MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 6723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014220	CCTA	2	8	549741	549748	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_014220	TCCC	2	8	549750	549757	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1503	NC_014220	ATA	2	6	549860	549865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_014220	GGGT	2	8	549876	549883	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_014220	AGG	2	6	551808	551813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_014220	GCA	2	6	551814	551819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_014220	GGCAA	2	10	553929	553938	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1508	NC_014220	CTA	2	6	553946	553951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_014220	ATA	2	6	554001	554006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_014220	TGGC	2	8	554042	554049	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1511	NC_014220	AGA	2	6	554050	554055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_014220	ACG	2	6	554056	554061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_014220	TGG	2	6	554062	554067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_014220	GAGAG	2	10	554086	554095	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_014220	CTGG	2	8	555107	555114	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1516	NC_014220	ATG	2	6	555152	555157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_014220	GAG	2	6	555204	555209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_014220	GA	3	6	555212	555217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_014220	TAT	2	6	556603	556608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_014220	CGGAA	2	10	556743	556752	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1521	NC_014220	AAC	2	6	558124	558129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_014220	GA	3	6	558238	558243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_014220	TA	3	6	561524	561529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_014220	G	6	6	563329	563334	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_014220	T	7	7	564544	564550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_014220	GAGAG	2	10	565311	565320	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_014220	AAG	2	6	567058	567063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_014220	T	6	6	567778	567783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_014220	TTA	2	6	567787	567792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_014220	ATT	2	6	567845	567850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_014220	CGT	2	6	567957	567962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_014220	TGGGG	2	10	569528	569537	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_014220	GAAT	2	8	570249	570256	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_014220	TTC	2	6	570808	570813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_014220	ATC	2	6	571561	571566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_014220	AGA	2	6	571661	571666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_014220	C	6	6	571682	571687	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1538	NC_014220	TGC	2	6	571689	571694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_014220	C	6	6	572290	572295	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1540	NC_014220	CTG	2	6	572400	572405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_014220	T	8	8	572482	572489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_014220	GAAA	2	8	572507	572514	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_014220	AGG	2	6	572534	572539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_014220	GTT	2	6	573034	573039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_014220	TCT	2	6	573047	573052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_014220	TCA	2	6	573059	573064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_014220	AG	4	8	573133	573140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_014220	G	8	8	573144	573151	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_014220	TC	3	6	574288	574293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1550	NC_014220	C	6	6	574374	574379	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1551	NC_014220	AAAAAG	2	12	575044	575055	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_014220	AT	3	6	575102	575107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_014220	CCT	2	6	575557	575562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_014220	T	6	6	575597	575602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_014220	TTCA	2	8	575648	575655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1556	NC_014220	CCGA	2	8	575760	575767	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1557	NC_014220	GAA	2	6	575815	575820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_014220	GGT	2	6	577685	577690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_014220	GTG	2	6	578152	578157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_014220	GGT	2	6	578158	578163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_014220	TAA	2	6	579226	579231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_014220	TTG	2	6	579235	579240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_014220	GAC	2	6	580678	580683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_014220	AAAG	2	8	580713	580720	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_014220	ACT	2	6	581922	581927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_014220	TCCTA	2	10	581944	581953	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1567	NC_014220	AG	3	6	581960	581965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_014220	TAG	2	6	582022	582027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_014220	TGG	2	6	582049	582054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_014220	GTA	2	6	582122	582127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_014220	GGT	2	6	582162	582167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_014220	T	7	7	582287	582293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_014220	AGG	2	6	582297	582302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_014220	GTG	2	6	582553	582558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_014220	ATT	2	6	582622	582627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_014220	TAA	2	6	582642	582647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_014220	GAG	2	6	582701	582706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_014220	GCTC	2	8	582716	582723	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_014220	CTC	2	6	582729	582734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1580	NC_014220	GCT	2	6	582821	582826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_014220	GCT	2	6	582881	582886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_014220	CCT	2	6	582892	582897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1583	NC_014220	GT	3	6	582933	582938	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_014220	CTC	2	6	582977	582982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1585	NC_014220	GAA	2	6	587762	587767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_014220	AAG	2	6	587802	587807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_014220	AGG	2	6	587813	587818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1589	NC_014220	A	6	6	588764	588769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_014220	AGA	2	6	588776	588781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_014220	AAG	2	6	588788	588793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_014220	AAAAG	2	10	588847	588856	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_014220	ATT	2	6	588891	588896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_014220	AAT	2	6	588933	588938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_014220	ATC	2	6	588947	588952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1597	NC_014220	A	6	6	590950	590955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_014220	T	6	6	590975	590980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1600	NC_014220	TGG	2	6	590992	590997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_014220	CCT	2	6	591327	591332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NC_014220	TTC	2	6	591354	591359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_014220	AAC	2	6	591400	591405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_014220	AAT	2	6	591413	591418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_014220	A	6	6	591528	591533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_014220	A	6	6	591535	591540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_014220	TTGAT	2	10	591580	591589	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_014220	GTT	2	6	591590	591595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_014220	CTC	2	6	593103	593108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_014220	A	7	7	593116	593122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_014220	TTTG	2	8	593136	593143	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_014220	CA	3	6	593207	593212	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1613	NC_014220	CCT	2	6	593275	593280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1615	NC_014220	CTTG	2	8	593391	593398	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1616	NC_014220	TGG	2	6	593409	593414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_014220	GTG	2	6	593447	593452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_014220	CTT	2	6	593518	593523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_014220	CGG	2	6	593589	593594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_014220	AAC	2	6	593595	593600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_014220	TAA	2	6	593605	593610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_014220	TAG	2	6	593735	593740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_014220	TA	3	6	593748	593753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1627	NC_014220	AT	3	6	594833	594838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_014220	ATTA	2	8	594853	594860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_014220	AGCA	2	8	594921	594928	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1630	NC_014220	AAGG	2	8	594934	594941	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_014220	AG	3	6	595046	595051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_014220	AGGT	2	8	595102	595109	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_014220	GCAT	2	8	595115	595122	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1634	NC_014220	G	7	7	595192	595198	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_014220	TGCA	2	8	595293	595300	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1637	NC_014220	CCA	2	6	596627	596632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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