MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 6044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014251	AGG	2	6	1201995	1202000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_014251	ATTT	2	8	1202845	1202852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_014251	TA	3	6	1202858	1202863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_014251	TTA	2	6	1204952	1204957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_014251	TCG	2	6	1204960	1204965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_014251	CCT	2	6	1204986	1204991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3507	NC_014251	AAG	2	6	1205018	1205023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_014251	CTC	2	6	1205050	1205055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3509	NC_014251	TTTA	2	8	1205071	1205078	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_014251	A	6	6	1206818	1206823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_014251	T	7	7	1207040	1207046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_014251	GTT	2	6	1207060	1207065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_014251	CTA	3	9	1207864	1207872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_014251	AAAC	2	8	1207882	1207889	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3515	NC_014251	TCA	2	6	1207890	1207895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_014251	ACA	2	6	1207909	1207914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_014251	AAACAA	2	12	1207920	1207931	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3518	NC_014251	GTTT	2	8	1207942	1207949	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_014251	TTG	2	6	1207968	1207973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_014251	TGA	2	6	1208006	1208011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_014251	GTG	2	6	1208018	1208023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_014251	ATT	2	6	1209030	1209035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_014251	TTATG	2	10	1209108	1209117	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_014251	TAG	2	6	1209121	1209126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_014251	TGC	2	6	1209142	1209147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_014251	AAAG	2	8	1211362	1211369	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_014251	TCT	2	6	1211397	1211402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_014251	GAT	2	6	1211404	1211409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_014251	CTC	2	6	1211645	1211650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3530	NC_014251	AAAAT	2	10	1211682	1211691	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_014251	GTG	2	6	1211718	1211723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_014251	TGT	2	6	1211730	1211735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_014251	TA	4	8	1211739	1211746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_014251	AT	3	6	1211753	1211758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_014251	AGA	2	6	1211841	1211846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_014251	A	7	7	1211899	1211905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_014251	AGA	2	6	1211910	1211915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_014251	A	7	7	1211956	1211962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_014251	T	7	7	1214022	1214028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_014251	A	7	7	1214037	1214043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_014251	TCTT	2	8	1214056	1214063	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3542	NC_014251	AGT	2	6	1214086	1214091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_014251	A	6	6	1214101	1214106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_014251	AG	3	6	1214177	1214182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_014251	AG	3	6	1214232	1214237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_014251	AGC	2	6	1216770	1216775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_014251	AGTTCT	2	12	1216838	1216849	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3548	NC_014251	T	7	7	1216852	1216858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_014251	TAG	2	6	1216878	1216883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_014251	TAAA	2	8	1216984	1216991	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_014251	TAAT	2	8	1217010	1217017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_014251	ATG	2	6	1217042	1217047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_014251	A	7	7	1217048	1217054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_014251	TAT	2	6	1217064	1217069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_014251	TCA	2	6	1217140	1217145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_014251	GGT	2	6	1217178	1217183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_014251	TTTTA	2	10	1217675	1217684	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_014251	AATC	2	8	1217718	1217725	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3559	NC_014251	AAAATT	2	12	1217769	1217780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_014251	AT	3	6	1217851	1217856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_014251	TAGT	2	8	1217878	1217885	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_014251	T	8	8	1217938	1217945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_014251	TA	3	6	1219437	1219442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_014251	TTA	2	6	1219449	1219454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_014251	A	6	6	1223601	1223606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_014251	T	6	6	1223647	1223652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_014251	GTAAG	2	10	1223711	1223720	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_014251	AAG	2	6	1223738	1223743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_014251	ATAAG	2	10	1225727	1225736	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_014251	TAAA	2	8	1225742	1225749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_014251	TTAGA	2	10	1225808	1225817	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_014251	A	6	6	1225837	1225842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_014251	TCG	2	6	1225872	1225877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_014251	AGGA	2	8	1227015	1227022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_014251	AGAT	2	8	1228736	1228743	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_014251	TAAAG	2	10	1228777	1228786	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_014251	AAG	2	6	1229790	1229795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3579	NC_014251	T	7	7	1229816	1229822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_014251	ATTT	2	8	1229826	1229833	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_014251	TAAG	2	8	1230939	1230946	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_014251	TAG	2	6	1230952	1230957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_014251	ACAA	2	8	1231050	1231057	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3584	NC_014251	ATA	2	6	1231073	1231078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_014251	TAC	2	6	1231107	1231112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_014251	TTGAT	2	10	1231124	1231133	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_014251	CTATTT	2	12	1231152	1231163	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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3589	NC_014251	A	6	6	1231331	1231336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_014251	TAAA	2	8	1231368	1231375	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_014251	ACATA	2	10	1231391	1231400	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3592	NC_014251	T	7	7	1234608	1234614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_014251	TATTT	2	10	1234642	1234651	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_014251	AG	3	6	1234669	1234674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_014251	ATGA	2	8	1234682	1234689	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_014251	AACTA	2	10	1234868	1234877	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3597	NC_014251	TGA	2	6	1234916	1234921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_014251	CTG	2	6	1234943	1234948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_014251	ATAA	2	8	1234949	1234956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_014251	ACTT	2	8	1234964	1234971	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3601	NC_014251	AGG	2	6	1234979	1234984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_014251	TTC	2	6	1235009	1235014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_014251	CCT	2	6	1241070	1241075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3604	NC_014251	TA	3	6	1241088	1241093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_014251	TAT	2	6	1241109	1241114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_014251	TAT	2	6	1241122	1241127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_014251	TAT	2	6	1241129	1241134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_014251	A	6	6	1241177	1241182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_014251	TAT	2	6	1241220	1241225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_014251	TAT	2	6	1249621	1249626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_014251	CTTT	2	8	1249670	1249677	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3612	NC_014251	TCA	2	6	1249681	1249686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_014251	TAGA	2	8	1249722	1249729	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_014251	ATA	2	6	1249754	1249759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_014251	A	6	6	1249759	1249764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_014251	TGT	2	6	1249826	1249831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3618	NC_014251	TA	3	6	1249930	1249935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_014251	AATT	2	8	1250017	1250024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_014251	CTA	2	6	1250063	1250068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3623	NC_014251	C	6	6	1250891	1250896	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3624	NC_014251	A	7	7	1250928	1250934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_014251	AAC	2	6	1250966	1250971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_014251	AGAA	2	8	1250977	1250984	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_014251	TTC	2	6	1252249	1252254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_014251	ACT	2	6	1252337	1252342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_014251	CAAT	2	8	1252383	1252390	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3630	NC_014251	T	6	6	1252416	1252421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_014251	T	6	6	1252437	1252442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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