MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfuricurvum kujiense DSM 16994 plasmid pSULKU01

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014754	AAAG	2	8	105	112	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014754	CTTG	2	8	390	397	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014754	AATA	2	8	525	532	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014754	AGAA	2	8	1250	1257	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014754	CTTT	2	8	2829	2836	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014754	TTGT	2	8	3327	3334	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014754	GATT	2	8	3339	3346	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014754	AGTG	2	8	3369	3376	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014754	AATT	2	8	5791	5798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014754	GAAA	2	8	7516	7523	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014754	TTCT	2	8	7598	7605	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014754	AATT	2	8	15554	15561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014754	AATT	2	8	18770	18777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014754	TTGA	2	8	19382	19389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014754	GGTT	2	8	19512	19519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014754	AAAT	2	8	19692	19699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014754	ATAA	2	8	19765	19772	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014754	TTTC	2	8	20405	20412	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014754	TTGA	2	8	21234	21241	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014754	AACA	2	8	21509	21516	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014754	ATGG	2	8	21599	21606	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014754	CTAA	2	8	21864	21871	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014754	TAAA	2	8	22013	22020	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014754	ATCC	2	8	24329	24336	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014754	GGAT	2	8	24337	24344	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014754	ATTC	2	8	24364	24371	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014754	ATCC	2	8	24439	24446	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014754	GGAT	2	8	24447	24454	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014754	ATCC	2	8	26368	26375	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014754	TGAA	2	8	26561	26568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014754	TCTA	2	8	27146	27153	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014754	AAAG	2	8	27560	27567	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014754	CAAT	2	8	28345	28352	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014754	GATA	2	8	29706	29713	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014754	GATC	2	8	30019	30026	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014754	ATAA	2	8	30141	30148	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014754	CATA	2	8	39889	39896	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014754	CTTT	2	8	56882	56889	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014754	TAAA	2	8	57021	57028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014754	CAAA	2	8	68698	68705	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014754	TCAA	2	8	68801	68808	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014754	ATTT	2	8	68896	68903	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014754	CATT	2	8	69293	69300	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014754	GAAA	2	8	69560	69567	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014754	ATAG	2	8	69637	69644	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014754	TGAT	2	8	70235	70242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014754	AAGC	2	8	70346	70353	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014754	TGAT	2	8	70510	70517	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014754	ATCA	2	8	70806	70813	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014754	CAAA	2	8	70879	70886	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014754	AATT	2	8	73026	73033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014754	CGAA	2	8	75445	75452	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014754	TCAT	2	8	78392	78399	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014754	ATTT	2	8	78588	78595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014754	ATCT	2	8	78960	78967	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014754	GCTT	2	8	80679	80686	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014754	TCGA	2	8	82201	82208	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014754	TCAA	2	8	82664	82671	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014754	GGCA	2	8	83193	83200	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014754	ATGA	2	8	83305	83312	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014754	TCTG	2	8	83574	83581	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014754	GAAG	2	8	83688	83695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014754	ATCT	2	8	83731	83738	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014754	CATC	2	8	84653	84660	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014754	CAGC	2	8	96932	96939	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014754	TAAA	2	8	97235	97242	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014754	TTTG	2	8	97257	97264	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014754	ATTT	2	8	109633	109640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014754	TACA	2	8	117755	117762	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.