MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 6723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014220	CCT	2	6	1492896	1492901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4002	NC_014220	GACT	2	8	1493886	1493893	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4003	NC_014220	TA	3	6	1493917	1493922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_014220	TCCC	2	8	1495226	1495233	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4005	NC_014220	GTTAT	2	10	1495397	1495406	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_014220	ATC	2	6	1495411	1495416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_014220	TTA	2	6	1495506	1495511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_014220	AGCA	2	8	1495522	1495529	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4009	NC_014220	CTC	2	6	1495533	1495538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4010	NC_014220	CTT	2	6	1495756	1495761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_014220	GAA	2	6	1495767	1495772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_014220	TACC	2	8	1495848	1495855	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4013	NC_014220	CTG	2	6	1495858	1495863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_014220	CAA	2	6	1495978	1495983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_014220	A	6	6	1496034	1496039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_014220	TTC	2	6	1496075	1496080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_014220	TTC	2	6	1496082	1496087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_014220	TTC	2	6	1496089	1496094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_014220	TTC	2	6	1496096	1496101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_014220	TCC	2	6	1499051	1499056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4021	NC_014220	CTT	2	6	1499902	1499907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_014220	AAG	2	6	1500009	1500014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_014220	TAT	2	6	1500105	1500110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_014220	ACC	2	6	1502473	1502478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4025	NC_014220	TCC	2	6	1503982	1503987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4026	NC_014220	GTT	2	6	1503994	1503999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_014220	TCC	2	6	1507606	1507611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4031	NC_014220	A	6	6	1507762	1507767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_014220	CTT	2	6	1507836	1507841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_014220	CTA	2	6	1507846	1507851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_014220	CCT	2	6	1508252	1508257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4037	NC_014220	AAT	2	6	1508366	1508371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_014220	A	6	6	1511292	1511297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_014220	CCCT	2	8	1512881	1512888	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4040	NC_014220	CCG	2	6	1512928	1512933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4041	NC_014220	GTTT	2	8	1512942	1512949	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_014220	ACA	2	6	1512960	1512965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_014220	A	7	7	1512986	1512992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_014220	GAA	2	6	1513067	1513072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_014220	A	7	7	1513531	1513537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_014220	A	6	6	1513543	1513548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_014220	CAAG	2	8	1513634	1513641	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4048	NC_014220	CAA	2	6	1513784	1513789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_014220	TGT	2	6	1516278	1516283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4051	NC_014220	CCT	2	6	1517382	1517387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_014220	TGT	2	6	1518381	1518386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_014220	TGGT	2	8	1519083	1519090	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_014220	CAT	2	6	1519149	1519154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_014220	GGT	2	6	1519181	1519186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_014220	CAGG	2	8	1519199	1519206	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4057	NC_014220	GGT	2	6	1519276	1519281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_014220	TACC	2	8	1519300	1519307	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4059	NC_014220	TAT	2	6	1519439	1519444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4062	NC_014220	TCG	2	6	1520706	1520711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_014220	TA	3	6	1520717	1520722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_014220	GTTA	2	8	1520800	1520807	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_014220	CAA	2	6	1520883	1520888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_014220	AACAT	2	10	1520899	1520908	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4070	NC_014220	A	6	6	1521189	1521194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4072	NC_014220	ATA	2	6	1521312	1521317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4074	NC_014220	AGG	2	6	1521387	1521392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_014220	ATG	2	6	1524750	1524755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4080	NC_014220	C	6	6	1526254	1526259	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4081	NC_014220	CAGC	2	8	1526285	1526292	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4082	NC_014220	C	6	6	1526663	1526668	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4083	NC_014220	TAT	2	6	1526683	1526688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4085	NC_014220	CA	3	6	1526838	1526843	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4086	NC_014220	CTC	2	6	1528373	1528378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4087	NC_014220	AT	3	6	1528456	1528461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_014220	TA	4	8	1528475	1528482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_014220	A	7	7	1528495	1528501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_014220	TAC	2	6	1529557	1529562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_014220	TAA	2	6	1532892	1532897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_014220	CAAG	2	8	1532908	1532915	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4093	NC_014220	CGT	2	6	1533955	1533960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_014220	CCTT	2	8	1535726	1535733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4095	NC_014220	CTCG	2	8	1535866	1535873	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4096	NC_014220	ATA	2	6	1535916	1535921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_014220	AGA	2	6	1535933	1535938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_014220	GA	3	6	1535937	1535942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_014220	TAA	2	6	1535953	1535958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_014220	TGGTTG	2	12	1536657	1536668	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_014220	CAC	2	6	1537811	1537816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4102	NC_014220	T	6	6	1537817	1537822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_014220	CTC	2	6	1539501	1539506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4104	NC_014220	A	7	7	1539522	1539528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_014220	CCT	2	6	1539533	1539538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4106	NC_014220	AGA	2	6	1539793	1539798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_014220	ATT	2	6	1541810	1541815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4109	NC_014220	A	6	6	1541836	1541841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_014220	CT	3	6	1541847	1541852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4111	NC_014220	TTA	2	6	1543135	1543140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_014220	CA	3	6	1543148	1543153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4113	NC_014220	GGA	2	6	1543219	1543224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_014220	A	6	6	1543246	1543251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_014220	TCT	2	6	1543299	1543304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_014220	CCT	2	6	1544078	1544083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4117	NC_014220	TTC	2	6	1544088	1544093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_014220	GT	3	6	1544101	1544106	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_014220	CTT	2	6	1544148	1544153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_014220	AT	3	6	1544203	1544208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_014220	GTT	2	6	1544225	1544230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_014220	AT	3	6	1544249	1544254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_014220	AGT	2	6	1544256	1544261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_014220	TCC	2	6	1545658	1545663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4125	NC_014220	T	6	6	1545678	1545683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_014220	TAG	2	6	1545688	1545693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_014220	TAC	2	6	1545697	1545702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_014220	A	6	6	1545767	1545772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_014220	GCCC	2	8	1545855	1545862	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4130	NC_014220	TCC	2	6	1545867	1545872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4131	NC_014220	TAC	2	6	1547980	1547985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_014220	ACC	2	6	1549082	1549087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4133	NC_014220	AGC	2	6	1549094	1549099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_014220	GCT	2	6	1549107	1549112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4135	NC_014220	CT	4	8	1549111	1549118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4136	NC_014220	TAC	2	6	1549252	1549257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4137	NC_014220	GTA	2	6	1549328	1549333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_014220	AAAT	2	8	1549367	1549374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4139	NC_014220	A	7	7	1552279	1552285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4140	NC_014220	TA	3	6	1552296	1552301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4141	NC_014220	CCT	2	6	1552713	1552718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4142	NC_014220	TCC	2	6	1552926	1552931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4143	NC_014220	TAA	2	6	1553462	1553467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4144	NC_014220	CCT	2	6	1553476	1553481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4145	NC_014220	CTA	2	6	1553562	1553567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4147	NC_014220	CTT	2	6	1553661	1553666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4148	NC_014220	GCT	2	6	1555656	1555661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4151	NC_014220	AGT	2	6	1555750	1555755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4153	NC_014220	TCC	2	6	1557177	1557182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4154	NC_014220	TGAAGT	2	12	1557190	1557201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4155	NC_014220	GTT	2	6	1557227	1557232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4163	NC_014220	ACA	2	6	1558580	1558585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4164	NC_014220	A	6	6	1559421	1559426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4165	NC_014220	CTTT	2	8	1559461	1559468	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4192	NC_014220	A	6	6	1570200	1570205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4221	NC_014220	GGTT	2	8	1581619	1581626	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4254	NC_014220	A	6	6	1597589	1597594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4256	NC_014220	CG	3	6	1597729	1597734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4257	NC_014220	TGT	2	6	1597775	1597780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4259	NC_014220	TTG	2	6	1597822	1597827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4262	NC_014220	CG	3	6	1597927	1597932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4263	NC_014220	CG	3	6	1597994	1597999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4264	NC_014220	CG	3	6	1598061	1598066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4267	NC_014220	CG	3	6	1598194	1598199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4268	NC_014220	CTG	2	6	1598210	1598215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4303	NC_014220	CG	3	6	1599391	1599396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4388	NC_014220	AGGCA	2	10	1602661	1602670	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4389	NC_014220	GTTTC	2	10	1602676	1602685	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4390	NC_014220	CG	3	6	1602698	1602703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4391	NC_014220	TTG	2	6	1602715	1602720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4393	NC_014220	CG	3	6	1602829	1602834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4394	NC_014220	TTTA	2	8	1602853	1602860	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4395	NC_014220	CG	3	6	1602897	1602902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4396	NC_014220	T	6	6	1602926	1602931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4397	NC_014220	CG	3	6	1602963	1602968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4398	NC_014220	GGA	2	6	1602979	1602984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4399	NC_014220	GAA	2	6	1603001	1603006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4400	NC_014220	CG	3	6	1603030	1603035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4401	NC_014220	CG	3	6	1603096	1603101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4402	NC_014220	CG	3	6	1603161	1603166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4403	NC_014220	CGG	2	6	1603179	1603184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4404	NC_014220	ATG	2	6	1603187	1603192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4405	NC_014220	CG	3	6	1603227	1603232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4406	NC_014220	CG	3	6	1603293	1603298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4407	NC_014220	CG	3	6	1603358	1603363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4408	NC_014220	ATA	2	6	1603380	1603385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4410	NC_014220	CG	3	6	1603490	1603495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4411	NC_014220	ACT	2	6	1603524	1603529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4432	NC_014220	CG	3	6	1604289	1604294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4433	NC_014220	CG	3	6	1604357	1604362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4435	NC_014220	CG	3	6	1604488	1604493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4444	NC_014220	CG	3	6	1604819	1604824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4469	NC_014220	CG	3	6	1605552	1605557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4494	NC_014220	CATA	2	8	1617133	1617140	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4500	NC_014220	TAA	3	9	1619911	1619919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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