MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 6723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014220	A	7	7	106807	106813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_014220	T	7	7	106845	106851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_014220	CA	3	6	107519	107524	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
504	NC_014220	TTA	2	6	107719	107724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_014220	GGGA	2	8	111634	111641	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
506	NC_014220	AGG	2	6	112649	112654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_014220	GGGTT	2	10	113289	113298	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
508	NC_014220	TTA	2	6	113753	113758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_014220	TAA	2	6	113805	113810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_014220	CAA	2	6	113901	113906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_014220	TGT	2	6	117244	117249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_014220	GCT	2	6	117289	117294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_014220	TA	3	6	117331	117336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_014220	AAG	2	6	117374	117379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_014220	TGC	2	6	118002	118007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_014220	GTT	2	6	118020	118025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_014220	T	8	8	118081	118088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_014220	GAG	2	6	118130	118135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_014220	CTG	2	6	119710	119715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_014220	GAA	2	6	119787	119792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_014220	GGA	2	6	119798	119803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_014220	GAA	2	6	120597	120602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_014220	AGG	2	6	120648	120653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_014220	T	6	6	121218	121223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_014220	GAG	2	6	121295	121300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_014220	A	7	7	122068	122074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_014220	T	6	6	122075	122080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_014220	GGA	2	6	122086	122091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_014220	TCC	2	6	122098	122103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_014220	ATG	2	6	122111	122116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_014220	TAAT	2	8	122128	122135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_014220	A	6	6	122153	122158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_014220	G	6	6	122781	122786	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
534	NC_014220	AT	3	6	122789	122794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_014220	T	6	6	123226	123231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_014220	GGT	2	6	123239	123244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_014220	TTC	2	6	126661	126666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_014220	TTAG	2	8	126671	126678	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
539	NC_014220	TGA	2	6	126703	126708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_014220	GAA	2	6	126732	126737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_014220	GTG	2	6	126756	126761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_014220	CGC	2	6	126763	126768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_014220	ACT	2	6	126783	126788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_014220	ATT	2	6	126798	126803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_014220	TCC	2	6	126911	126916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_014220	ATCA	2	8	126962	126969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
547	NC_014220	A	6	6	127315	127320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_014220	CTC	2	6	127392	127397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_014220	TCG	2	6	127445	127450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_014220	TA	3	6	127457	127462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_014220	CTT	2	6	127465	127470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_014220	AAT	2	6	127512	127517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_014220	CGA	2	6	127529	127534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_014220	CCG	2	6	127583	127588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_014220	G	6	6	127608	127613	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
556	NC_014220	TTAC	2	8	127656	127663	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
557	NC_014220	GAA	3	9	127668	127676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_014220	AGG	2	6	127700	127705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_014220	AGG	2	6	128185	128190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_014220	AGGA	2	8	129436	129443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
561	NC_014220	CAC	2	6	131205	131210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_014220	T	9	9	131220	131228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_014220	AGC	2	6	131281	131286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_014220	CAG	2	6	131428	131433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_014220	AAC	2	6	131447	131452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_014220	AATA	2	8	131474	131481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_014220	CAGGG	2	10	131603	131612	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
568	NC_014220	GTG	2	6	134260	134265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_014220	ATA	2	6	134378	134383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_014220	TTC	2	6	135830	135835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_014220	GAGGG	2	10	135840	135849	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
572	NC_014220	AGG	2	6	137697	137702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_014220	TGA	2	6	138178	138183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_014220	AG	3	6	138380	138385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_014220	GAG	2	6	138403	138408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_014220	GAGC	2	8	138414	138421	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
577	NC_014220	TGG	2	6	138519	138524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_014220	CATAT	2	10	140250	140259	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
579	NC_014220	ACA	2	6	140268	140273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_014220	GTG	2	6	140845	140850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_014220	AGGG	2	8	142144	142151	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
582	NC_014220	TCAA	2	8	147153	147160	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
583	NC_014220	GTT	2	6	147172	147177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_014220	TTA	2	6	148810	148815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_014220	TGG	2	6	148955	148960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_014220	AAC	2	6	151624	151629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_014220	GAATT	2	10	153542	153551	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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590	NC_014220	TAT	2	6	153612	153617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_014220	AT	3	6	153616	153621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_014220	AAG	2	6	153675	153680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_014220	TGA	2	6	153690	153695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_014220	GA	3	6	153850	153855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
595	NC_014220	GAGG	2	8	154505	154512	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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597	NC_014220	AAG	2	6	156567	156572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_014220	G	9	9	158603	158611	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
599	NC_014220	CAGAC	2	10	158646	158655	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
600	NC_014220	TGAGT	2	10	158813	158822	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
601	NC_014220	CCCCT	2	10	160759	160768	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
602	NC_014220	CA	3	6	160788	160793	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_014220	CAC	2	6	160818	160823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_014220	GGA	2	6	160846	160851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_014220	AC	3	6	160891	160896	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
606	NC_014220	AGG	2	6	160932	160937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_014220	AGC	2	6	160943	160948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_014220	AG	3	6	161000	161005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_014220	GAG	2	6	161022	161027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_014220	GAGC	2	8	161033	161040	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
611	NC_014220	CTC	2	6	161050	161055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_014220	CTT	2	6	163845	163850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_014220	CA	3	6	163866	163871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
614	NC_014220	GAT	2	6	163882	163887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_014220	TAG	2	6	163898	163903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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617	NC_014220	A	6	6	163955	163960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_014220	AGC	2	6	164023	164028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_014220	CAC	2	6	167062	167067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_014220	TACATA	2	12	167078	167089	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
621	NC_014220	G	6	6	167141	167146	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
622	NC_014220	GAA	2	6	167210	167215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_014220	CTC	2	6	167460	167465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_014220	CCTG	2	8	167475	167482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
625	NC_014220	ATT	3	9	167490	167498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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627	NC_014220	TAG	2	6	167544	167549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_014220	ATG	2	6	167611	167616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_014220	TCG	2	6	167631	167636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_014220	ACC	2	6	167658	167663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_014220	GGT	2	6	167670	167675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
632	NC_014220	CA	3	6	167681	167686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
633	NC_014220	AGAA	2	8	167738	167745	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
634	NC_014220	TTTA	2	8	168828	168835	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_014220	A	6	6	168845	168850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_014220	ATA	2	6	172323	172328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_014220	AGGA	2	8	172336	172343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
638	NC_014220	CCG	2	6	172397	172402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_014220	ATG	2	6	172467	172472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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641	NC_014220	GTT	2	6	179037	179042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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772	NC_014220	TTCAG	2	10	219266	219275	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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779	NC_014220	GTC	2	6	224817	224822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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781	NC_014220	AAG	2	6	224973	224978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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917	NC_014220	ATT	2	6	286377	286382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
918	NC_014220	AGA	2	6	286387	286392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
919	NC_014220	GGT	2	6	286396	286401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
920	NC_014220	AGA	2	6	286422	286427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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926	NC_014220	TTG	2	6	286653	286658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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932	NC_014220	TGG	2	6	290094	290099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
933	NC_014220	T	6	6	290151	290156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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939	NC_014220	GTTC	2	8	292214	292221	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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941	NC_014220	AT	3	6	293163	293168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
942	NC_014220	GGC	2	6	293188	293193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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950	NC_014220	CCT	2	6	298431	298436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
951	NC_014220	TAT	2	6	298491	298496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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955	NC_014220	TAA	2	6	299809	299814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
956	NC_014220	ATC	2	6	299858	299863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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958	NC_014220	ATA	2	6	303780	303785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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961	NC_014220	GCCT	2	8	303902	303909	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
962	NC_014220	GTT	2	6	303970	303975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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967	NC_014220	TG	3	6	309908	309913	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
968	NC_014220	GCCT	2	8	310573	310580	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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