MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae AP200 chromosome

Total Repeats: 343

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014494	TGAAA	2	10	3170	3179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014494	TCGTG	2	10	16424	16433	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014494	GTTAA	2	10	17145	17154	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014494	GGGAG	2	10	17663	17672	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014494	AGGGA	2	10	19874	19883	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014494	CTTTT	2	10	23316	23325	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014494	ATTAT	2	10	59163	59172	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014494	TTTTA	2	10	59299	59308	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014494	AGAGG	2	10	77934	77943	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014494	TTTAT	2	10	98253	98262	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014494	ATTCA	2	10	104174	104183	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014494	TAATA	2	10	106696	106705	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014494	CTAGT	2	10	114152	114161	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014494	TGATA	2	10	115234	115243	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014494	TATCA	2	10	116940	116949	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014494	GAAAG	2	10	118799	118808	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014494	ATAAA	2	10	126241	126250	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014494	TAACC	2	10	126339	126348	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_014494	GGCTT	2	10	142061	142070	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014494	AAATT	2	10	152804	152813	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014494	AGGAT	2	10	152835	152844	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014494	GCTTT	2	10	153869	153878	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014494	TATTG	2	10	153906	153915	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014494	TAAAA	2	10	159616	159625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014494	ATTAA	2	10	163384	163393	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014494	GAAAA	2	10	170724	170733	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014494	TGAAA	2	10	201298	201307	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014494	ATTTC	2	10	202824	202833	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014494	CTATT	2	10	212161	212170	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014494	ACTTA	2	10	231194	231203	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014494	AAGGA	2	10	237520	237529	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014494	AAAAT	2	10	242962	242971	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014494	ATCGA	2	10	243710	243719	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014494	TTTTA	2	10	248334	248343	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014494	ATTCT	2	10	252998	253007	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014494	CTATC	2	10	254220	254229	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_014494	CTTTT	2	10	267181	267190	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014494	CTTAA	2	10	269538	269547	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014494	AAGCC	2	10	283335	283344	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_014494	AATAG	2	10	284881	284890	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014494	TGATA	2	10	294058	294067	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014494	CTTTT	2	10	313723	313732	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014494	TAGAA	2	10	317293	317302	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014494	AAATA	2	10	328754	328763	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014494	GAGAA	2	10	329543	329552	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014494	AATAA	2	10	349344	349353	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014494	ATAAA	2	10	372931	372940	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014494	TTTTA	2	10	392173	392182	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014494	TAAAA	2	10	404282	404291	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014494	GACTG	2	10	429843	429852	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014494	TGATT	2	10	431900	431909	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014494	CTGAC	2	10	437529	437538	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_014494	TCCAG	2	10	437554	437563	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_014494	AAATA	2	10	440942	440951	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014494	AGAAA	2	10	440963	440972	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014494	ATTTC	2	10	443707	443716	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014494	TTTGC	2	10	444087	444096	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014494	TTTAT	2	10	447269	447278	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014494	ATTTA	2	10	447383	447392	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014494	AAGAG	2	10	459079	459088	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014494	CAGGG	2	10	462407	462416	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014494	TGAAA	2	10	467740	467749	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014494	CTATT	2	10	469810	469819	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014494	AATAA	2	10	475067	475076	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014494	CTTTT	2	10	476335	476344	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014494	TAAAA	2	10	476348	476357	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014494	TGTTT	2	10	479221	479230	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014494	CTTTC	2	10	485291	485300	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_014494	ATAAA	2	10	487671	487680	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014494	AGCGA	2	10	490806	490815	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014494	ATTCA	2	10	495012	495021	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014494	TACTG	2	10	495785	495794	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014494	ATATA	2	10	495802	495811	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014494	TTCTT	2	10	498367	498376	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_014494	GATAA	2	10	501043	501052	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014494	CAATA	2	10	506097	506106	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_014494	ATTGG	2	10	518252	518261	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014494	TATAA	2	10	518348	518357	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014494	TTTTA	2	10	521117	521126	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014494	CTTTT	2	10	521208	521217	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014494	ACTAT	2	10	521268	521277	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014494	TTTTA	2	10	521289	521298	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014494	ATTTT	2	10	526629	526638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014494	TTTTA	2	10	530633	530642	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014494	TTTAT	2	10	534874	534883	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014494	TTAAT	2	10	534891	534900	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014494	AGGAA	2	10	536949	536958	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014494	TGTCT	2	10	545431	545440	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014494	ATATA	2	10	557015	557024	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014494	TAGTA	2	10	560245	560254	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014494	CATTT	2	10	561698	561707	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_014494	TAAAA	2	10	570081	570090	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014494	ATTAT	2	10	580244	580253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014494	AAACA	2	10	600128	600137	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014494	ATATA	2	10	602866	602875	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014494	CTAAG	2	10	612478	612487	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_014494	TATGA	2	10	617036	617045	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014494	GAAAA	2	10	642667	642676	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014494	GTTAT	2	10	642706	642715	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014494	GATGG	2	10	645449	645458	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014494	TTTAT	2	10	655143	655152	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014494	ATTTT	2	10	655427	655436	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014494	TAGTA	2	10	680996	681005	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014494	AGGGG	2	10	683934	683943	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014494	CCCTG	2	10	684020	684029	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
106	NC_014494	ATGGA	2	10	705451	705460	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014494	TTATT	2	10	707746	707755	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014494	CTTAG	2	10	712326	712335	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_014494	ATAAA	2	10	717058	717067	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014494	GGAAA	2	10	725999	726008	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014494	TAAAA	2	10	736048	736057	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014494	TAAAA	2	10	748936	748945	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014494	ATTTT	2	10	750188	750197	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014494	TAAAA	2	10	751382	751391	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014494	CAAGA	2	10	756239	756248	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_014494	CAAAT	2	10	758368	758377	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014494	AAAAT	2	10	758413	758422	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014494	CTGAT	2	10	761942	761951	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014494	CTGAA	2	10	764139	764148	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014494	ATAAA	2	10	764309	764318	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014494	TTTGA	2	10	764337	764346	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014494	AAATA	2	10	771964	771973	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014494	TATTT	2	10	787527	787536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014494	AAATA	2	10	808817	808826	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014494	TTTTG	2	10	817675	817684	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014494	ATCAA	2	10	824605	824614	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014494	AAGGC	2	10	847635	847644	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_014494	AAAGA	2	10	849721	849730	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014494	AAAAT	2	10	849938	849947	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014494	TTCAT	2	10	852126	852135	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_014494	TGAAA	2	10	852855	852864	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014494	ATAAC	2	10	856997	857006	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014494	CAAGA	2	10	865747	865756	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_014494	GCTAA	2	10	865831	865840	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_014494	TATAT	2	10	882581	882590	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014494	ATCTA	2	10	889086	889095	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014494	TATGA	2	10	891151	891160	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014494	AAATC	2	10	898663	898672	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_014494	AGGTT	2	10	898742	898751	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014494	AGAAC	2	10	903515	903524	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_014494	ATATA	2	10	907001	907010	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014494	CTTTT	2	10	912403	912412	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_014494	TAATA	2	10	913415	913424	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014494	ATAGA	2	10	922289	922298	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014494	TAAAA	2	10	927491	927500	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014494	CTTTT	2	10	934097	934106	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_014494	TTATT	2	10	939035	939044	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014494	ACCAA	2	10	941158	941167	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
149	NC_014494	TCTTT	2	10	943208	943217	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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331	NC_014494	ATTAT	2	10	1992150	1992159	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NC_014494	ATCAA	2	10	1996694	1996703	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.