MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 6723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014220	TCCTT	2	10	314596	314605	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1002	NC_014220	A	6	6	314639	314644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_014220	TC	3	6	315609	315614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_014220	ACG	2	6	315659	315664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_014220	CTT	2	6	315728	315733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_014220	ATT	2	6	315749	315754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_014220	TTTA	2	8	315786	315793	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_014220	AT	3	6	315833	315838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_014220	GAT	2	6	315846	315851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_014220	GTGTT	2	10	315967	315976	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_014220	GAGG	2	8	316047	316054	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_014220	GAT	2	6	316067	316072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_014220	GCT	2	6	316088	316093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_014220	TCA	2	6	316131	316136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_014220	AGG	2	6	316141	316146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_014220	GAA	2	6	317521	317526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_014220	GAGGT	2	10	318159	318168	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_014220	T	7	7	319444	319450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_014220	TGA	2	6	319466	319471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_014220	GGT	2	6	319479	319484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_014220	ATA	2	6	319489	319494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_014220	GTA	2	6	319496	319501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_014220	ACC	2	6	319507	319512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_014220	T	6	6	321269	321274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_014220	T	7	7	321416	321422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_014220	TAG	2	6	321427	321432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_014220	AGG	2	6	321458	321463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_014220	CCTG	2	8	324658	324665	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_014220	GTGC	2	8	324792	324799	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_014220	AAG	2	6	324880	324885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_014220	CTTT	2	8	324936	324943	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_014220	T	6	6	324958	324963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_014220	TGCG	2	8	325034	325041	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_014220	AAGC	2	8	325199	325206	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_014220	T	7	7	325236	325242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_014220	A	6	6	325424	325429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_014220	AGT	2	6	325472	325477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_014220	AATT	2	8	325488	325495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_014220	GGC	2	6	328732	328737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_014220	GCC	2	6	328749	328754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_014220	GAG	2	6	328796	328801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_014220	GGA	2	6	329402	329407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_014220	GC	3	6	330363	330368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_014220	GAG	2	6	330372	330377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_014220	TCG	2	6	331548	331553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_014220	GAG	2	6	331555	331560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_014220	GCG	2	6	331588	331593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_014220	GCG	2	6	331677	331682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_014220	CAG	2	6	331695	331700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_014220	AGT	2	6	333136	333141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_014220	GTA	2	6	334273	334278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_014220	GTGC	2	8	334468	334475	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_014220	CGT	2	6	334537	334542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_014220	CTT	2	6	334609	334614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_014220	T	6	6	334630	334635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_014220	GTTTG	2	10	334643	334652	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_014220	GAT	2	6	334678	334683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_014220	GTA	2	6	334714	334719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_014220	GAGG	2	8	334731	334738	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_014220	ATG	2	6	337592	337597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_014220	ATT	2	6	343004	343009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_014220	GGAG	2	8	343804	343811	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_014220	TATT	2	8	344664	344671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_014220	ATA	2	6	344676	344681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_014220	GTGCCA	2	12	345624	345635	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_014220	AG	3	6	345639	345644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_014220	GCC	2	6	345663	345668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_014220	TTG	2	6	345672	345677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_014220	CAG	2	6	345797	345802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_014220	ATG	2	6	346332	346337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_014220	TG	3	6	346412	346417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_014220	AGG	2	6	346441	346446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_014220	CA	3	6	350189	350194	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_014220	CCA	2	6	350348	350353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_014220	CTC	2	6	351368	351373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_014220	CAG	2	6	351425	351430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_014220	ATA	2	6	351496	351501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_014220	TC	3	6	351506	351511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_014220	AGCC	2	8	351590	351597	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_014220	AAG	2	6	351706	351711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_014220	GAA	2	6	351731	351736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_014220	A	6	6	351735	351740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_014220	GGA	2	6	355074	355079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_014220	GAA	2	6	355106	355111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_014220	CTT	2	6	355127	355132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_014220	CAG	2	6	355167	355172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_014220	ATT	2	6	355174	355179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_014220	CCAT	2	8	355219	355226	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_014220	CCT	2	6	355240	355245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_014220	GCA	2	6	355310	355315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1092	NC_014220	A	7	7	356246	356252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_014220	AGG	2	6	356454	356459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1095	NC_014220	AAT	2	6	356845	356850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_014220	TGC	2	6	356907	356912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_014220	AAT	2	6	356975	356980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_014220	AAC	2	6	357004	357009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_014220	ATA	2	6	357022	357027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_014220	AAT	2	6	357053	357058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_014220	GT	3	6	357067	357072	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_014220	TG	3	6	357127	357132	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_014220	A	6	6	358432	358437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_014220	GGA	2	6	358579	358584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_014220	GAAT	2	8	359616	359623	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_014220	ATA	2	6	359639	359644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_014220	GA	3	6	359665	359670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_014220	GAG	2	6	360351	360356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_014220	AGG	2	6	360379	360384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_014220	AGA	2	6	361439	361444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_014220	GAGG	2	8	361465	361472	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_014220	TCG	2	6	364229	364234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_014220	ACA	3	9	364244	364252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_014220	TGG	2	6	364611	364616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_014220	GGTT	2	8	366403	366410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_014220	CTT	2	6	366418	366423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_014220	TGG	2	6	366447	366452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_014220	ATT	2	6	369010	369015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_014220	ATT	2	6	369060	369065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_014220	ATA	2	6	369093	369098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_014220	TA	3	6	369138	369143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_014220	T	6	6	369174	369179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_014220	GCA	2	6	369255	369260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_014220	TG	3	6	369322	369327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_014220	AAT	2	6	370840	370845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_014220	T	6	6	370898	370903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_014220	TTG	2	6	370917	370922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_014220	GTG	2	6	371019	371024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_014220	TGA	2	6	371038	371043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_014220	CCG	2	6	371087	371092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_014220	CGG	2	6	371118	371123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_014220	T	7	7	371124	371130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_014220	AGAA	2	8	371209	371216	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_014220	GAG	2	6	371232	371237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_014220	TGG	2	6	371240	371245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_014220	CCTAA	2	10	372132	372141	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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1139	NC_014220	A	6	6	376594	376599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1142	NC_014220	G	6	6	378462	378467	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_014220	AGG	2	6	379330	379335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1145	NC_014220	AGG	2	6	380171	380176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1146	NC_014220	TTC	2	6	382184	382189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1147	NC_014220	TCC	2	6	383336	383341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1152	NC_014220	GAA	2	6	383480	383485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1155	NC_014220	GAC	2	6	383631	383636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1159	NC_014220	CTT	2	6	384517	384522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1256	NC_014220	TGA	2	6	435330	435335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1408	NC_014220	CAA	2	6	503819	503824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1411	NC_014220	CTC	2	6	503892	503897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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