MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 19528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014623	GTAA	2	8	577458	577465	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_014623	CTA	2	6	577467	577472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_014623	GTG	2	6	577480	577485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_014623	GTGG	2	8	577517	577524	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_014623	GCG	2	6	577593	577598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_014623	GGA	2	6	577635	577640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_014623	GAAAA	2	10	577678	577687	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_014623	GTA	2	6	577703	577708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_014623	GCG	2	6	577709	577714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_014623	CGG	2	6	577879	577884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_014623	TAC	2	6	577935	577940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_014623	CGC	2	6	578048	578053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1513	NC_014623	AGGC	2	8	578055	578062	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_014623	CAT	2	6	578081	578086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_014623	CGA	2	6	578161	578166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_014623	TAT	2	6	578175	578180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_014623	TG	3	6	578279	578284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_014623	CAGT	2	8	578456	578463	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1519	NC_014623	AGG	2	6	578572	578577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_014623	AGC	2	6	578588	578593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_014623	AAAG	2	8	578602	578609	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_014623	GCT	2	6	578751	578756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_014623	GAGG	2	8	578947	578954	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_014623	GTG	2	6	578978	578983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_014623	GGTG	2	8	579146	579153	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_014623	GA	3	6	579176	579181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_014623	CTC	2	6	579185	579190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_014623	GAA	2	6	579224	579229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_014623	AGCCGA	2	12	579258	579269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_014623	GA	3	6	579268	579273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_014623	GAT	2	6	579408	579413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_014623	CGG	2	6	579430	579435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_014623	GCA	2	6	579574	579579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_014623	TAC	2	6	579604	579609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_014623	ACC	2	6	579701	579706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_014623	TGG	2	6	579761	579766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_014623	GC	3	6	579808	579813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1538	NC_014623	GACA	2	8	579881	579888	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1539	NC_014623	GGT	2	6	579924	579929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_014623	CGT	2	6	580119	580124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_014623	CTG	2	6	580144	580149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_014623	ACG	2	6	580350	580355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_014623	GT	3	6	580368	580373	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_014623	G	6	6	580460	580465	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_014623	GA	3	6	580515	580520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_014623	CTTCT	2	10	580534	580543	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1547	NC_014623	T	6	6	580709	580714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_014623	GTTTT	2	10	580754	580763	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_014623	ACCGCC	2	12	582802	582813	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_014623	TC	3	6	582832	582837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_014623	GTG	2	6	582851	582856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_014623	TCC	2	6	582857	582862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_014623	C	6	6	583233	583238	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1554	NC_014623	CCT	2	6	583251	583256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_014623	CTC	2	6	583716	583721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1556	NC_014623	TC	3	6	583720	583725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1557	NC_014623	GCA	2	6	583753	583758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_014623	CAG	2	6	583825	583830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_014623	GAG	2	6	588288	588293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_014623	AGGA	2	8	588377	588384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_014623	CT	3	6	588390	588395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1562	NC_014623	GCT	2	6	588443	588448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_014623	CCG	2	6	588471	588476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1564	NC_014623	TTC	2	6	588493	588498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_014623	GGC	2	6	588504	588509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_014623	CCT	2	6	588514	588519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_014623	AG	4	8	588532	588539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_014623	CGT	2	6	591433	591438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_014623	GC	3	6	591446	591451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1570	NC_014623	CGG	2	6	591463	591468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_014623	T	6	6	591474	591479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_014623	TGGC	2	8	591490	591497	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1573	NC_014623	G	6	6	591572	591577	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_014623	GCCA	2	8	591587	591594	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1575	NC_014623	GAAGGG	2	12	591616	591627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_014623	CAG	2	6	592853	592858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_014623	CGGC	2	8	592862	592869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1578	NC_014623	GGA	2	6	592914	592919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_014623	TGG	2	6	592939	592944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_014623	CTTC	2	8	592955	592962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1581	NC_014623	AGG	2	6	592969	592974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_014623	GGCT	2	8	592997	593004	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1583	NC_014623	CGC	2	6	593090	593095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_014623	CTC	2	6	593697	593702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1585	NC_014623	GAATG	2	10	593713	593722	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_014623	C	6	6	593774	593779	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1587	NC_014623	AGC	2	6	593780	593785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_014623	GCT	2	6	593804	593809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_014623	GCGG	2	8	593816	593823	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1590	NC_014623	CGG	2	6	593830	593835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_014623	GCC	3	9	593880	593888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1592	NC_014623	TGAC	2	8	593971	593978	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_014623	A	6	6	593983	593988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_014623	GCGG	2	8	593991	593998	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1595	NC_014623	GAT	2	6	594040	594045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_014623	AG	4	8	594064	594071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_014623	GCA	2	6	602308	602313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_014623	GAA	2	6	602354	602359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_014623	TG	3	6	602360	602365	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_014623	AAC	2	6	602374	602379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_014623	C	6	6	602401	602406	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1602	NC_014623	CCAC	2	8	602503	602510	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1603	NC_014623	AAC	2	6	602619	602624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_014623	AGG	2	6	602638	602643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_014623	AG	3	6	603214	603219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_014623	CATG	2	8	603226	603233	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1607	NC_014623	GAG	2	6	603266	603271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_014623	GCCC	2	8	605618	605625	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1609	NC_014623	GGA	2	6	606411	606416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_014623	CGG	2	6	606426	606431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_014623	CAA	2	6	606493	606498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_014623	CCTG	2	8	606608	606615	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1613	NC_014623	C	6	6	606737	606742	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1614	NC_014623	TGG	2	6	607951	607956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_014623	GCG	2	6	608012	608017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_014623	CCT	2	6	609298	609303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1617	NC_014623	GCC	2	6	609588	609593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1618	NC_014623	CCTT	2	8	609629	609636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1619	NC_014623	GGC	2	6	609667	609672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_014623	CGT	2	6	609723	609728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_014623	CA	3	6	609823	609828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1622	NC_014623	GC	3	6	609863	609868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_014623	CCA	2	6	609874	609879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1624	NC_014623	AGC	2	6	609908	609913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_014623	CG	3	6	609923	609928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_014623	G	6	6	609950	609955	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_014623	TTG	2	6	609961	609966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_014623	AGCC	2	8	610031	610038	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1629	NC_014623	CTTTG	2	10	610152	610161	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1630	NC_014623	GCCGGG	2	12	613981	613992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_014623	TGC	2	6	614055	614060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_014623	GC	3	6	614059	614064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_014623	CTT	2	6	617649	617654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_014623	GGC	2	6	617686	617691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_014623	AGA	2	6	619031	619036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_014623	GTT	2	6	619063	619068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1761	NC_014623	GA	3	6	721860	721865	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1768	NC_014623	CAG	2	6	724618	724623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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