MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Spirochaeta thermophila DSM 6192 chromosome

Total Repeats: 435

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014484	GTTT	2	8	40	47	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014484	GAGG	2	8	17806	17813	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014484	CATA	2	8	46623	46630	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014484	CTGG	2	8	47989	47996	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014484	AAAC	2	8	74616	74623	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014484	GAAA	2	8	74645	74652	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014484	TCTT	2	8	74927	74934	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014484	GGAG	2	8	75037	75044	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014484	GGGA	2	8	77257	77264	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014484	TTTA	2	8	77846	77853	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014484	GAGG	2	8	83663	83670	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014484	GGAG	2	8	97794	97801	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014484	GTGG	2	8	105755	105762	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014484	CTTC	2	8	143012	143019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014484	GAGG	2	8	148626	148633	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014484	TCTT	2	8	198166	198173	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014484	GAGG	2	8	203274	203281	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014484	ACTG	2	8	204326	204333	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014484	GAGG	2	8	208349	208356	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014484	CCCT	2	8	219268	219275	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_014484	TTGA	2	8	219312	219319	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014484	AGGG	2	8	219375	219382	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014484	GCAG	2	8	243142	243149	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014484	CGAC	2	8	269252	269259	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014484	CGGA	2	8	278436	278443	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014484	CCTA	2	8	280977	280984	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014484	GGGT	2	8	281025	281032	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014484	ATCC	2	8	281041	281048	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014484	CTAA	2	8	287826	287833	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014484	GTGG	2	8	291216	291223	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014484	AGGC	2	8	291318	291325	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014484	GAGG	2	8	291422	291429	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014484	GCCC	2	8	296343	296350	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_014484	CGTC	2	8	300564	300571	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014484	GATA	2	8	300577	300584	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014484	GGGA	2	8	311988	311995	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014484	GATA	2	8	318313	318320	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014484	ATTT	2	8	321948	321955	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014484	TAAA	2	8	326080	326087	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014484	TCCC	2	8	327522	327529	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_014484	GCGT	2	8	327551	327558	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014484	TCTG	2	8	339382	339389	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014484	TGAG	2	8	339414	339421	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014484	CTGC	2	8	339508	339515	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014484	AGGG	2	8	345291	345298	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014484	GAGG	2	8	402768	402775	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014484	TGCG	2	8	415846	415853	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014484	GCCT	2	8	418912	418919	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014484	CGAT	2	8	425517	425524	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014484	CCCT	2	8	425859	425866	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_014484	GAGG	2	8	430897	430904	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014484	TTCT	2	8	431004	431011	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014484	TCAG	2	8	431052	431059	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014484	CGCC	2	8	431933	431940	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_014484	GTGA	2	8	431949	431956	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014484	CCGG	2	8	432146	432153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014484	GGAA	2	8	434800	434807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014484	GGCC	2	8	441236	441243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014484	CCCT	2	8	449028	449035	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
60	NC_014484	ACCG	2	8	449045	449052	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014484	GCCG	2	8	451993	452000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014484	CGGC	2	8	452003	452010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014484	TGAG	3	12	453118	453129	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014484	AAGG	2	8	453132	453139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014484	TCGA	2	8	456358	456365	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014484	ATCT	2	8	457158	457165	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014484	GTTC	2	8	460970	460977	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014484	AAAC	2	8	462078	462085	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014484	ACTG	2	8	462385	462392	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014484	CGTT	2	8	462554	462561	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014484	TCGA	2	8	476366	476373	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014484	GGAG	2	8	477588	477595	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014484	TCCT	2	8	485190	485197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014484	CGGG	2	8	485322	485329	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014484	GGAT	2	8	493128	493135	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014484	AGGA	2	8	501013	501020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014484	TCCT	2	8	506365	506372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014484	GGTT	2	8	506381	506388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014484	CCGC	2	8	546878	546885	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
80	NC_014484	ATCG	2	8	546926	546933	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014484	TCTT	2	8	558221	558228	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014484	CCGG	2	8	558729	558736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014484	GTGA	2	8	569586	569593	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014484	TATT	2	8	573787	573794	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014484	CCTG	2	8	576155	576162	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014484	ACCG	2	8	587941	587948	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014484	TGAG	2	8	612840	612847	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014484	TTTC	2	8	615563	615570	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014484	TCTG	2	8	616163	616170	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014484	AGGA	2	8	616454	616461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014484	GAAC	2	8	632613	632620	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_014484	GAGG	2	8	634042	634049	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014484	GGAG	2	8	634672	634679	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014484	GCCA	2	8	634735	634742	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_014484	AAAC	2	8	635220	635227	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014484	CCAA	2	8	635335	635342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014484	AGCG	2	8	635907	635914	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014484	GGAC	2	8	637106	637113	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014484	AACG	2	8	638657	638664	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014484	AGGA	2	8	640489	640496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014484	GAAG	2	8	661967	661974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014484	CTTC	2	8	667474	667481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014484	ACCC	2	8	669453	669460	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
104	NC_014484	CGGC	2	8	671828	671835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_014484	CGTT	2	8	681560	681567	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014484	CTCC	2	8	683884	683891	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
107	NC_014484	AAGG	2	8	684847	684854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014484	AGCC	2	8	693252	693259	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014484	GAGG	2	8	693289	693296	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014484	ACAT	2	8	693379	693386	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014484	ACAT	2	8	704459	704466	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014484	ATTG	2	8	704498	704505	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014484	TGCG	2	8	719544	719551	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014484	CGCT	2	8	720133	720140	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014484	GGAG	2	8	771052	771059	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014484	GAGG	2	8	771123	771130	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014484	TCTT	2	8	773164	773171	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014484	TCCT	2	8	788816	788823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014484	GTCC	2	8	788842	788849	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014484	TGCG	2	8	802795	802802	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014484	GCCG	2	8	803707	803714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014484	CAGA	2	8	816045	816052	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014484	GAAG	2	8	817121	817128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014484	ATTC	2	8	819616	819623	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014484	AGCG	2	8	824310	824317	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014484	TGAA	2	8	824339	824346	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014484	GAAC	2	8	824557	824564	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014484	GAGG	2	8	825986	825993	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014484	GGAG	2	8	826618	826625	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014484	GCCA	2	8	826681	826688	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014484	AAAC	2	8	827166	827173	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014484	CCAA	2	8	827281	827288	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_014484	AGCG	2	8	827853	827860	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014484	GGAC	2	8	829052	829059	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014484	CTCC	2	8	829511	829518	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
136	NC_014484	ATGG	2	8	833304	833311	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014484	TCCC	2	8	833332	833339	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
138	NC_014484	CCCT	2	8	858986	858993	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
139	NC_014484	GCCC	2	8	866719	866726	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
140	NC_014484	AGGA	2	8	922066	922073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014484	GAGG	2	8	925886	925893	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014484	CTCC	2	8	934890	934897	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
143	NC_014484	AGCA	2	8	970218	970225	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014484	GGAG	2	8	977892	977899	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014484	CCTG	2	8	977997	978004	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_014484	CTTC	2	8	978320	978327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_014484	AGGG	2	8	990939	990946	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014484	GAGG	2	8	1003851	1003858	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014484	GGCT	2	8	1031882	1031889	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014484	GCCT	2	8	1032169	1032176	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_014484	AGGC	2	8	1039181	1039188	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.