MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfuricurvum kujiense DSM 16994 chromosome

Total Repeats: 3738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014762	T	7	7	2473807	2473813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_014762	CTTTT	2	10	2476596	2476605	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3503	NC_014762	TCC	2	6	2476635	2476640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3504	NC_014762	CTT	2	6	2476660	2476665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_014762	ACT	2	6	2476668	2476673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_014762	TAC	2	6	2478176	2478181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_014762	TCT	2	6	2480694	2480699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_014762	T	6	6	2480735	2480740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_014762	TAC	2	6	2480786	2480791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_014762	ATA	2	6	2480802	2480807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_014762	A	6	6	2480807	2480812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_014762	A	6	6	2489153	2489158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_014762	ATT	2	6	2489167	2489172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_014762	AAG	2	6	2489176	2489181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_014762	TATT	2	8	2489247	2489254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_014762	ATT	2	6	2494723	2494728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_014762	T	8	8	2498239	2498246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_014762	A	6	6	2498273	2498278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_014762	TCGAT	2	10	2498308	2498317	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3520	NC_014762	AT	3	6	2498316	2498321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_014762	ATT	2	6	2498359	2498364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_014762	CT	3	6	2499683	2499688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_014762	GAA	2	6	2500220	2500225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_014762	TATTT	2	10	2501409	2501418	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_014762	TCC	2	6	2502846	2502851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3526	NC_014762	T	7	7	2502854	2502860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_014762	T	6	6	2502958	2502963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_014762	ACT	2	6	2502980	2502985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_014762	TAA	3	9	2502994	2503002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_014762	TC	3	6	2504808	2504813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3531	NC_014762	A	7	7	2506473	2506479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_014762	GGT	2	6	2506556	2506561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_014762	CTT	2	6	2513329	2513334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_014762	TAA	2	6	2513405	2513410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_014762	ATT	2	6	2513485	2513490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_014762	CGT	2	6	2513491	2513496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_014762	TTA	2	6	2513529	2513534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_014762	TA	3	6	2513539	2513544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_014762	ATT	2	6	2513590	2513595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_014762	TG	3	6	2517486	2517491	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_014762	T	6	6	2517495	2517500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_014762	ATA	2	6	2517540	2517545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_014762	TTA	2	6	2517568	2517573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_014762	TTG	2	6	2517574	2517579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_014762	A	6	6	2517580	2517585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_014762	TA	4	8	2517603	2517610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_014762	ACA	2	6	2519027	2519032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_014762	ATTT	2	8	2519127	2519134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_014762	AATG	2	8	2519224	2519231	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_014762	GGC	2	6	2519347	2519352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_014762	A	6	6	2519391	2519396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_014762	A	6	6	2519407	2519412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_014762	GTAAA	2	10	2519426	2519435	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_014762	A	6	6	2519454	2519459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_014762	TAAAAG	2	12	2519466	2519477	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_014762	GGC	2	6	2519497	2519502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_014762	TAT	2	6	2519533	2519538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_014762	CT	3	6	2519591	2519596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3559	NC_014762	AGA	2	6	2519615	2519620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_014762	GTC	2	6	2519679	2519684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_014762	TAA	2	6	2519723	2519728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_014762	AC	3	6	2519795	2519800	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3563	NC_014762	AAC	2	6	2519928	2519933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_014762	CTC	2	6	2519984	2519989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3565	NC_014762	ACG	2	6	2520031	2520036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_014762	CA	3	6	2520218	2520223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3567	NC_014762	ACC	2	6	2520226	2520231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3568	NC_014762	TGTC	2	8	2520267	2520274	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3569	NC_014762	CAGT	2	8	2520278	2520285	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3570	NC_014762	AGG	2	6	2520362	2520367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_014762	CCA	2	6	2520389	2520394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3572	NC_014762	TCC	2	6	2520402	2520407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3573	NC_014762	GGT	2	6	2520449	2520454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_014762	AGG	2	6	2520586	2520591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_014762	GCC	2	6	2520719	2520724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3576	NC_014762	TTCAA	2	10	2520737	2520746	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3577	NC_014762	GGGA	2	8	2520856	2520863	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_014762	TGC	2	6	2520869	2520874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_014762	TTC	2	6	2520971	2520976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_014762	CACC	2	8	2521000	2521007	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3581	NC_014762	TACGG	2	10	2521018	2521027	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3582	NC_014762	ATC	2	6	2521071	2521076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_014762	CCT	2	6	2521153	2521158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3584	NC_014762	C	6	6	2521209	2521214	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3585	NC_014762	CTC	2	6	2521412	2521417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3586	NC_014762	CTTT	2	8	2521548	2521555	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3587	NC_014762	GCT	2	6	2521564	2521569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_014762	GTT	2	6	2521654	2521659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_014762	GATT	2	8	2521671	2521678	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_014762	CACC	2	8	2521683	2521690	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3591	NC_014762	AGC	2	6	2521752	2521757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_014762	AT	3	6	2521812	2521817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_014762	GA	3	6	2521822	2521827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_014762	TCC	2	6	2521908	2521913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3595	NC_014762	GCA	2	6	2521971	2521976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_014762	GTA	3	9	2522204	2522212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_014762	C	6	6	2522232	2522237	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3598	NC_014762	CTGT	2	8	2522287	2522294	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3599	NC_014762	TTC	2	6	2522345	2522350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_014762	TCGC	2	8	2522421	2522428	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3601	NC_014762	ATTT	2	8	2522452	2522459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_014762	C	6	6	2522498	2522503	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3603	NC_014762	CTT	2	6	2522564	2522569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_014762	TTA	2	6	2522678	2522683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_014762	GAC	2	6	2522785	2522790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_014762	AAT	3	9	2522796	2522804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_014762	ACA	2	6	2522841	2522846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_014762	TGG	2	6	2522883	2522888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_014762	CCT	2	6	2522913	2522918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3610	NC_014762	TGG	2	6	2522975	2522980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_014762	ATGA	2	8	2523143	2523150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_014762	TCG	2	6	2523152	2523157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_014762	AGG	2	6	2523170	2523175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_014762	GA	3	6	2523407	2523412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_014762	GT	3	6	2523475	2523480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_014762	ATG	2	6	2523500	2523505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_014762	CGT	2	6	2523512	2523517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_014762	TCC	3	9	2523526	2523534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3619	NC_014762	CACGA	2	10	2523625	2523634	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3620	NC_014762	GAC	2	6	2523638	2523643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_014762	GCA	2	6	2523650	2523655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_014762	TG	3	6	2523658	2523663	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_014762	TTC	2	6	2523730	2523735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_014762	CCA	2	6	2523763	2523768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3625	NC_014762	CGA	2	6	2523873	2523878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_014762	ATC	2	6	2523960	2523965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_014762	CAG	2	6	2523967	2523972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_014762	GCT	2	6	2524183	2524188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_014762	AC	3	6	2524254	2524259	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3630	NC_014762	TCC	2	6	2524272	2524277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3631	NC_014762	TGC	2	6	2524287	2524292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_014762	TCC	2	6	2524302	2524307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3633	NC_014762	CTG	2	6	2524326	2524331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3634	NC_014762	GT	3	6	2524367	2524372	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3635	NC_014762	ATC	2	6	2524376	2524381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3636	NC_014762	A	6	6	2524465	2524470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3637	NC_014762	AAG	2	6	2524493	2524498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3641	NC_014762	GTT	2	6	2524784	2524789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3734	NC_014762	A	6	6	2574185	2574190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3735	NC_014762	TTA	2	6	2574191	2574196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.