MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 19528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014623	CGA	2	6	1613337	1613342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_014623	CAT	2	6	1613350	1613355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_014623	GTG	2	6	1613358	1613363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_014623	AGG	2	6	1613395	1613400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_014623	TTC	2	6	1613441	1613446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_014623	TGC	2	6	1613479	1613484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_014623	GGC	3	9	1613567	1613575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_014623	ATC	2	6	1613613	1613618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_014623	CTA	2	6	1613670	1613675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_014623	TCC	2	6	1613679	1613684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3511	NC_014623	GAAC	2	8	1613844	1613851	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3512	NC_014623	TTG	2	6	1613913	1613918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_014623	CGC	2	6	1613932	1613937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3514	NC_014623	TTC	2	6	1613997	1614002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_014623	ACCT	2	8	1614044	1614051	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3516	NC_014623	TTC	2	6	1614070	1614075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_014623	CGA	2	6	1614095	1614100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_014623	TTTG	2	8	1614106	1614113	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_014623	AACC	2	8	1614236	1614243	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3520	NC_014623	GC	3	6	1614273	1614278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3521	NC_014623	GGA	2	6	1614352	1614357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_014623	G	6	6	1614369	1614374	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_014623	TC	3	6	1615799	1615804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3524	NC_014623	AGGA	2	8	1615846	1615853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_014623	TTG	2	6	1615862	1615867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_014623	G	6	6	1615867	1615872	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_014623	GCGG	2	8	1615874	1615881	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3528	NC_014623	CCG	2	6	1616079	1616084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3529	NC_014623	CTG	2	6	1616181	1616186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_014623	TTC	2	6	1617537	1617542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_014623	GGT	2	6	1617590	1617595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_014623	AGGA	2	8	1617642	1617649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_014623	GAG	2	6	1617650	1617655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_014623	GA	3	6	1617663	1617668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_014623	GCC	2	6	1618966	1618971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3536	NC_014623	ACC	2	6	1618972	1618977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3537	NC_014623	ACG	2	6	1619001	1619006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_014623	TGG	2	6	1619019	1619024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_014623	CCA	2	6	1620052	1620057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3540	NC_014623	ACC	3	9	1620078	1620086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3541	NC_014623	GCC	2	6	1620091	1620096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3542	NC_014623	GCG	2	6	1620106	1620111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_014623	TGG	2	6	1620113	1620118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_014623	CGT	2	6	1620124	1620129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_014623	GAA	2	6	1620131	1620136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_014623	CCGG	2	8	1620168	1620175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3547	NC_014623	CAT	2	6	1620187	1620192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_014623	G	6	6	1621092	1621097	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_014623	TTC	2	6	1621100	1621105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_014623	CG	3	6	1621132	1621137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3551	NC_014623	GAC	2	6	1621165	1621170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_014623	TA	3	6	1621358	1621363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_014623	C	6	6	1622218	1622223	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3554	NC_014623	GGA	2	6	1622247	1622252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_014623	AGG	2	6	1622348	1622353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_014623	GCC	2	6	1622370	1622375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3557	NC_014623	CACC	2	8	1622397	1622404	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3558	NC_014623	GT	3	6	1623176	1623181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_014623	CG	3	6	1624969	1624974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3560	NC_014623	TGA	2	6	1624980	1624985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_014623	GTG	2	6	1625042	1625047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_014623	G	7	7	1625051	1625057	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_014623	GC	3	6	1625061	1625066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3564	NC_014623	GCA	2	6	1625080	1625085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_014623	CCGG	2	8	1625087	1625094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_014623	G	6	6	1625131	1625136	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_014623	CACG	2	8	1625148	1625155	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3568	NC_014623	CGAGG	2	10	1625196	1625205	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3569	NC_014623	GCCT	2	8	1625232	1625239	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3570	NC_014623	CG	3	6	1625289	1625294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3571	NC_014623	TCA	2	6	1625299	1625304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_014623	GCG	2	6	1627905	1627910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_014623	GC	3	6	1627920	1627925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3574	NC_014623	CCG	2	6	1630541	1630546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3575	NC_014623	TCC	2	6	1630558	1630563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3576	NC_014623	CTCA	2	8	1634761	1634768	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3577	NC_014623	CATT	2	8	1634871	1634878	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3578	NC_014623	CGC	2	6	1634899	1634904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3579	NC_014623	CAG	2	6	1634912	1634917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_014623	TCT	2	6	1634936	1634941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_014623	CCG	2	6	1634960	1634965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3582	NC_014623	CCGG	2	8	1635789	1635796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3583	NC_014623	GAG	2	6	1635834	1635839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_014623	TGA	2	6	1635859	1635864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_014623	AG	4	8	1637737	1637744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_014623	GCC	2	6	1637873	1637878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3587	NC_014623	CCG	2	6	1637885	1637890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3588	NC_014623	AAGC	2	8	1637899	1637906	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3589	NC_014623	GCC	2	6	1637916	1637921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_014623	TGA	2	6	1637966	1637971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_014623	TTG	2	6	1637992	1637997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_014623	ACGGC	2	10	1638026	1638035	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3593	NC_014623	CAAA	2	8	1638065	1638072	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3594	NC_014623	GACA	2	8	1638080	1638087	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3595	NC_014623	GGAGC	2	10	1638106	1638115	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3596	NC_014623	GGAAAA	2	12	1638231	1638242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_014623	CTT	2	6	1638262	1638267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_014623	CTT	2	6	1638326	1638331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_014623	TGAGG	2	10	1642051	1642060	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_014623	GAAG	2	8	1642069	1642076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_014623	CG	3	6	1642139	1642144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3602	NC_014623	CT	3	6	1642168	1642173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3603	NC_014623	AGG	2	6	1642217	1642222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_014623	GTG	3	9	1642232	1642240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_014623	CAC	2	6	1642274	1642279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3606	NC_014623	GT	3	6	1642281	1642286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_014623	CA	3	6	1642369	1642374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3608	NC_014623	TG	3	6	1642384	1642389	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_014623	CCGC	2	8	1642399	1642406	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3610	NC_014623	AGG	2	6	1643874	1643879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_014623	TCCTC	2	10	1644188	1644197	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3612	NC_014623	GGA	2	6	1644245	1644250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_014623	TCC	2	6	1645725	1645730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3614	NC_014623	AGG	2	6	1646189	1646194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_014623	G	6	6	1646193	1646198	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_014623	GGC	2	6	1646209	1646214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_014623	CT	3	6	1646236	1646241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3618	NC_014623	CTG	2	6	1646253	1646258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_014623	CTG	2	6	1646376	1646381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_014623	GTG	2	6	1646386	1646391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_014623	GCCA	2	8	1646407	1646414	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3622	NC_014623	GCC	2	6	1646447	1646452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3623	NC_014623	TCG	2	6	1648325	1648330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_014623	GCC	2	6	1648345	1648350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3625	NC_014623	CTG	2	6	1648371	1648376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_014623	CCG	2	6	1648409	1648414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3627	NC_014623	CGTT	2	8	1649256	1649263	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3628	NC_014623	CAG	3	9	1649295	1649303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_014623	CAG	2	6	1649307	1649312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_014623	CAG	2	6	1649356	1649361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3632	NC_014623	GGC	2	6	1650706	1650711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3755	NC_014623	TGA	2	6	1700507	1700512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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