MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 6044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014251	AAT	2	6	1775280	1775285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_014251	TAT	2	6	1775293	1775298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_014251	AG	3	6	1775363	1775368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_014251	T	9	9	1775428	1775436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_014251	T	6	6	1775480	1775485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_014251	AAT	2	6	1775519	1775524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_014251	GAGAA	2	10	1775586	1775595	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_014251	ATA	2	6	1775609	1775614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_014251	AATT	2	8	1775661	1775668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5012	NC_014251	ACT	2	6	1775728	1775733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_014251	AGT	2	6	1775739	1775744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_014251	TCA	2	6	1775780	1775785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_014251	A	7	7	1775785	1775791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_014251	TTC	2	6	1775851	1775856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5019	NC_014251	AAAC	2	8	1778880	1778887	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5020	NC_014251	ATG	2	6	1779002	1779007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_014251	ATT	2	6	1779272	1779277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_014251	TC	3	6	1779302	1779307	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5023	NC_014251	CTA	3	9	1779327	1779335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_014251	ATCT	2	8	1779347	1779354	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5025	NC_014251	AGAT	2	8	1779369	1779376	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_014251	TAT	2	6	1779407	1779412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_014251	TAG	2	6	1779449	1779454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5029	NC_014251	TA	3	6	1779478	1779483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_014251	AGT	2	6	1779498	1779503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5033	NC_014251	A	6	6	1780130	1780135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_014251	ATA	2	6	1780146	1780151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_014251	T	7	7	1780280	1780286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5040	NC_014251	CT	4	8	1781481	1781488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5041	NC_014251	T	6	6	1781503	1781508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_014251	CTTC	2	8	1781510	1781517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5043	NC_014251	TGA	2	6	1781583	1781588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_014251	CTTT	2	8	1783668	1783675	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5049	NC_014251	AT	3	6	1792487	1792492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_014251	CCT	2	6	1792885	1792890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5052	NC_014251	ATT	2	6	1792928	1792933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_014251	TAA	2	6	1792960	1792965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5057	NC_014251	TAT	2	6	1793398	1793403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_014251	A	7	7	1793407	1793413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_014251	TTC	2	6	1798079	1798084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5061	NC_014251	TGT	2	6	1798110	1798115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5063	NC_014251	ATT	2	6	1799233	1799238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_014251	T	6	6	1800121	1800126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5073	NC_014251	ACGGA	2	10	1802982	1802991	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5089	NC_014251	TAT	2	6	1805616	1805621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5098	NC_014251	TATT	2	8	1807885	1807892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_014251	T	6	6	1807913	1807918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_014251	T	6	6	1807922	1807927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_014251	T	6	6	1807945	1807950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_014251	GGA	2	6	1807988	1807993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5104	NC_014251	AG	3	6	1812947	1812952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_014251	A	6	6	1812953	1812958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_014251	TCA	2	6	1812991	1812996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5109	NC_014251	TC	3	6	1813304	1813309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5110	NC_014251	GTT	2	6	1813771	1813776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5112	NC_014251	TCC	2	6	1815038	1815043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_014251	A	8	8	1815083	1815090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_014251	GATT	2	8	1815115	1815122	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_014251	TCT	2	6	1820122	1820127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_014251	CCT	3	9	1822537	1822545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5117	NC_014251	A	6	6	1822568	1822573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_014251	C	6	6	1822585	1822590	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5119	NC_014251	AAT	2	6	1823603	1823608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_014251	TCTA	2	8	1823640	1823647	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5121	NC_014251	A	6	6	1823655	1823660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_014251	ACAT	2	8	1825336	1825343	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5123	NC_014251	A	6	6	1825362	1825367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_014251	T	6	6	1825437	1825442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5128	NC_014251	AAC	2	6	1825530	1825535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_014251	AGAA	2	8	1825846	1825853	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_014251	TTTTC	2	10	1825876	1825885	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5132	NC_014251	TAT	2	6	1825997	1826002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5268	NC_014251	ACC	2	6	1875133	1875138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5269	NC_014251	CAC	2	6	1875149	1875154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5270	NC_014251	TTG	2	6	1875192	1875197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5271	NC_014251	T	6	6	1875217	1875222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5272	NC_014251	T	6	6	1875235	1875240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5273	NC_014251	T	7	7	1875245	1875251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5274	NC_014251	GAACAT	2	12	1875291	1875302	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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5282	NC_014251	A	6	6	1876943	1876948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5283	NC_014251	CT	3	6	1880448	1880453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5284	NC_014251	TCT	2	6	1880459	1880464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5287	NC_014251	T	6	6	1881597	1881602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5289	NC_014251	T	6	6	1882281	1882286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5290	NC_014251	TTATA	2	10	1882313	1882322	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5291	NC_014251	T	7	7	1882360	1882366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5292	NC_014251	A	6	6	1882367	1882372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5300	NC_014251	AT	3	6	1888842	1888847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5301	NC_014251	TTC	2	6	1888904	1888909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5304	NC_014251	A	6	6	1889079	1889084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5314	NC_014251	TTG	3	9	1895590	1895598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5323	NC_014251	TGTT	2	8	1897756	1897763	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5325	NC_014251	TAAAA	2	10	1897818	1897827	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5350	NC_014251	CTTAT	2	10	1907452	1907461	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5351	NC_014251	TA	3	6	1907462	1907467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5368	NC_014251	TCACT	2	10	1914537	1914546	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5369	NC_014251	ACT	2	6	1914572	1914577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5387	NC_014251	TTG	2	6	1917551	1917556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5388	NC_014251	TATT	2	8	1917557	1917564	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5389	NC_014251	AAT	2	6	1917598	1917603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5390	NC_014251	CT	3	6	1923127	1923132	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5391	NC_014251	TCT	2	6	1927321	1927326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5392	NC_014251	T	6	6	1927335	1927340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5393	NC_014251	TGAT	2	8	1927342	1927349	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5394	NC_014251	GAAC	2	8	1927373	1927380	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5395	NC_014251	CT	4	8	1927411	1927418	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5396	NC_014251	TAATCA	2	12	1927419	1927430	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5397	NC_014251	GGA	2	6	1929677	1929682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5398	NC_014251	ATA	2	6	1932730	1932735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5399	NC_014251	C	7	7	1932750	1932756	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5400	NC_014251	A	7	7	1932788	1932794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5402	NC_014251	AGAA	2	8	1932837	1932844	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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