MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Spirochaeta thermophila DSM 6192 chromosome

Total Repeats: 3922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014484	CGC	2	6	1895341	1895346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3002	NC_014484	GT	3	6	1895354	1895359	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_014484	TCT	2	6	1895375	1895380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_014484	TC	3	6	1897751	1897756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3005	NC_014484	CAA	2	6	1897765	1897770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_014484	GGA	2	6	1897771	1897776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_014484	AGG	2	6	1899289	1899294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_014484	CT	3	6	1901628	1901633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3009	NC_014484	TCA	2	6	1901635	1901640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_014484	CTC	2	6	1903172	1903177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3011	NC_014484	TC	3	6	1903192	1903197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3012	NC_014484	CCGG	2	8	1903210	1903217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3013	NC_014484	ACA	2	6	1903226	1903231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_014484	CCT	2	6	1903653	1903658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3015	NC_014484	TACG	2	8	1904132	1904139	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3016	NC_014484	GT	4	8	1904140	1904147	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_014484	CAC	2	6	1904156	1904161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_014484	GCG	2	6	1904271	1904276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_014484	GGAT	2	8	1904278	1904285	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_014484	ACCC	2	8	1904311	1904318	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3021	NC_014484	GA	3	6	1904333	1904338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_014484	AGG	2	6	1905692	1905697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_014484	GAT	2	6	1906609	1906614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_014484	C	6	6	1906618	1906623	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3025	NC_014484	GGT	2	6	1906627	1906632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_014484	CAAGAC	2	12	1906643	1906654	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_014484	TTG	2	6	1906697	1906702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_014484	GGCG	2	8	1908815	1908822	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3029	NC_014484	GC	3	6	1908884	1908889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3030	NC_014484	CAGG	2	8	1909639	1909646	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3031	NC_014484	CTC	2	6	1909652	1909657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3032	NC_014484	CG	3	6	1909766	1909771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_014484	CGA	2	6	1914137	1914142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_014484	TTC	2	6	1914190	1914195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_014484	GGA	2	6	1914210	1914215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_014484	AATC	2	8	1917289	1917296	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3037	NC_014484	CGA	2	6	1917317	1917322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_014484	CTC	2	6	1917327	1917332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3039	NC_014484	G	8	8	1920945	1920952	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_014484	T	6	6	1926023	1926028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_014484	TCC	2	6	1926066	1926071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3042	NC_014484	TA	3	6	1927079	1927084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_014484	T	6	6	1928855	1928860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_014484	CAC	2	6	1928861	1928866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3045	NC_014484	CTA	2	6	1928870	1928875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_014484	CAG	2	6	1928894	1928899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_014484	CCTT	2	8	1930154	1930161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3048	NC_014484	CTT	2	6	1930164	1930169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_014484	CTC	2	6	1930180	1930185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3050	NC_014484	TCG	2	6	1930187	1930192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_014484	CTC	2	6	1930216	1930221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3052	NC_014484	C	6	6	1930232	1930237	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3053	NC_014484	CG	3	6	1930242	1930247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3054	NC_014484	GC	3	6	1930874	1930879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3055	NC_014484	TCC	3	9	1930898	1930906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3056	NC_014484	T	7	7	1930920	1930926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_014484	CCAT	2	8	1930941	1930948	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3058	NC_014484	AGTCGG	2	12	1930958	1930969	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3059	NC_014484	CGT	2	6	1930986	1930991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3061	NC_014484	A	7	7	1936051	1936057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_014484	CAA	2	6	1937551	1937556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_014484	GCC	2	6	1937559	1937564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3064	NC_014484	GGC	2	6	1937572	1937577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_014484	TCCT	2	8	1938563	1938570	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3066	NC_014484	A	6	6	1938646	1938651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_014484	A	9	9	1938678	1938686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_014484	GGC	2	6	1938694	1938699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_014484	CCT	2	6	1939630	1939635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3070	NC_014484	AG	3	6	1939639	1939644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_014484	AGG	2	6	1939757	1939762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_014484	CT	3	6	1944385	1944390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_014484	GCA	3	9	1944394	1944402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_014484	TCC	2	6	1945450	1945455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3075	NC_014484	T	6	6	1945531	1945536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_014484	CG	3	6	1946241	1946246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3077	NC_014484	TCG	2	6	1947511	1947516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_014484	G	6	6	1947523	1947528	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_014484	GTC	2	6	1947551	1947556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3081	NC_014484	CACTA	2	10	1948239	1948248	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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3083	NC_014484	GGA	2	6	1948289	1948294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_014484	GA	3	6	1948293	1948298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3086	NC_014484	GGA	2	6	1948314	1948319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3092	NC_014484	C	6	6	1958635	1958640	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3093	NC_014484	T	6	6	1958715	1958720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_014484	AGA	2	6	1958734	1958739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3099	NC_014484	TG	3	6	1958950	1958955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_014484	TTTC	2	8	1959012	1959019	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3101	NC_014484	GT	3	6	1959060	1959065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_014484	TGG	2	6	1959073	1959078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_014484	GCG	2	6	1959110	1959115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_014484	G	6	6	1959205	1959210	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_014484	G	6	6	1959239	1959244	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3110	NC_014484	GGAGA	2	10	1959529	1959538	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_014484	TGG	2	6	1959545	1959550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_014484	GTG	2	6	1959565	1959570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3114	NC_014484	GT	3	6	1960077	1960082	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_014484	CCG	2	6	1960100	1960105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3116	NC_014484	GA	3	6	1960111	1960116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_014484	A	7	7	1960241	1960247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3130	NC_014484	AGG	2	6	1965499	1965504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_014484	CGG	2	6	1965512	1965517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_014484	CCTC	2	8	1968099	1968106	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3133	NC_014484	AC	3	6	1970649	1970654	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3134	NC_014484	CTC	2	6	1970953	1970958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3251	NC_014484	CCTCCC	2	12	2065186	2065197	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
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3257	NC_014484	CT	4	8	2065890	2065897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3258	NC_014484	TCC	2	6	2067559	2067564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3259	NC_014484	TA	3	6	2067565	2067570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3260	NC_014484	GAT	2	6	2067572	2067577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3262	NC_014484	CGGTG	2	10	2067593	2067602	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3263	NC_014484	GCC	2	6	2069657	2069662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3264	NC_014484	GCCCG	2	10	2069724	2069733	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3265	NC_014484	TA	3	6	2069814	2069819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3266	NC_014484	G	6	6	2073253	2073258	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3392	NC_014484	CGCAC	2	10	2164213	2164222	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3393	NC_014484	CCCCCT	2	12	2164223	2164234	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
3394	NC_014484	C	7	7	2164269	2164275	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3395	NC_014484	CCTC	2	8	2164307	2164314	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3396	NC_014484	AGA	2	6	2164331	2164336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3397	NC_014484	CCT	2	6	2164454	2164459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3398	NC_014484	CT	3	6	2165802	2165807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3399	NC_014484	CTC	3	9	2168762	2168770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3400	NC_014484	GCC	2	6	2168835	2168840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3401	NC_014484	CGG	2	6	2168848	2168853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3402	NC_014484	ATCCC	2	10	2168861	2168870	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3403	NC_014484	AG	3	6	2168887	2168892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3404	NC_014484	AGG	2	6	2172365	2172370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3405	NC_014484	CTC	2	6	2172387	2172392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3406	NC_014484	CAA	2	6	2172433	2172438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3407	NC_014484	GGCCG	2	10	2172455	2172464	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3408	NC_014484	GGA	2	6	2173617	2173622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3411	NC_014484	AGG	2	6	2173754	2173759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3423	NC_014484	A	7	7	2186534	2186540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3424	NC_014484	CTC	2	6	2188779	2188784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3425	NC_014484	CTT	2	6	2191509	2191514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3427	NC_014484	CCCT	2	8	2191567	2191574	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3428	NC_014484	GTT	2	6	2192884	2192889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3431	NC_014484	ATG	2	6	2193066	2193071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3432	NC_014484	AGT	2	6	2193132	2193137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3433	NC_014484	TGG	2	6	2193200	2193205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3434	NC_014484	TC	4	8	2193212	2193219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3435	NC_014484	TTC	2	6	2193264	2193269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3436	NC_014484	GCC	2	6	2193277	2193282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3437	NC_014484	GCG	2	6	2193285	2193290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3438	NC_014484	CT	3	6	2193312	2193317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3439	NC_014484	GGTGTC	3	18	2194030	2194047	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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3443	NC_014484	TCC	2	6	2194185	2194190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3444	NC_014484	AT	3	6	2194202	2194207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3445	NC_014484	CTCTA	2	10	2194217	2194226	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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3453	NC_014484	TG	3	6	2196347	2196352	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3472	NC_014484	CGATG	2	10	2209412	2209421	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3474	NC_014484	TGG	2	6	2209474	2209479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3500	NC_014484	CCT	3	9	2214723	2214731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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