MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 19528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014623	AC	3	6	1106109	1106114	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2502	NC_014623	GCG	2	6	1106126	1106131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_014623	CGC	2	6	1106200	1106205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2504	NC_014623	CCG	2	6	1106234	1106239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2505	NC_014623	GC	3	6	1106286	1106291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2506	NC_014623	TGA	2	6	1106299	1106304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_014623	CGC	2	6	1106349	1106354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2508	NC_014623	CGA	2	6	1106359	1106364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_014623	ACG	2	6	1107261	1107266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_014623	ACC	2	6	1107274	1107279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2511	NC_014623	TGCG	2	8	1107315	1107322	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2512	NC_014623	CTT	2	6	1107324	1107329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_014623	CTG	2	6	1107347	1107352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_014623	CTG	2	6	1107367	1107372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_014623	CGG	2	6	1107396	1107401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_014623	TAC	2	6	1107470	1107475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_014623	AGAGA	2	10	1107512	1107521	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_014623	CGC	2	6	1110192	1110197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2519	NC_014623	CCG	2	6	1111592	1111597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2520	NC_014623	CGAA	2	8	1111642	1111649	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2521	NC_014623	GAAA	2	8	1111757	1111764	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_014623	CCA	2	6	1112677	1112682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2523	NC_014623	CTGC	2	8	1112696	1112703	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2524	NC_014623	GAG	2	6	1112707	1112712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_014623	GC	3	6	1112765	1112770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2526	NC_014623	AGC	2	6	1112786	1112791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_014623	CGG	3	9	1112793	1112801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_014623	CCA	2	6	1112887	1112892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2529	NC_014623	GAG	2	6	1112916	1112921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_014623	AAGG	2	8	1112940	1112947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_014623	GGCT	2	8	1113021	1113028	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2532	NC_014623	TCG	2	6	1116230	1116235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_014623	AG	3	6	1116246	1116251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_014623	TGC	2	6	1116276	1116281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_014623	CAC	2	6	1116285	1116290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2536	NC_014623	ACC	2	6	1116306	1116311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2537	NC_014623	ACG	2	6	1116358	1116363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_014623	CGC	2	6	1116475	1116480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2539	NC_014623	GGC	2	6	1117069	1117074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_014623	GC	3	6	1117120	1117125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2541	NC_014623	GCA	2	6	1117200	1117205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_014623	GC	3	6	1117211	1117216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2543	NC_014623	AGCG	2	8	1117226	1117233	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2544	NC_014623	GCT	2	6	1117234	1117239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_014623	TTC	2	6	1117262	1117267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_014623	TCG	2	6	1119250	1119255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_014623	CAG	2	6	1119400	1119405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_014623	TCG	2	6	1119447	1119452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2549	NC_014623	TGAT	2	8	1119457	1119464	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_014623	GAGTGC	2	12	1119500	1119511	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2551	NC_014623	GC	3	6	1119510	1119515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2552	NC_014623	GCT	2	6	1119562	1119567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_014623	GA	4	8	1119577	1119584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_014623	A	6	6	1119584	1119589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_014623	CAA	2	6	1119607	1119612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_014623	CGA	2	6	1119616	1119621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_014623	AAT	2	6	1119635	1119640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_014623	AGC	2	6	1119669	1119674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2559	NC_014623	GA	3	6	1119691	1119696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_014623	CGA	2	6	1119904	1119909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_014623	CGC	2	6	1119912	1119917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2562	NC_014623	GAA	2	6	1122200	1122205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_014623	GGC	2	6	1122264	1122269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_014623	CGC	2	6	1122361	1122366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2565	NC_014623	GTC	2	6	1122374	1122379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_014623	TCCCA	2	10	1122388	1122397	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2567	NC_014623	G	6	6	1122456	1122461	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_014623	GCCC	2	8	1122523	1122530	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2569	NC_014623	TCC	2	6	1122571	1122576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2570	NC_014623	AGA	2	6	1122630	1122635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_014623	ACGTG	2	10	1124186	1124195	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2572	NC_014623	TGC	2	6	1124251	1124256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2573	NC_014623	GGC	2	6	1124321	1124326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2574	NC_014623	GCG	3	9	1124441	1124449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2575	NC_014623	GCT	2	6	1124866	1124871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2576	NC_014623	GC	4	8	1124884	1124891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2577	NC_014623	CG	4	8	1124918	1124925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2578	NC_014623	CAC	2	6	1124926	1124931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2579	NC_014623	AGCT	2	8	1124939	1124946	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2580	NC_014623	G	6	6	1124954	1124959	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_014623	CGC	2	6	1124961	1124966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2582	NC_014623	CCTTG	2	10	1124970	1124979	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2583	NC_014623	CTTT	2	8	1125905	1125912	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2584	NC_014623	GGA	2	6	1125918	1125923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_014623	GGA	2	6	1125938	1125943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_014623	GAT	2	6	1125955	1125960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_014623	TGCC	2	8	1125975	1125982	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2588	NC_014623	GCG	2	6	1125997	1126002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_014623	TTC	2	6	1127666	1127671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2590	NC_014623	AGA	2	6	1127695	1127700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_014623	TTC	2	6	1127719	1127724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2592	NC_014623	G	6	6	1127743	1127748	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_014623	GTG	2	6	1128514	1128519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_014623	GGCC	2	8	1128577	1128584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2595	NC_014623	GC	3	6	1128588	1128593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2596	NC_014623	GCC	2	6	1128596	1128601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2597	NC_014623	CT	3	6	1128629	1128634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2598	NC_014623	AGGA	2	8	1129561	1129568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_014623	ACC	2	6	1129576	1129581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2600	NC_014623	CT	3	6	1129619	1129624	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2601	NC_014623	TG	4	8	1129630	1129637	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_014623	ACG	2	6	1129732	1129737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_014623	GCC	2	6	1129746	1129751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2604	NC_014623	TCG	2	6	1129760	1129765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2605	NC_014623	GTTC	2	8	1129829	1129836	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2606	NC_014623	TTG	2	6	1129858	1129863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_014623	TCGT	2	8	1129992	1129999	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2608	NC_014623	CGC	2	6	1130026	1130031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2609	NC_014623	GTG	2	6	1130075	1130080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_014623	AG	3	6	1130085	1130090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_014623	GGC	2	6	1130539	1130544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2612	NC_014623	TG	3	6	1130618	1130623	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_014623	TCCG	2	8	1130631	1130638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2614	NC_014623	CGTTC	2	10	1130680	1130689	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2615	NC_014623	GAG	3	9	1130701	1130709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_014623	G	6	6	1131561	1131566	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_014623	GAC	2	6	1131605	1131610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2618	NC_014623	TCC	2	6	1131622	1131627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2619	NC_014623	GCT	2	6	1131644	1131649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_014623	AGG	2	6	1131656	1131661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_014623	TCC	2	6	1131912	1131917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2622	NC_014623	TCG	2	6	1131925	1131930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2623	NC_014623	G	6	6	1132237	1132242	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_014623	T	6	6	1132273	1132278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_014623	GCGG	2	8	1132299	1132306	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2626	NC_014623	CAGG	2	8	1132337	1132344	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2627	NC_014623	GGC	2	6	1132345	1132350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2628	NC_014623	CGGC	2	8	1134295	1134302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2629	NC_014623	TCC	2	6	1134389	1134394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2630	NC_014623	TCC	2	6	1134396	1134401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2631	NC_014623	GCC	2	6	1134411	1134416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2632	NC_014623	TCC	2	6	1141720	1141725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2633	NC_014623	TGGCT	2	10	1141738	1141747	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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2763	NC_014623	GTC	2	6	1194583	1194588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2765	NC_014623	GC	3	6	1200076	1200081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2767	NC_014623	G	6	6	1200211	1200216	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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