MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 6723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_014220	CCT	2	6	2305356	2305361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6502	NC_014220	CTA	2	6	2305378	2305383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6503	NC_014220	CAC	2	6	2308301	2308306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6504	NC_014220	TTGAG	2	10	2310995	2311004	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_014220	TTA	2	6	2311019	2311024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_014220	ATT	2	6	2311107	2311112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_014220	C	6	6	2311356	2311361	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6508	NC_014220	CAT	2	6	2311377	2311382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_014220	T	6	6	2311398	2311403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_014220	TCT	2	6	2312096	2312101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_014220	C	7	7	2312102	2312108	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6512	NC_014220	CA	3	6	2312918	2312923	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6513	NC_014220	A	8	8	2312971	2312978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_014220	CCTCA	2	10	2315595	2315604	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6515	NC_014220	T	6	6	2315610	2315615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_014220	TCC	2	6	2315635	2315640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6517	NC_014220	A	6	6	2315652	2315657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_014220	CTTT	2	8	2316836	2316843	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6519	NC_014220	TCC	2	6	2319796	2319801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6520	NC_014220	AATA	2	8	2320734	2320741	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_014220	GAT	2	6	2320822	2320827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_014220	TCC	2	6	2321054	2321059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6523	NC_014220	GTA	2	6	2321410	2321415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_014220	TGT	2	6	2321454	2321459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_014220	TCA	2	6	2321482	2321487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6526	NC_014220	TTAT	2	8	2322816	2322823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_014220	CCA	2	6	2322887	2322892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6528	NC_014220	CTT	2	6	2322900	2322905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_014220	CAA	2	6	2322919	2322924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6530	NC_014220	TG	3	6	2322955	2322960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_014220	TGA	2	6	2323003	2323008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_014220	GGA	2	6	2323014	2323019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_014220	GCCT	2	8	2323022	2323029	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6534	NC_014220	TCA	2	6	2323045	2323050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6535	NC_014220	A	8	8	2323130	2323137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_014220	CGGC	2	8	2323154	2323161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6537	NC_014220	GAA	2	6	2324044	2324049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_014220	A	7	7	2324048	2324054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_014220	TCC	2	6	2325380	2325385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6540	NC_014220	TAA	2	6	2325405	2325410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_014220	CAC	2	6	2325436	2325441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6542	NC_014220	CCA	2	6	2325450	2325455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6543	NC_014220	CAC	2	6	2325493	2325498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6544	NC_014220	AAT	2	6	2325576	2325581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_014220	GCC	2	6	2325593	2325598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6546	NC_014220	AAC	2	6	2325632	2325637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6547	NC_014220	TC	3	6	2325651	2325656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6548	NC_014220	CAG	2	6	2325663	2325668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_014220	GAA	2	6	2325735	2325740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_014220	CAG	2	6	2325814	2325819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6551	NC_014220	ACA	2	6	2325862	2325867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6552	NC_014220	TCCC	2	8	2326877	2326884	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6553	NC_014220	CTTT	2	8	2327559	2327566	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6554	NC_014220	CAG	2	6	2327575	2327580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_014220	CAA	2	6	2327593	2327598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6556	NC_014220	CTC	2	6	2327601	2327606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6557	NC_014220	CT	3	6	2328506	2328511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6558	NC_014220	TCC	2	6	2328933	2328938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6559	NC_014220	TA	3	6	2328997	2329002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_014220	TCC	2	6	2329624	2329629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6561	NC_014220	C	6	6	2329628	2329633	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6562	NC_014220	CT	3	6	2332897	2332902	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6563	NC_014220	TATGA	2	10	2332973	2332982	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_014220	T	7	7	2334613	2334619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_014220	CT	3	6	2334631	2334636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6566	NC_014220	TCC	2	6	2334641	2334646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6567	NC_014220	AAGC	2	8	2334655	2334662	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6568	NC_014220	ATT	2	6	2337258	2337263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_014220	TA	3	6	2337287	2337292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_014220	GTT	2	6	2339318	2339323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_014220	CTGTTT	2	12	2349011	2349022	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6572	NC_014220	CTAA	2	8	2349025	2349032	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6573	NC_014220	GCT	2	6	2349057	2349062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6574	NC_014220	TCC	2	6	2349352	2349357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6575	NC_014220	TCC	2	6	2351071	2351076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6576	NC_014220	AGTT	2	8	2351083	2351090	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_014220	ACC	2	6	2351626	2351631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6578	NC_014220	TTA	2	6	2351710	2351715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_014220	TGA	2	6	2351735	2351740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_014220	AT	3	6	2351751	2351756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_014220	GGAG	2	8	2351794	2351801	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_014220	AGA	2	6	2351817	2351822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_014220	TCT	2	6	2351913	2351918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6584	NC_014220	CAG	2	6	2351960	2351965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6585	NC_014220	AAG	2	6	2352006	2352011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_014220	CT	3	6	2354189	2354194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6587	NC_014220	TCC	3	9	2354195	2354203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6588	NC_014220	TAC	2	6	2354220	2354225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6589	NC_014220	AG	3	6	2354237	2354242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_014220	TA	3	6	2354285	2354290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_014220	ACC	2	6	2354326	2354331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6592	NC_014220	TCC	2	6	2355399	2355404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6593	NC_014220	GAA	2	6	2355443	2355448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_014220	GTAC	2	8	2356836	2356843	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6595	NC_014220	GTT	2	6	2356859	2356864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_014220	CTT	2	6	2356874	2356879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6597	NC_014220	CAT	2	6	2358314	2358319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6598	NC_014220	CCGAA	2	10	2358320	2358329	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6599	NC_014220	AAAC	2	8	2358378	2358385	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6600	NC_014220	AC	3	6	2358494	2358499	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6601	NC_014220	GC	3	6	2358522	2358527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6602	NC_014220	GCC	2	6	2358704	2358709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6603	NC_014220	TTA	2	6	2358720	2358725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_014220	CGCA	2	8	2358800	2358807	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6605	NC_014220	TTTTA	2	10	2358809	2358818	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_014220	CAAC	2	8	2358823	2358830	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6607	NC_014220	AGAC	2	8	2358953	2358960	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6608	NC_014220	AGA	2	6	2358983	2358988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_014220	TTA	2	6	2359000	2359005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_014220	GTA	2	6	2360379	2360384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_014220	AGA	2	6	2360410	2360415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_014220	CCT	2	6	2362702	2362707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6613	NC_014220	ATT	2	6	2362709	2362714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_014220	TTA	2	6	2362732	2362737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_014220	TAAT	2	8	2362805	2362812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_014220	A	7	7	2362863	2362869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_014220	TCG	2	6	2362872	2362877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6618	NC_014220	GTT	2	6	2362882	2362887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_014220	TCA	2	6	2362910	2362915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6620	NC_014220	GCC	2	6	2362952	2362957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6621	NC_014220	CT	3	6	2363015	2363020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6622	NC_014220	ATG	2	6	2363092	2363097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_014220	AGCA	2	8	2363109	2363116	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6624	NC_014220	ACC	2	6	2363161	2363166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6625	NC_014220	CAT	2	6	2363202	2363207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6626	NC_014220	TCT	2	6	2363214	2363219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6627	NC_014220	TAT	2	6	2363253	2363258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_014220	GCA	2	6	2363302	2363307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6629	NC_014220	GCTTT	2	10	2363335	2363344	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6630	NC_014220	TGG	2	6	2363489	2363494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6631	NC_014220	CTT	2	6	2363519	2363524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6632	NC_014220	GAAG	2	8	2363531	2363538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6633	NC_014220	ATC	2	6	2363569	2363574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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