MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfuricurvum kujiense DSM 16994 chromosome

Total Repeats: 179

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014762	TCGTT	2	10	14008	14017	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014762	TCAAA	2	10	43437	43446	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014762	AAGTA	2	10	72954	72963	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014762	ATAGT	2	10	89604	89613	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014762	AATTA	2	10	91789	91798	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014762	AATGA	2	10	96786	96795	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014762	TTCTT	2	10	100260	100269	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014762	AAGAA	2	10	100276	100285	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014762	TTTCT	2	10	108220	108229	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014762	AAAGA	2	10	108237	108246	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014762	AGGAA	2	10	113843	113852	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014762	ATTAT	2	10	120548	120557	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014762	TAAAA	2	10	132856	132865	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014762	GAAAA	2	10	135970	135979	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014762	CTTTT	2	10	154021	154030	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014762	GAAAA	2	10	178518	178527	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014762	GTAAT	2	10	190502	190511	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014762	ATAAA	2	10	273837	273846	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014762	AATTT	2	10	278614	278623	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014762	AAAAG	2	10	281424	281433	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014762	CTTAA	2	10	282442	282451	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014762	TTTCT	2	10	285045	285054	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014762	AGAAA	2	10	285063	285072	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014762	TTGGG	3	15	286286	286300	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014762	TATCA	2	10	286357	286366	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014762	AGTAA	2	10	292805	292814	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014762	TTTTC	2	10	308425	308434	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014762	AGAAA	2	10	308444	308453	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014762	AAACG	2	10	309053	309062	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014762	GATAA	2	10	328777	328786	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014762	TCGCT	2	10	344566	344575	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_014762	TAATT	2	10	349049	349058	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014762	ATCAT	2	10	356109	356118	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014762	AAAAT	2	10	356747	356756	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014762	TGATT	2	10	368580	368589	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014762	TTAAA	2	10	399288	399297	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014762	TATTT	2	10	433619	433628	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014762	TTTCT	2	10	466099	466108	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014762	AGAAA	2	10	466117	466126	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014762	ATTAT	2	10	472330	472339	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014762	CTTTT	2	10	477078	477087	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014762	AGAAA	2	10	477089	477098	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014762	GAAAA	2	10	477104	477113	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014762	CAAAA	2	10	478870	478879	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014762	TATAG	2	10	512527	512536	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014762	GTCCA	2	10	516135	516144	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_014762	AAAAT	2	10	516325	516334	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014762	TTTTA	2	10	536540	536549	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014762	AAAAT	2	10	595645	595654	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014762	ATACT	2	10	604490	604499	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014762	TGTTT	2	10	605496	605505	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014762	TTTTA	2	10	648878	648887	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014762	TCTAT	2	10	656968	656977	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014762	TCGTG	2	10	658276	658285	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014762	CCGTA	2	10	660883	660892	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_014762	ATTGA	2	10	661163	661172	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014762	TAAAA	2	10	733177	733186	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014762	AGTAT	2	10	742134	742143	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014762	CTCAT	2	10	804883	804892	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_014762	AAAAG	2	10	805148	805157	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014762	GACGC	2	10	808117	808126	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_014762	CTTTT	2	10	808275	808284	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014762	AAAAG	2	10	808297	808306	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014762	GTTAC	2	10	890894	890903	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014762	CGGAA	2	10	904250	904259	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014762	ACAAT	2	10	918298	918307	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014762	TATTT	2	10	918313	918322	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014762	AGAAA	2	10	993559	993568	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014762	ACAAA	2	10	993930	993939	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014762	AAAAT	2	10	1034930	1034939	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014762	GTATC	2	10	1060418	1060427	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014762	TTTAC	2	10	1061096	1061105	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014762	TATTG	2	10	1069840	1069849	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014762	TAATA	2	10	1085728	1085737	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014762	TTAAT	2	10	1086554	1086563	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014762	TTGAA	2	10	1092993	1093002	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014762	CTTTT	2	10	1097672	1097681	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014762	AGAAA	2	10	1097683	1097692	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014762	AAAAG	2	10	1097699	1097708	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014762	GAGAG	2	10	1097899	1097908	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014762	ACACA	2	10	1098270	1098279	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_014762	GTTAG	2	10	1098966	1098975	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014762	CTTTT	2	10	1099012	1099021	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014762	CTTTT	2	10	1102107	1102116	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014762	AGAAA	2	10	1102118	1102127	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014762	CAAAC	2	10	1151674	1151683	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_014762	TGAAG	2	10	1153454	1153463	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014762	AGAAT	2	10	1153707	1153716	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014762	ATTTA	2	10	1195141	1195150	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014762	CGATA	2	10	1223179	1223188	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014762	ATATA	2	10	1253227	1253236	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014762	TAAAA	2	10	1264116	1264125	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014762	AAAGA	2	10	1304899	1304908	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014762	TATAT	2	10	1343753	1343762	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014762	CCCCT	2	10	1351129	1351138	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
96	NC_014762	TATTT	2	10	1351435	1351444	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014762	GCTTT	2	10	1351613	1351622	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_014762	CCGAA	2	10	1362270	1362279	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_014762	GACGA	2	10	1362460	1362469	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_014762	ATATT	2	10	1372829	1372838	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014762	TTTTA	2	10	1381208	1381217	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014762	TTCAT	2	10	1450681	1450690	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014762	TTTAT	2	10	1459706	1459715	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014762	CAATA	2	10	1492982	1492991	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_014762	TTCTT	2	10	1518655	1518664	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_014762	TTTCA	2	10	1547146	1547155	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_014762	TATTC	2	10	1592393	1592402	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_014762	GATAT	2	10	1621827	1621836	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014762	TGCTC	2	10	1631747	1631756	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_014762	AGTTA	2	10	1634848	1634857	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014762	TTTAA	2	10	1681216	1681225	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014762	ATTTT	2	10	1690788	1690797	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014762	TTGTT	2	10	1711552	1711561	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014762	TCCAA	2	10	1711665	1711674	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_014762	ATCAC	2	10	1712165	1712174	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_014762	TTGAA	2	10	1712414	1712423	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014762	TGCAG	2	10	1714643	1714652	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_014762	ACTAT	2	10	1727005	1727014	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014762	TCACT	2	10	1731155	1731164	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_014762	TAAAT	2	10	1753078	1753087	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014762	CTCTA	2	10	1804163	1804172	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_014762	AAAAG	2	10	1804679	1804688	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014762	ACATC	2	10	1815888	1815897	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_014762	AAACG	2	10	1838274	1838283	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_014762	GAAAA	2	10	1838334	1838343	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014762	TAAGG	2	10	1877028	1877037	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014762	TATTT	2	10	1879601	1879610	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014762	TAACC	2	10	1900740	1900749	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_014762	CTAAA	2	10	1931326	1931335	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_014762	TTCAA	2	10	1945646	1945655	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_014762	TACGG	2	10	1945927	1945936	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014762	CACGA	2	10	1948534	1948543	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_014762	ATAGA	2	10	1949842	1949851	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014762	TCAAT	2	10	1982951	1982960	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_014762	AAACA	2	10	1983275	1983284	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_014762	TTTGA	2	10	1985947	1985956	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014762	TTAAA	2	10	1999802	1999811	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014762	ATTGA	2	10	2021938	2021947	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014762	TTAAA	2	10	2035844	2035853	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014762	GTTTG	2	10	2037794	2037803	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014762	ATTTA	2	10	2065060	2065069	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014762	AATGA	2	10	2083819	2083828	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014762	AATAA	2	10	2084075	2084084	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014762	AAAGA	2	10	2102169	2102178	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014762	CAAAA	2	10	2124886	2124895	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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179	NC_014762	AAAAG	2	10	2572002	2572011	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.