MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae 670-6B chromosome

Total Repeats: 355

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014498	GTCCA	2	10	3477	3486	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_014498	TTATT	2	10	12629	12638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014498	ATTTT	2	10	14590	14599	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014498	AATTA	2	10	14643	14652	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014498	CCCAT	2	10	15446	15455	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_014498	CTTTT	2	10	15913	15922	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014498	CTGAA	2	10	15988	15997	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014498	TGAAA	2	10	18923	18932	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014498	TCGTG	2	10	32174	32183	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014498	GTTAA	2	10	32895	32904	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014498	GGGAG	2	10	33413	33422	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014498	AGGGA	2	10	35624	35633	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014498	CTTTT	2	10	39369	39378	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014498	CATTT	2	10	42598	42607	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014498	GAAGA	2	10	48036	48045	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014498	ATGGT	2	10	52150	52159	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014498	GCAAT	2	10	53940	53949	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014498	TTTTG	2	10	77534	77543	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014498	ATTAT	2	10	77675	77684	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014498	TTTTA	2	10	77812	77821	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014498	AGAGG	2	10	96577	96586	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014498	TTATT	2	10	117042	117051	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014498	ATTCA	2	10	122959	122968	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014498	TATCA	2	10	128714	128723	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014498	GAAAG	2	10	130570	130579	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014498	ATAAA	2	10	138756	138765	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014498	TAACC	2	10	138854	138863	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_014498	GGCTT	2	10	154929	154938	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014498	GGAAT	2	10	156769	156778	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014498	AAACT	2	10	165919	165928	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014498	AAATT	2	10	166925	166934	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014498	AGGAT	2	10	166956	166965	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014498	GCTTT	2	10	167840	167849	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014498	TATTG	2	10	167877	167886	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014498	TAAAA	2	10	173679	173688	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014498	ATTAA	2	10	177095	177104	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014498	GTTTG	2	10	183700	183709	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014498	ACATG	2	10	183845	183854	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014498	GAAAA	2	10	184437	184446	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014498	ACAAA	2	10	195591	195600	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014498	TTTTC	2	10	196995	197004	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014498	TGAAA	2	10	211817	211826	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014498	ATTTC	2	10	213343	213352	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014498	ATAAA	2	10	215888	215897	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014498	TATAT	2	10	216335	216344	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014498	TTCTC	2	10	219824	219833	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_014498	CCCTG	2	10	226774	226783	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
48	NC_014498	CCTTT	2	10	236480	236489	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_014498	CATTT	2	10	236997	237006	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014498	TAAGG	2	10	237148	237157	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014498	AAGGA	2	10	255532	255541	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014498	GTTCA	2	10	257166	257175	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014498	AAAAT	2	10	260973	260982	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014498	ATCGA	2	10	261721	261730	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014498	TTTTA	2	10	266345	266354	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014498	ATTCT	2	10	271011	271020	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014498	CTATC	2	10	272233	272242	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_014498	CTTTT	2	10	286037	286046	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014498	CTTAA	2	10	288384	288393	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014498	AAGCC	2	10	302156	302165	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_014498	AATAG	2	10	303702	303711	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014498	TGATA	2	10	312834	312843	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014498	AAATT	2	10	320461	320470	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014498	TTTAT	2	10	331233	331242	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014498	TTAAG	2	10	331654	331663	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014498	TAAAG	2	10	336205	336214	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014498	AAAAT	2	10	336329	336338	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014498	CTTTT	2	10	339839	339848	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014498	CTTAA	2	10	344855	344864	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014498	AAATA	2	10	356389	356398	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014498	AGGTG	2	10	378249	378258	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014498	TTAAA	2	10	384752	384761	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014498	TTATC	2	10	388387	388396	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014498	ATAAA	2	10	404373	404382	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014498	TTAAA	2	10	419981	419990	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014498	TTCTG	2	10	432917	432926	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_014498	TTAAG	2	10	435467	435476	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014498	TTACC	2	10	443664	443673	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_014498	GACTG	2	10	474935	474944	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_014498	ATATA	2	10	483595	483604	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014498	AAATA	2	10	485929	485938	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014498	AGAAA	2	10	485950	485959	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014498	TTGTC	2	10	491563	491572	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014498	ATACT	3	15	491787	491801	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014498	CTGGT	2	10	498237	498246	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014498	GAAAG	2	10	501031	501040	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014498	TTTGT	2	10	503682	503691	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014498	TTTAT	2	10	505586	505595	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014498	ATTTA	2	10	505700	505709	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014498	AAGAG	2	10	517440	517449	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014498	CAGGG	2	10	520768	520777	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
92	NC_014498	TGAAA	2	10	526101	526110	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014498	CTATT	2	10	528171	528180	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014498	AATAA	2	10	533424	533433	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014498	CTTTT	2	10	534692	534701	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014498	TAAAA	2	10	534705	534714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014498	TGTTT	2	10	537577	537586	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014498	TACTT	2	10	538184	538193	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_014498	CTTTC	2	10	543640	543649	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_014498	ATAAA	2	10	546020	546029	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014498	AGCGA	2	10	549155	549164	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014498	ATTCA	2	10	553362	553371	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014498	TACTG	2	10	554135	554144	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_014498	ATATA	2	10	554152	554161	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014498	TTCTT	2	10	556717	556726	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_014498	GATAA	2	10	559393	559402	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014498	GTATA	2	10	564846	564855	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014498	ATTGG	2	10	577368	577377	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014498	TATAA	2	10	577464	577473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014498	CTTTT	2	10	580325	580334	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014498	TTTTA	2	10	580406	580415	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014498	ATTTT	2	10	588572	588581	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014498	ATAAA	2	10	591446	591455	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014498	TTTTA	2	10	591597	591606	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014498	AGGAA	2	10	597807	597816	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014498	ATAAA	2	10	605843	605852	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014498	TTAGT	2	10	610221	610230	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014498	ATATA	2	10	617816	617825	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014498	TAGTA	2	10	621046	621055	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014498	ATAAC	2	10	621112	621121	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_014498	CATTT	2	10	622499	622508	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014498	TAAAA	2	10	630768	630777	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014498	AAACA	2	10	659596	659605	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014498	ATATA	2	10	662335	662344	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014498	AAAAG	2	10	700579	700588	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014498	GAAAA	2	10	701618	701627	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014498	GTTAT	2	10	701657	701666	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014498	TAAAA	2	10	704015	704024	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014498	GGATT	2	10	716164	716173	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014498	TTTAG	2	10	739687	739696	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014498	CTATC	2	10	742545	742554	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_014498	AGGGG	2	10	742652	742661	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014498	CCCTG	2	10	742738	742747	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
134	NC_014498	CTTAA	2	10	744944	744953	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_014498	TCAAA	2	10	760199	760208	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_014498	AATTG	2	10	761266	761275	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014498	CTGGA	2	10	765390	765399	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_014498	ATTTT	2	10	774350	774359	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014498	TTAAG	2	10	775974	775983	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014498	TTCTG	2	10	776045	776054	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_014498	TTCAA	2	10	784750	784759	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_014498	TAAAA	2	10	787705	787714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014498	AGTAA	2	10	793012	793021	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014498	ATTAA	2	10	795388	795397	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014498	ATTTG	2	10	802972	802981	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014498	ATATT	2	10	803179	803188	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014498	AACTA	2	10	809973	809982	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_014498	CTATT	2	10	814564	814573	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_014498	CAGGA	2	10	815328	815337	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
150	NC_014498	AAATA	2	10	816521	816530	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014498	TGAAA	2	10	818916	818925	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014498	TATAT	2	10	828313	828322	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_014498	AATTC	2	10	850213	850222	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
155	NC_014498	ATATA	2	10	850312	850321	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014498	ACGAT	2	10	861500	861509	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
157	NC_014498	AAATA	2	10	878653	878662	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014498	AAATA	2	10	878714	878723	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_014498	AAAAT	2	10	878758	878767	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014498	AGTAA	2	10	896833	896842	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_014498	TTGCC	2	10	900893	900902	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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164	NC_014498	AAGAA	2	10	902725	902734	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014498	GACTC	2	10	903163	903172	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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168	NC_014498	CTTTT	2	10	920991	921000	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
169	NC_014498	CTGAA	2	10	923801	923810	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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171	NC_014498	TTTCT	2	10	946123	946132	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
172	NC_014498	CAGGT	2	10	966051	966060	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
173	NC_014498	AAATA	2	10	979867	979876	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_014498	AAAAT	2	10	1014096	1014105	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_014498	TTTTA	2	10	1022484	1022493	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_014498	TTCAT	2	10	1068639	1068648	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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197	NC_014498	TGAAA	2	10	1146576	1146585	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
198	NC_014498	TAAAA	2	10	1148503	1148512	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_014498	ATAAA	2	10	1157407	1157416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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227	NC_014498	TAGAT	2	10	1331481	1331490	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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267	NC_014498	AAAAT	2	10	1619991	1620000	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_014498	TGCCA	2	10	1620297	1620306	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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272	NC_014498	ATTTC	2	10	1648797	1648806	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
273	NC_014498	CCTTT	2	10	1654275	1654284	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
274	NC_014498	CATTT	2	10	1654792	1654801	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
275	NC_014498	TAAGG	2	10	1654943	1654952	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_014498	TTGTA	2	10	1680652	1680661	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_014498	TTTTC	2	10	1714237	1714246	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
282	NC_014498	CTTTC	2	10	1719010	1719019	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
283	NC_014498	TCCTA	2	10	1722494	1722503	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
284	NC_014498	TGTCT	2	10	1723572	1723581	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
285	NC_014498	ATTAA	2	10	1743005	1743014	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.