MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 19528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014623	CG	3	6	385504	385509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_014623	A	6	6	387210	387215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_014623	G	8	8	387261	387268	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_014623	C	6	6	387269	387274	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1005	NC_014623	GCT	2	6	387312	387317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_014623	TTG	2	6	387334	387339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_014623	GAA	2	6	387438	387443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_014623	CGA	3	9	387449	387457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_014623	CCA	2	6	387458	387463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_014623	ACG	2	6	387487	387492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_014623	GGT	2	6	387528	387533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_014623	AGCGC	2	10	387555	387564	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1013	NC_014623	GGC	2	6	391879	391884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_014623	GA	3	6	391924	391929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_014623	G	6	6	391988	391993	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_014623	GAGT	2	8	394636	394643	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_014623	T	6	6	394654	394659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_014623	T	7	7	394666	394672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_014623	GACGC	2	10	394673	394682	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1020	NC_014623	C	7	7	394723	394729	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1021	NC_014623	GAT	2	6	395251	395256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_014623	GC	3	6	395297	395302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_014623	CA	3	6	395355	395360	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_014623	CT	3	6	395969	395974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_014623	C	7	7	396023	396029	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1026	NC_014623	GCG	2	6	396953	396958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_014623	G	6	6	397000	397005	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_014623	GC	3	6	397782	397787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_014623	GT	3	6	397836	397841	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_014623	GCA	2	6	397889	397894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_014623	AGG	2	6	397895	397900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_014623	TG	3	6	397934	397939	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_014623	CGCT	2	8	397940	397947	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_014623	G	7	7	397959	397965	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_014623	GATG	2	8	398017	398024	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_014623	AAG	2	6	399965	399970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_014623	TA	3	6	400016	400021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_014623	AGAT	2	8	400023	400030	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_014623	TGCC	2	8	400031	400038	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_014623	CAGG	2	8	400050	400057	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_014623	TCT	2	6	400117	400122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_014623	G	7	7	400141	400147	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_014623	GCC	2	6	400200	400205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_014623	TCC	2	6	400226	400231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_014623	GAA	2	6	400237	400242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_014623	ACA	2	6	402182	402187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_014623	GCC	2	6	406511	406516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_014623	CGG	3	9	406531	406539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_014623	CCCA	2	8	406541	406548	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1050	NC_014623	C	7	7	406586	406592	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1051	NC_014623	TCC	2	6	406707	406712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_014623	GGT	2	6	406715	406720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_014623	GTCCA	2	10	408625	408634	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1054	NC_014623	G	6	6	408694	408699	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_014623	GAAG	2	8	408729	408736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_014623	CG	3	6	409930	409935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_014623	TGC	2	6	410489	410494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_014623	GTGG	2	8	410514	410521	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_014623	AGG	2	6	412524	412529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_014623	GGA	2	6	412570	412575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_014623	A	6	6	412586	412591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_014623	CTT	2	6	412616	412621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_014623	AGG	3	9	413090	413098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_014623	CCG	2	6	413115	413120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_014623	TCAA	2	8	413126	413133	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1066	NC_014623	CCT	2	6	413643	413648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_014623	GGT	2	6	413657	413662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_014623	TGA	2	6	413682	413687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_014623	GGGC	2	8	413689	413696	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_014623	GAGG	2	8	416824	416831	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_014623	CTTC	2	8	416848	416855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_014623	GTACC	2	10	416856	416865	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1073	NC_014623	AGC	2	6	416908	416913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_014623	CTC	2	6	417341	417346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_014623	AGCC	2	8	420078	420085	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_014623	GCG	2	6	420716	420721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_014623	A	6	6	421335	421340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_014623	CTGCG	2	10	422589	422598	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1079	NC_014623	GAC	2	6	422602	422607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1081	NC_014623	CGAT	2	8	422664	422671	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_014623	CTCG	2	8	423133	423140	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_014623	CCT	2	6	423184	423189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_014623	GCC	2	6	423224	423229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_014623	CTG	2	6	423256	423261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_014623	TGG	2	6	423344	423349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_014623	A	6	6	425743	425748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1090	NC_014623	GCGA	2	8	428143	428150	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_014623	CAT	2	6	429540	429545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_014623	TC	3	6	429571	429576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_014623	TC	3	6	429608	429613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_014623	G	6	6	429949	429954	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_014623	CT	3	6	429981	429986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1096	NC_014623	GC	3	6	430039	430044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_014623	CGG	2	6	430282	430287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_014623	CGC	2	6	430293	430298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_014623	TCC	2	6	432354	432359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_014623	G	9	9	432365	432373	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_014623	GGC	2	6	432394	432399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_014623	CCG	2	6	432445	432450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_014623	GAG	2	6	432458	432463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_014623	TGCC	2	8	432469	432476	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_014623	GGC	2	6	433549	433554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_014623	CGC	2	6	434281	434286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_014623	G	6	6	434287	434292	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_014623	CGAG	2	8	434293	434300	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1109	NC_014623	G	7	7	434350	434356	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_014623	TCA	2	6	437170	437175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_014623	GGT	2	6	437176	437181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_014623	GCC	2	6	437217	437222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_014623	CGT	2	6	437309	437314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_014623	C	6	6	437339	437344	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1115	NC_014623	GAG	2	6	437356	437361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_014623	GAG	2	6	440278	440283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_014623	AGA	2	6	440308	440313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_014623	C	8	8	440352	440359	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1119	NC_014623	AGC	2	6	440397	440402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_014623	CGT	2	6	440415	440420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_014623	GGC	2	6	440461	440466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_014623	CGA	2	6	440484	440489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_014623	TCG	2	6	440541	440546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_014623	TCA	2	6	440562	440567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_014623	GGT	2	6	440573	440578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_014623	GC	3	6	440583	440588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_014623	GAA	2	6	441088	441093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_014623	TCC	2	6	441106	441111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_014623	GC	3	6	442490	442495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_014623	GC	3	6	442511	442516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_014623	GC	4	8	442531	442538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_014623	CCT	2	6	442567	442572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_014623	GGA	2	6	442674	442679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_014623	AGG	2	6	444235	444240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_014623	AC	3	6	445066	445071	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1136	NC_014623	AGG	2	6	445077	445082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_014623	G	7	7	446463	446469	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_014623	CCT	2	6	446470	446475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1139	NC_014623	CTC	2	6	447300	447305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1140	NC_014623	GGAT	2	8	447311	447318	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_014623	GATC	2	8	447771	447778	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1163	NC_014623	CT	3	6	453244	453249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1164	NC_014623	G	6	6	454663	454668	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1258	NC_014623	GCCAT	2	10	478179	478188	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1259	NC_014623	C	7	7	480102	480108	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1260	NC_014623	CTG	2	6	480111	480116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1262	NC_014623	AG	3	6	480541	480546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1263	NC_014623	ATG	2	6	480575	480580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1264	NC_014623	CT	3	6	482178	482183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1265	NC_014623	C	6	6	482227	482232	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1266	NC_014623	GGA	2	6	482241	482246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1267	NC_014623	GAC	2	6	482297	482302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1268	NC_014623	GAG	2	6	488213	488218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1269	NC_014623	GCAG	2	8	488225	488232	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1270	NC_014623	AC	3	6	488359	488364	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1271	NC_014623	CCG	2	6	488418	488423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1272	NC_014623	TGCCT	2	10	490317	490326	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1408	NC_014623	GGCCA	2	10	556838	556847	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1409	NC_014623	CG	3	6	556871	556876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1414	NC_014623	CG	3	6	557110	557115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1415	NC_014623	CCTT	2	8	557118	557125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1451	NC_014623	AGC	2	6	574921	574926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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