MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfurimonas autotrophica DSM 16294 chromosome

Total Repeats: 386

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014506	ATAA	2	8	87	94	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014506	TTTA	2	8	17852	17859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014506	ATAA	2	8	42924	42931	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014506	AAAT	2	8	42959	42966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014506	AACA	2	8	52745	52752	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014506	AAAC	2	8	62112	62119	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014506	TTTA	2	8	66480	66487	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014506	TATT	2	8	78153	78160	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014506	AGTT	2	8	89165	89172	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014506	CAAA	2	8	106494	106501	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014506	TAAT	2	8	106570	106577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014506	TTTA	2	8	112760	112767	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014506	TTAT	2	8	130752	130759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014506	AGTA	2	8	135730	135737	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014506	ATAA	2	8	146637	146644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014506	GAAG	2	8	150940	150947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014506	TTAT	2	8	157364	157371	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014506	TTAT	2	8	158091	158098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014506	TAAA	2	8	158127	158134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014506	TTAA	2	8	160551	160558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014506	AAAT	2	8	170890	170897	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014506	TAAT	2	8	171064	171071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014506	AAAT	2	8	171335	171342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014506	TTTA	2	8	172254	172261	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014506	TAAT	2	8	176358	176365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014506	AAAT	2	8	176540	176547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014506	CTAA	2	8	176814	176821	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014506	TTCT	2	8	187189	187196	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014506	ATTT	2	8	188743	188750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014506	ATAA	2	8	197308	197315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014506	TAAA	2	8	197330	197337	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014506	ATAA	2	8	200912	200919	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014506	TCTT	2	8	209431	209438	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014506	AAAT	2	8	211123	211130	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014506	TCTT	2	8	222293	222300	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014506	TTTA	2	8	227429	227436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014506	TAAA	2	8	230313	230320	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014506	ATTG	2	8	237080	237087	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014506	AAAT	2	8	237171	237178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014506	ATTA	2	8	256728	256735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014506	AATA	2	8	268370	268377	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014506	AAAT	2	8	285705	285712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014506	TTTA	2	8	287478	287485	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014506	GAAA	2	8	287510	287517	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014506	AGTT	2	8	287703	287710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014506	CTAT	2	8	290692	290699	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014506	ATTC	2	8	299482	299489	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014506	TTTA	2	8	309682	309689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014506	GTTT	2	8	314451	314458	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014506	TGGA	2	8	323473	323480	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014506	TTCT	2	8	323508	323515	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014506	TTAA	3	12	333518	333529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014506	GATA	2	8	363123	363130	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014506	ATTT	2	8	372276	372283	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014506	CAAA	2	8	378562	378569	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014506	TTTA	2	8	378574	378581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014506	TTAA	2	8	397976	397983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014506	TTTA	2	8	411479	411486	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014506	ATTT	2	8	413799	413806	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014506	TAGT	2	8	413830	413837	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014506	TAAA	2	8	420259	420266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014506	TAAA	2	8	436871	436878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014506	TAAA	2	8	439787	439794	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014506	ATCT	2	8	439887	439894	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014506	TGAG	2	8	439928	439935	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014506	AATA	2	8	469764	469771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014506	TAAT	2	8	479181	479188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014506	TAGT	3	12	479193	479204	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014506	TAGT	2	8	482610	482617	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014506	ATTT	2	8	491762	491769	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014506	AAAT	2	8	494745	494752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014506	TATT	2	8	498457	498464	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014506	TGTC	2	8	498469	498476	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014506	AAAT	2	8	507033	507040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014506	GTAA	2	8	515138	515145	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014506	AAGA	2	8	515641	515648	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014506	AGTT	2	8	517015	517022	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014506	ATTT	2	8	519586	519593	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014506	ATTT	2	8	527402	527409	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014506	AATT	2	8	527427	527434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014506	TTTA	2	8	535113	535120	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014506	TAAA	2	8	542336	542343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014506	TTGT	2	8	544842	544849	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014506	ATTA	2	8	544889	544896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014506	AGCA	2	8	546465	546472	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014506	TATT	2	8	554109	554116	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014506	TTTA	2	8	558610	558617	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014506	TCTG	2	8	558707	558714	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014506	AATC	2	8	565718	565725	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014506	GCAA	2	8	565751	565758	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014506	ATAA	2	8	580725	580732	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014506	TAAT	2	8	583157	583164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014506	AGAA	2	8	585589	585596	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014506	TATC	2	8	589989	589996	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014506	AAAG	2	8	598843	598850	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014506	CAAA	2	8	626742	626749	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014506	AGTT	2	8	633694	633701	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014506	TATT	2	8	636992	636999	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014506	ATTT	2	8	649128	649135	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014506	TATG	2	8	653426	653433	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014506	TAAA	2	8	653503	653510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014506	ATTT	2	8	655113	655120	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014506	ATAA	2	8	657208	657215	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014506	TAAA	2	8	679016	679023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014506	TTTA	2	8	679170	679177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014506	TAGA	2	8	688546	688553	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014506	TAGT	2	8	696321	696328	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014506	GCTT	2	8	696539	696546	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014506	ATTG	2	8	697428	697435	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014506	TCAT	2	8	697992	697999	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014506	TTTA	2	8	698039	698046	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014506	TCAT	2	8	698569	698576	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014506	GAAG	2	8	698821	698828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014506	AACG	2	8	698977	698984	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014506	AAAG	2	8	699699	699706	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014506	GAAG	2	8	700089	700096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014506	GGTG	2	8	700249	700256	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014506	TCCC	2	8	700392	700399	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_014506	GACT	2	8	700969	700976	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014506	ATTT	2	8	701522	701529	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014506	TTAG	2	8	701592	701599	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014506	ACTC	2	8	701633	701640	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014506	TAAT	2	8	749253	749260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014506	TTAG	2	8	749289	749296	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014506	ATAA	2	8	749771	749778	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014506	TAAT	2	8	750170	750177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014506	AAAT	2	8	764070	764077	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014506	ATAA	2	8	765598	765605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014506	TAAA	2	8	774929	774936	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014506	AATA	2	8	774942	774949	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014506	GTAT	2	8	774956	774963	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014506	CCTG	2	8	781565	781572	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_014506	CCTG	2	8	781954	781961	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014506	TCAA	2	8	782037	782044	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014506	ATAA	2	8	785875	785882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014506	TCTT	2	8	803443	803450	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014506	TATC	2	8	807312	807319	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014506	TAAC	2	8	821686	821693	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014506	TATC	2	8	828017	828024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014506	TTTG	2	8	828026	828033	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014506	GTTT	2	8	828783	828790	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014506	TCAT	2	8	831034	831041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014506	GCAA	2	8	856519	856526	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014506	CAGA	2	8	876103	876110	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014506	GAAA	2	8	877587	877594	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014506	TTTA	2	8	910858	910865	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014506	ATTT	2	8	930931	930938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014506	TTTA	2	8	930947	930954	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014506	ATTT	2	8	964189	964196	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014506	TAAT	2	8	967568	967575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014506	ATAA	2	8	972316	972323	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.