MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus pseudintermedius HKU10-03 chromosome

Total Repeats: 10505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014925	CTT	2	6	105829	105834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_014925	AGT	2	6	105920	105925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_014925	CAT	2	6	105966	105971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_014925	A	6	6	106034	106039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_014925	GTA	2	6	106055	106060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_014925	TGC	2	6	106308	106313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_014925	CTT	2	6	106373	106378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_014925	ATT	2	6	106387	106392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_014925	TAAA	2	8	106398	106405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_014925	A	7	7	106403	106409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_014925	TGA	2	6	109954	109959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_014925	CCCT	2	8	110051	110058	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
513	NC_014925	CAT	2	6	110081	110086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_014925	TTGA	2	8	110129	110136	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
515	NC_014925	TGA	2	6	110246	110251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_014925	CAT	2	6	110269	110274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_014925	T	6	6	110274	110279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_014925	CAT	2	6	110358	110363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_014925	AAT	2	6	110400	110405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_014925	ATG	2	6	110463	110468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_014925	TGTT	2	8	111230	111237	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
522	NC_014925	TTTAAT	2	12	111261	111272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_014925	T	6	6	111279	111284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_014925	A	6	6	111301	111306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_014925	A	6	6	111339	111344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_014925	TAT	2	6	111351	111356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_014925	TCC	2	6	111427	111432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_014925	ACC	2	6	111495	111500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_014925	TAAAT	2	10	115848	115857	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_014925	ATC	2	6	115896	115901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_014925	CCT	3	9	115908	115916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_014925	TA	3	6	115932	115937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_014925	ATT	2	6	115955	115960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_014925	GTT	2	6	115970	115975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_014925	TTA	2	6	115976	115981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_014925	TTA	2	6	115987	115992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_014925	ATAA	2	8	115995	116002	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_014925	T	7	7	116010	116016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_014925	ATG	2	6	116042	116047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_014925	GAA	2	6	116061	116066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_014925	ATAA	2	8	119444	119451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_014925	CTGT	2	8	119498	119505	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
543	NC_014925	A	7	7	119508	119514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_014925	TAT	2	6	119536	119541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_014925	ACA	2	6	119815	119820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_014925	TGA	2	6	119841	119846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_014925	A	6	6	119855	119860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_014925	AG	3	6	119943	119948	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_014925	TCAT	2	8	121297	121304	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
550	NC_014925	TC	4	8	122767	122774	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
551	NC_014925	GT	3	6	122794	122799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
552	NC_014925	CGT	2	6	125105	125110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_014925	CAA	2	6	125127	125132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_014925	TCG	2	6	125138	125143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_014925	TA	3	6	125270	125275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_014925	ATCA	2	8	125276	125283	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
557	NC_014925	T	6	6	125329	125334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_014925	CAA	2	6	125343	125348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_014925	GCAC	2	8	125460	125467	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
560	NC_014925	T	6	6	125468	125473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_014925	AT	4	8	125489	125496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_014925	ATG	2	6	125562	125567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_014925	TAG	2	6	125662	125667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_014925	ATG	2	6	125967	125972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_014925	ATAA	2	8	126003	126010	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_014925	AAT	2	6	126040	126045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_014925	TAT	2	6	126054	126059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_014925	AT	3	6	126086	126091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_014925	ATG	2	6	126111	126116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_014925	TA	3	6	126136	126141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_014925	TATAA	2	10	126171	126180	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_014925	AAT	2	6	126192	126197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_014925	TCT	2	6	126199	126204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_014925	AGG	2	6	126213	126218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_014925	A	6	6	127236	127241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_014925	T	6	6	127278	127283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_014925	A	6	6	127320	127325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_014925	AACA	2	8	127372	127379	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
579	NC_014925	GAT	2	6	127387	127392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_014925	ACT	2	6	127535	127540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_014925	A	6	6	127545	127550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_014925	ATG	2	6	127925	127930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_014925	TCAT	2	8	127931	127938	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
584	NC_014925	AT	3	6	128105	128110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_014925	TTA	2	6	128114	128119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_014925	GA	3	6	128183	128188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
587	NC_014925	A	7	7	128757	128763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_014925	TAG	2	6	128783	128788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_014925	TGA	2	6	128814	128819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_014925	TAA	2	6	128938	128943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_014925	CAA	2	6	128958	128963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_014925	C	6	6	128964	128969	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
593	NC_014925	TTA	2	6	128998	129003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_014925	ATG	2	6	129031	129036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_014925	ATT	2	6	129097	129102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_014925	TA	3	6	129158	129163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_014925	AGT	2	6	129167	129172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_014925	AT	3	6	133817	133822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_014925	A	7	7	133897	133903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_014925	T	6	6	134542	134547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_014925	T	8	8	134576	134583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_014925	C	8	8	135294	135301	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
603	NC_014925	TAA	2	6	135303	135308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_014925	AAG	2	6	135367	135372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_014925	AGC	2	6	135437	135442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_014925	AAC	2	6	135460	135465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_014925	TTAC	2	8	135471	135478	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
608	NC_014925	TTTAT	2	10	135510	135519	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_014925	ATT	2	6	135546	135551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_014925	T	6	6	135599	135604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_014925	G	6	6	135610	135615	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
612	NC_014925	T	6	6	136264	136269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_014925	GAA	2	6	136290	136295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_014925	AAT	2	6	136322	136327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_014925	ATT	2	6	136330	136335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_014925	TAA	2	6	136348	136353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_014925	TAA	2	6	136362	136367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_014925	TTA	2	6	136388	136393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_014925	GAA	2	6	136394	136399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_014925	TGGC	2	8	136475	136482	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
621	NC_014925	AGTC	2	8	136499	136506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
622	NC_014925	AAC	2	6	136536	136541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_014925	ATT	2	6	136556	136561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_014925	GAA	2	6	136601	136606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_014925	ATG	2	6	136641	136646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_014925	AAC	2	6	136666	136671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_014925	A	6	6	136690	136695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_014925	AGAAA	2	10	136700	136709	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
629	NC_014925	TTTA	2	8	137356	137363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_014925	ATT	2	6	137379	137384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_014925	ATAA	2	8	137396	137403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_014925	AGAT	2	8	137448	137455	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
633	NC_014925	TTCG	2	8	137598	137605	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
634	NC_014925	A	6	6	137614	137619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_014925	T	8	8	137651	137658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_014925	TAT	2	6	142812	142817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_014925	TAGA	2	8	142826	142833	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
638	NC_014925	TA	3	6	142846	142851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_014925	TA	3	6	142874	142879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_014925	AGG	2	6	147417	147422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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676	NC_014925	TTG	2	6	157311	157316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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