925	CGA	2	6	208744	208749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_014925	GCA	2	6	208818	208823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_014925	CGC	2	6	208865	208870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_014925	GTGA	2	8	208871	208878	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_014925	TGT	2	6	208904	208909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_014925	GAA	2	6	208914	208919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_014925	GTAA	2	8	208927	208934	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_014925	CAG	2	6	208986	208991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_014925	ATT	2	6	209027	209032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_014925	GC	3	6	209042	209047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_014925	T	6	6	209056	209061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_014925	AGA	2	6	209127	209132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_014925	GGA	2	6	209177	209182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_014925	GGC	2	6	209197	209202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_014925	TGC	2	6	209322	209327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_014925	GAA	2	6	209441	209446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_014925	GGA	2	6	209501	209506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_014925	GGT	2	6	209517	209522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_014925	GTC	2	6	209531	209536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_014925	TCGTG	2	10	209540	209549	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1039	NC_014925	CAT	2	6	209599	209604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_014925	GGA	2	6	209643	209648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_014925	ATC	2	6	209667	209672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_014925	AC	3	6	209694	209699	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_014925	GTT	2	6	209759	209764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_014925	AC	3	6	209863	209868	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_014925	CAC	2	6	209878	209883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_014925	CCT	2	6	210005	210010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_014925	ATA	2	6	210019	210024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_014925	TCAT	2	8	210089	210096	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_014925	GGT	2	6	210166	210171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_014925	CCA	2	6	210188	210193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_014925	TAAG	2	8	210220	210227	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_014925	A	6	6	210279	210284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_014925	GTC	2	6	210294	210299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_014925	GAC	2	6	210304	210309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_014925	TAAT	2	8	210315	210322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_014925	A	7	7	210338	210344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_014925	GAC	2	6	210358	210363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_014925	ATG	2	6	210364	210369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_014925	GTAA	2	8	210428	210435	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_014925	TGA	2	6	210452	210457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_014925	TTA	2	6	210499	210504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_014925	CGA	2	6	210538	210543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_014925	ACG	2	6	210556	210561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_014925	GTAA	2	8	210579	210586	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_014925	AAG	2	6	210666	210671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_014925	GGA	2	6	210705	210710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_014925	AGAA	2	8	210713	210720	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_014925	GCG	2	6	210739	210744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_014925	GCTT	2	8	210774	210781	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_014925	TAA	2	6	210862	210867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_014925	TC	3	6	210888	210893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_014925	ACG	2	6	210911	210916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_014925	GGA	2	6	210944	210949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_014925	CT	3	6	210970	210975	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_014925	AGT	2	6	211065	211070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_014925	GGA	2	6	211262	211267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_014925	TC	3	6	211348	211353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_014925	TGA	2	6	211381	211386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_014925	AAT	2	6	211461	211466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1081	NC_014925	AT	3	6	211547	211552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_014925	AGC	2	6	211606	211611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_014925	CAT	2	6	211612	211617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_014925	ACC	2	6	211932	211937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_014925	ATT	2	6	211938	211943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_014925	G	6	6	211957	211962	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_014925	CTAG	2	8	212114	212121	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_014925	GAGC	2	8	212179	212186	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_014925	CGG	2	6	212419	212424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_014925	GA	3	6	212516	212521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_014925	TAGG	2	8	212634	212641	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_014925	TGG	2	6	212680	212685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_014925	TAC	2	6	212688	212693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_014925	GCA	2	6	212719	212724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_014925	CCT	2	6	212776	212781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_014925	TCAT	2	8	212828	212835	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1097	NC_014925	GGT	2	6	212912	212917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_014925	CGT	2	6	213107	213112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_014925	CGT	2	6	213133	213138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_014925	GAG	2	6	213156	213161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_014925	TATG	2	8	213240	213247	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_014925	C	6	6	213283	213288	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1103	NC_014925	GAGAT	2	10	213291	213300	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_014925	GAT	2	6	213331	213336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_014925	ATCG	2	8	213392	213399	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1106	NC_014925	TACT	2	8	213448	213455	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_014925	TTTG	2	8	213490	213497	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_014925	TAG	2	6	213653	213658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_014925	T	8	8	213664	213671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_014925	GGT	2	6	213683	213688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_014925	A	6	6	215629	215634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_014925	TGAA	2	8	215647	215654	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_014925	ATA	2	6	217148	217153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_014925	ATA	2	6	217173	217178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_014925	TCA	2	6	217189	217194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_014925	TGT	2	6	218692	218697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_014925	GT	3	6	218709	218714	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_014925	ATTT	2	8	219566	219573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_014925	TGTA	2	8	219597	219604	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_014925	ATG	2	6	219608	219613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_014925	TAAA	2	8	219619	219626	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_014925	TTG	2	6	219641	219646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_014925	A	6	6	219682	219687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_014925	TA	3	6	219715	219720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_014925	A	6	6	219751	219756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_014925	TAT	2	6	219764	219769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_014925	TAA	2	6	219822	219827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_014925	ATA	2	6	219833	219838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_014925	ATA	2	6	219874	219879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_014925	A	6	6	219879	219884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_014925	CTT	2	6	219893	219898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_014925	CAA	2	6	219944	219949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_014925	A	7	7	219948	219954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_014925	CAT	2	6	219963	219968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_014925	TG	3	6	219988	219993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_014925	T	6	6	221252	221257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1252	NC_014925	TAT	2	6	261839	261844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1253	NC_014925	TAAG	2	8	263108	263115	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1254	NC_014925	TTTTTA	2	12	263148	263159	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_014925	GA	3	6	263285	263290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1256	NC_014925	AGAT	2	8	264342	264349	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1257	NC_014925	AG	3	6	264366	264371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1258	NC_014925	T	6	6	264379	264384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1259	NC_014925	GTT	2	6	264401	264406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1260	NC_014925	ATG	2	6	264426	264431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1261	NC_014925	TGT	2	6	264440	264445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1262	NC_014925	TAA	2	6	264458	264463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1263	NC_014925	AGA	2	6	264503	264508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1264	NC_014925	ATA	2	6	264512	264517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1265	NC_014925	GAAA	2	8	264566	264573	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1266	NC_014925	ATA	2	6	264584	264589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1267	NC_014925	CCA	2	6	264635	264640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1268	NC_014925	TAG	2	6	264660	264665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1269	NC_014925	AGT	2	6	264935	264940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1270	NC_014925	GCT	2	6	264948	264953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1271	NC_014925	GAA	2	6	265002	265007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1273	NC_014925	CA	3	6	265021	265026	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1454	NC_014925	TAT	2	6	301235	301240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1500	NC_014925	TAAAG	2	10	313170	313179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

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