MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 6044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014251	T	6	6	168563	168568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_014251	AAT	2	6	168590	168595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_014251	AAT	2	6	168624	168629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_014251	TCC	2	6	168636	168641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_014251	AGG	2	6	168676	168681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_014251	TGA	2	6	169512	169517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_014251	TAGA	2	8	169547	169554	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
508	NC_014251	TGA	2	6	169557	169562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_014251	AGTC	2	8	169563	169570	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
510	NC_014251	AT	3	6	169573	169578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_014251	ATG	2	6	169598	169603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_014251	TCTG	2	8	169630	169637	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
513	NC_014251	CTGA	2	8	169638	169645	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
514	NC_014251	CAC	2	6	169658	169663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_014251	ATT	2	6	169669	169674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_014251	TGA	2	6	169851	169856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_014251	GAG	2	6	169922	169927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_014251	TAT	2	6	169966	169971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_014251	GACT	2	8	170039	170046	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
520	NC_014251	A	6	6	170083	170088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_014251	TGA	2	6	170194	170199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_014251	GAG	2	6	170265	170270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_014251	GACT	2	8	170382	170389	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
524	NC_014251	A	6	6	170426	170431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_014251	ACTA	2	8	170485	170492	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
526	NC_014251	TATT	2	8	170529	170536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_014251	T	6	6	170535	170540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_014251	A	6	6	170592	170597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_014251	A	7	7	174179	174185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_014251	A	6	6	174194	174199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_014251	TATAT	2	10	174231	174240	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_014251	CAT	2	6	174267	174272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_014251	CATT	2	8	178708	178715	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
534	NC_014251	TA	3	6	178781	178786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_014251	ATA	2	6	178928	178933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_014251	AC	3	6	178936	178941	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
537	NC_014251	T	6	6	178951	178956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_014251	T	6	6	180276	180281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_014251	A	6	6	180287	180292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_014251	TAT	2	6	180309	180314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_014251	AGG	2	6	180325	180330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_014251	GTT	2	6	180344	180349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_014251	AAG	2	6	180360	180365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_014251	TTAG	4	16	180366	180381	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
545	NC_014251	AAT	2	6	180385	180390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_014251	AAAT	2	8	180563	180570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_014251	CAC	2	6	180616	180621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_014251	CGG	2	6	180642	180647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_014251	TC	3	6	182100	182105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
550	NC_014251	ACT	2	6	182162	182167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_014251	GTT	2	6	182195	182200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_014251	CA	3	6	182345	182350	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
553	NC_014251	CCT	2	6	182430	182435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_014251	CGT	2	6	182601	182606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_014251	A	7	7	182612	182618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_014251	CGA	2	6	182619	182624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_014251	TCG	2	6	182631	182636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_014251	T	12	12	182658	182669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_014251	CAA	4	12	182810	182821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_014251	AT	3	6	182854	182859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_014251	A	6	6	182860	182865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_014251	CTTT	2	8	182892	182899	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
563	NC_014251	TAA	2	6	182918	182923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_014251	A	7	7	182930	182936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_014251	ATA	2	6	183692	183697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_014251	TTGC	2	8	183914	183921	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
567	NC_014251	TGCT	2	8	183925	183932	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
568	NC_014251	GCC	2	6	183937	183942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_014251	T	6	6	183943	183948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_014251	TTG	2	6	183961	183966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_014251	AAG	2	6	184932	184937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_014251	TGC	2	6	184955	184960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_014251	T	6	6	184976	184981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_014251	AC	3	6	186814	186819	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
575	NC_014251	TAAA	2	8	186824	186831	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_014251	TCC	2	6	188366	188371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_014251	T	7	7	188445	188451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_014251	A	7	7	188459	188465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_014251	GAG	2	6	188469	188474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_014251	TG	3	6	188477	188482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_014251	A	6	6	188491	188496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_014251	TAG	2	6	190102	190107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_014251	CT	3	6	191925	191930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
584	NC_014251	A	6	6	191954	191959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_014251	T	6	6	192042	192047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_014251	TAA	2	6	192075	192080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_014251	AAAATC	2	12	192090	192101	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
588	NC_014251	CTTTT	2	10	192117	192126	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
589	NC_014251	TGAA	2	8	192154	192161	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
590	NC_014251	TTCTT	2	10	192177	192186	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
591	NC_014251	AAG	2	6	192214	192219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_014251	CTT	2	6	192271	192276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_014251	TTG	2	6	192285	192290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_014251	TTG	2	6	192300	192305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_014251	ATT	2	6	192340	192345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_014251	CTT	2	6	192358	192363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_014251	ATC	2	6	192364	192369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_014251	TAT	2	6	192384	192389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_014251	TGGTTT	2	12	192391	192402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_014251	TGGTTT	2	12	192424	192435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_014251	TGGTTT	2	12	192457	192468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_014251	TGGTTT	2	12	192490	192501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_014251	TGGTTT	2	12	192556	192567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_014251	TGGTTT	2	12	192589	192600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_014251	TGGTTT	2	12	192622	192633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_014251	TTAA	2	8	194249	194256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_014251	AGAA	2	8	194420	194427	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
608	NC_014251	A	7	7	195772	195778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_014251	T	7	7	195826	195832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_014251	TAT	2	6	195855	195860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_014251	T	6	6	197455	197460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_014251	TA	3	6	197495	197500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_014251	CTTT	2	8	198053	198060	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
614	NC_014251	TA	3	6	198077	198082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_014251	AAT	2	6	198086	198091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_014251	TAA	2	6	198119	198124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_014251	A	6	6	198123	198128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_014251	CTA	2	6	200132	200137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_014251	ATC	2	6	200193	200198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_014251	CTTTT	2	10	205519	205528	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
621	NC_014251	CCT	2	6	206562	206567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_014251	A	8	8	206585	206592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_014251	AT	3	6	206718	206723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_014251	TA	3	6	206730	206735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_014251	A	6	6	208170	208175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_014251	GAT	2	6	208187	208192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_014251	ATT	2	6	208206	208211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_014251	A	6	6	208217	208222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_014251	CTTCC	2	10	209872	209881	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
630	NC_014251	AAG	2	6	209897	209902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_014251	ATA	2	6	212361	212366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_014251	ACCT	2	8	212446	212453	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
633	NC_014251	CTT	2	6	213026	213031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_014251	TAT	2	6	213058	213063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_014251	T	6	6	213089	213094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_014251	CTT	2	6	215056	215061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_014251	GAT	2	6	215085	215090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_014251	T	6	6	215090	215095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_014251	AAT	2	6	215752	215757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_014251	ACT	2	6	215783	215788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_014251	AT	3	6	215933	215938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_014251	AGA	2	6	217119	217124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
643	NC_014251	GATA	2	8	217128	217135	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
644	NC_014251	GAT	2	6	217557	217562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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646	NC_014251	TGA	2	6	217888	217893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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648	NC_014251	ATT	2	6	218332	218337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
649	NC_014251	T	6	6	218336	218341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
650	NC_014251	GATA	2	8	218371	218378	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
651	NC_014251	TTA	2	6	218438	218443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
652	NC_014251	ATT	2	6	218461	218466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
653	NC_014251	A	6	6	218522	218527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
654	NC_014251	T	6	6	219610	219615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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656	NC_014251	T	7	7	220471	220477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
657	NC_014251	CTT	2	6	220481	220486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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660	NC_014251	CTT	2	6	221870	221875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
661	NC_014251	A	7	7	221898	221904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
662	NC_014251	TAA	2	6	221909	221914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
663	NC_014251	CTT	2	6	227143	227148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
664	NC_014251	TAT	2	6	227158	227163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
665	NC_014251	CCT	2	6	229710	229715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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667	NC_014251	TAT	2	6	229730	229735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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675	NC_014251	AAAT	2	8	234104	234111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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679	NC_014251	TCA	2	6	235969	235974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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684	NC_014251	T	8	8	239602	239609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
685	NC_014251	T	6	6	239645	239650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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688	NC_014251	A	6	6	239713	239718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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759	NC_014251	ATTTT	2	10	260135	260144	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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765	NC_014251	GAA	2	6	261719	261724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
766	NC_014251	ACA	2	6	262459	262464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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768	NC_014251	AGCT	2	8	262477	262484	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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773	NC_014251	TAT	3	9	262621	262629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
774	NC_014251	TGAC	2	8	262651	262658	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
775	NC_014251	TCA	2	6	262673	262678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
776	NC_014251	A	8	8	262775	262782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
777	NC_014251	T	6	6	262890	262895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
778	NC_014251	CT	3	6	263385	263390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
779	NC_014251	CTTTT	2	10	263428	263437	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
780	NC_014251	TAT	2	6	263447	263452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
781	NC_014251	G	7	7	263479	263485	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
782	NC_014251	CGA	2	6	263587	263592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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